MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168-L

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021283	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021283	AATAA	2	10	8888	8897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021283	AGATC	2	10	14667	14676	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021283	AATTA	2	10	23803	23812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021283	ATATT	2	10	23975	23984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021283	GTTTT	2	10	24326	24335	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021283	TAAAA	2	10	24409	24418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021283	AATTA	2	10	24718	24727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021283	TTATT	2	10	24771	24780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021283	TAAAT	2	10	38254	38263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021283	TAATT	2	10	59454	59463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021283	AATTA	2	10	89663	89672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021283	TTTTC	2	10	89853	89862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021283	TTTAT	2	10	92909	92918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021283	TTTAA	2	10	94427	94436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021283	TTTTA	2	10	96092	96101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021283	TAAAA	2	10	96137	96146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021283	TATAA	2	10	99833	99842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021283	TTTAA	2	10	103644	103653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021283	AATTT	2	10	104229	104238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021283	TTTTA	2	10	111290	111299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021283	ATAAA	2	10	117250	117259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021283	AGGTA	2	10	119816	119825	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021283	TAAAA	2	10	120855	120864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021283	TTTAA	2	10	131495	131504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021283	GATTT	2	10	132331	132340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021283	ATTTA	2	10	132743	132752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021283	ATATA	2	10	139495	139504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021283	TATAA	2	10	140525	140534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021283	CAACT	2	10	140843	140852	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021283	AAAGA	2	10	143041	143050	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021283	AATTT	2	10	152059	152068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021283	TTTTA	2	10	156283	156292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021283	TTTTA	2	10	168109	168118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021283	TTTAT	2	10	168172	168181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021283	ATTTT	2	10	168455	168464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021283	AATTA	2	10	168504	168513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021283	AAATT	2	10	168526	168535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021283	AATTT	2	10	173899	173908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021283	TATAA	2	10	174074	174083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021283	GTTTT	2	10	182482	182491	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021283	ATTTT	2	10	185556	185565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021283	TAAAA	2	10	189809	189818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021283	TATAA	2	10	196162	196171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021283	AAATT	2	10	197626	197635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021283	CAATC	2	10	199156	199165	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021283	ATTTT	2	10	199313	199322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021283	TAATT	2	10	199331	199340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021283	TTTTC	2	10	199401	199410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021283	AAGAA	2	10	199450	199459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021283	TTTAA	2	10	202158	202167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021283	TTTAA	2	10	202175	202184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021283	AATTT	2	10	208364	208373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021283	TATTT	2	10	208910	208919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021283	ATTTA	2	10	214439	214448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021283	TATTT	2	10	230395	230404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021283	AGATA	2	10	253913	253922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021283	TAAAA	2	10	262441	262450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021283	ATTTA	3	15	265716	265730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021283	TAAAC	2	10	272065	272074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021283	CATAT	2	10	284111	284120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021283	AATCA	2	10	293355	293364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021283	CAAGA	2	10	293422	293431	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021283	GAAAA	2	10	307272	307281	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021283	ATTTT	2	10	307594	307603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021283	TTTAT	2	10	309619	309628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021283	TAATT	2	10	319502	319511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021283	ATTTA	3	15	322283	322297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021283	ATAAA	2	10	339537	339546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021283	CAAAG	2	10	340744	340753	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021283	TAAAA	2	10	350646	350655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021283	TTTAA	2	10	355049	355058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021283	ATTTA	2	10	361468	361477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021283	TTATA	2	10	367299	367308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021283	ACTTA	2	10	370334	370343	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021283	TATGA	2	10	371307	371316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021283	ATTTT	2	10	372058	372067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021283	TAAAA	2	10	372068	372077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021283	TCAAA	2	10	372698	372707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021283	ATTTT	2	10	372826	372835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021283	TAAAT	2	10	377248	377257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021283	TAATT	2	10	377441	377450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021283	TAGTA	2	10	377534	377543	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021283	ATTTT	2	10	382009	382018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021283	TAATT	2	10	401322	401331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021283	AGTTA	2	10	406197	406206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021283	AAATA	2	10	