MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168-L

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021283	TAATTT	2	12	7767	7778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021283	TTTTCA	2	12	24500	24511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021283	AAAATT	2	12	53508	53519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021283	TAAAAA	2	12	60536	60547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021283	TTTTAA	2	12	109435	109446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021283	TAAATT	2	12	111088	111099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021283	TCATAA	2	12	116718	116729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021283	ATTTTT	3	18	117227	117244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021283	TAATTT	2	12	119754	119765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021283	TATAAT	2	12	132802	132813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021283	ATTTTT	2	12	140711	140722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021283	TGAATA	2	12	156449	156460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021283	CAAATA	2	12	168355	168366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021283	AATTTT	2	12	172474	172485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021283	TATAAT	2	12	173957	173968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021283	AAAATT	2	12	196271	196282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021283	GATCTT	2	12	199296	199307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021283	ATTATA	2	12	199580	199591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021283	GTTTTT	2	12	199731	199742	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021283	ATTATA	2	12	201949	201960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021283	ATTTTC	3	18	208471	208488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021283	TTTAAA	2	12	210299	210310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021283	CATATT	2	12	214287	214298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021283	AAATTA	2	12	224413	224424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021283	TTTAAT	2	12	237979	237990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021283	TAAAAA	2	12	239302	239313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021283	ATTTTT	2	12	239332	239343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021283	TAAATA	2	12	239620	239631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021283	AATAAA	2	12	254032	254043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021283	TATAAA	2	12	260086	260097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021283	CAAAAA	2	12	262469	262480	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021283	TGATAA	2	12	273457	273468	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021283	TAAAAA	2	12	276721	276732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021283	AAATAA	2	12	282300	282311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021283	TTTATA	2	12	282313	282324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021283	TTTTAA	2	12	300484	300495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021283	CATATT	2	12	309548	309559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021283	TTAAGT	2	12	319427	319438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021283	ATACAA	2	12	319757	319768	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021283	TTATAA	2	12	325138	325149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021283	TTATAA	2	12	339558	339569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021283	AACTTC	2	12	340270	340281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021283	TATTTT	2	12	343835	343846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021283	TTTATT	2	12	347271	347282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021283	ATGAAA	2	12	350342	350353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021283	AATTTT	2	12	361530	361541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021283	AATTTA	2	12	368992	369003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021283	TGAAGT	2	12	370927	370938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021283	GATAAA	2	12	371027	371038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021283	TGAATA	2	12	372143	372154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021283	CATATT	2	12	418604	418615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021283	TTATAA	2	12	433053	433064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021283	TCAAGA	2	12	436934	436945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021283	TATAAA	2	12	442419	442430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021283	TTAATT	2	12	448451	448462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021283	AAATTT	2	12	450249	450260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021283	TATAAT	2	12	454219	454230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021283	TCTTGA	2	12	460501	460512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021283	TTTTTC	2	12	461605	461616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021283	TCTTGG	2	12	466669	466680	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021283	CATATT	2	12	484843	484854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021283	AAATTT	2	12	484898	484909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021283	TTAAAT	2	12	486960	486971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021283	TTATGA	2	12	488527	488538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021283	ATTTTT	2	12	495595	495606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021283	TTAAAT	2	12	495803	495814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021283	TGAATA	2	12	502827	502838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021283	TTTTTA	2	12	512618	512629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021283	AATATT	2	12	515735	515746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021283	TGAATA	2	12	522971	522982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021283	TTTTAA	2	12	524948	524959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021283	TTATTT	2	12	524961	524972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021283	TTATAT	2	12	535610	535621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021283	TTTTGA	2	12	538009	538020	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021283	CAAATT	2	12	538420	538431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021283	GTTTTT	2	12	557349	557360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021283	TGTTTT	2	12	558125	558136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021283	GTTTTT	2	12	558245	558256	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021283	GATTTT	2	12	558731	558742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021283	CAAAAA	2	12	560955	560966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021283	TTAACT	2	12	574183	574194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021283	TCTATA	2	12	575628	575639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021283	GACAAA	2	12	577332	577343	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021283	ATTTTA	2	12	578771	578782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021283	ATTTTA	2	12	579370	579381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021283	TTTAAT	2	12	579762	579773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021283	CTTGCC	2	12	580598	580609	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021283	TGTATT	2	12	581967	581978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021283	TCTTTT	2	12	582409	582420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021283	AATCTT	2	12	582609	582620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021283	AAAGAA	2	12	583403	583414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021283	CAAAAC	2	12	602676	602687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021283	ATTTTT	2	12	603479	603490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021283	AAATAA	2	12	638416	638427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021283	TTTAAA	2	12	639853	639864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021283	TGAATT	2	12	643768	643779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021283	TTTATA	2	12	666890	666901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021283	TAAAAA	2	12	667216	667227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021283	ATTTTT	2	12	667588	667599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021283	AGTTTT	2	12	667609	667620	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021283	GTTTTT	2	12	670695	670706	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021283	ATTTTT	2	12	699597	699608	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021283	ATATTT	2	12	700446	700457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021283	CATATT	2	12	744913	744924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021283	TTTTTA	2	12	747387	747398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021283	TTAAAA	2	12	752487	752498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021283	AAATAA	2	12	764963	764974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021283	TCGACT	2	12	781630	781641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021283	TTTAAT	2	12	782659	782670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021283	TTTAGG	2	12	795135	795146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021283	GAAAAA	2	12	796310	796321	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021283	AAACTA	2	12	818594	818605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021283	TATAAT	2	12	820540	820551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021283	ATTTAT	2	12	820693	820704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021283	ATTACA	2	12	827435	827446	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021283	ATTTTT	2	12	841160	841171	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021283	TATAAT	2	12	841184	841195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021283	TTATAA	2	12	842700	842711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021283	TTAAAA	2	12	853326	853337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021283	TTATAA	2	12	863283	863294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021283	ATTTTA	2	12	871365	871376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021283	ATTTAA	2	12	889656	889667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021283	TATTAG	2	12	901192	901203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021283	AGAATA	2	12	904465	904476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.