406805	406814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021283	TAAGT	2	10	407659	407668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021283	ATAAA	2	10	408984	408993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021283	GAAAA	2	10	409431	409440	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021283	TAATT	2	10	421089	421098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021283	TAATT	3	15	422268	422282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021283	TTATT	2	10	424148	424157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021283	ACAAA	2	10	425191	425200	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021283	AATTA	2	10	425209	425218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021283	TAATT	2	10	429905	429914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021283	AATTA	2	10	430993	431002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021283	TTAAT	2	10	431967	431976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021283	CAAGC	2	10	434882	434891	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021283	TTTAA	2	10	436550	436559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021283	TTCTT	2	10	436579	436588	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021283	AAATT	2	10	436593	436602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021283	AAACT	2	10	436692	436701	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021283	TATAA	2	10	436723	436732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021283	ATTAT	2	10	442295	442304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021283	TAAAT	2	10	442307	442316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021283	TTTAA	2	10	443160	443169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021283	TTTCT	2	10	444977	444986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021283	TAATT	2	10	445055	445064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021283	TTAAT	2	10	445822	445831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021283	ATTTT	2	10	447983	447992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021283	AGAAA	2	10	448709	448718	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021283	ATAGG	2	10	449746	449755	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021283	TATTT	2	10	451672	451681	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021283	TATAA	2	10	454308	454317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021283	ATTTT	2	10	454339	454348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021283	TTAAA	2	10	460195	460204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021283	TAAAA	2	10	460808	460817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021283	TTTTC	2	10	461414	461423	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021283	TAAAA	2	10	461824	461833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021283	AAATT	2	10	461894	461903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021283	ATTTT	2	10	463558	463567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021283	TAGTT	2	10	470214	470223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021283	TAGTT	2	10	488882	488891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021283	ATTAA	2	10	496008	496017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021283	TAGAA	2	10	497580	497589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021283	TTAAT	2	10	497738	497747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021283	TATAA	2	10	500419	500428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021283	TTTAA	2	10	500525	500534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021283	TAAAA	2	10	502720	502729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021283	AAATT	2	10	512693	512702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021283	ATTTC	2	10	515754	515763	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021283	AAACA	2	10	530812	530821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021283	CCAAA	2	10	537631	537640	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_021283	TATAA	2	10	538338	538347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021283	ATTAA	2	10	538396	538405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021283	AAATT	2	10	548326	548335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021283	TTAAA	2	10	560903	560912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021283	GTTTT	2	10	573191	573200	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021283	ATTTC	2	10	573378	573387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021283	GATTT	2	10	573845	573854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021283	ATTTG	2	10	574199	574208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021283	TTCAA	2	10	574697	574706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021283	TTTGG	2	10	574961	574970	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021283	TTATC	2	10	575855	575864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021283	GGAAT	2	10	575879	575888	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021283	TTTTA	2	10	576447	576456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021283	ATTTT	2	10	578149	578158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021283	CCTGT	2	10	578294	578303	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_021283	TTAAA	2	10	658250	658259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_021283	TAAAT	2	10	670745	670754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021283	AAAAT	2	10	677250	677259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021283	TTATT	2	10	677833	677842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021283	ATTTA	2	10	682362	682371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021283	TATTT	2	10	684244	684253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021283	AAAAT	2	10	685014	685023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021283	ATTTA	2	10	685226	685235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_021283	TAAAA	2	10	687760	687769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_021283	ATAAA	2	10	720157	720166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021283	ATTAT	2	10	720394	720403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021283	TAAAA	2	10	729963	729972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021283	AAATT	2	10	739080	739089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021283	ATATT	2	10	739206	739215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021283	ATCAA	2	10	740272	740281	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_021283	AAATT	2	10	743007	743016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_021283	AATTC	2	10	765955	765964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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221	NC_021283	TAACA	2	10	879376	879385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_021283	AATTA	2	10	899277	899286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_021283	TTTTC	2	10	903850	903859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
232	NC_021283	TGTTT	2	10	904550	904559	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021283	CACGA	2	10	905035	905044	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
234	NC_021283	AAACA	2	10	921038	921047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.