MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168-L

Total Repeats: 460

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021283	TAAA	2	8	1491	1498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021283	CTTT	2	8	7916	7923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021283	CAAA	2	8	7927	7934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021283	TAAA	2	8	8926	8933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021283	ATTT	2	8	8951	8958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021283	TAAT	2	8	16895	16902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021283	ATTA	2	8	17447	17454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021283	ACCA	2	8	17467	17474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021283	TTAA	2	8	19920	19927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021283	ATTA	2	8	22945	22952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021283	TTGT	2	8	23145	23152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021283	TGTT	2	8	23211	23218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021283	TTAC	2	8	23555	23562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021283	GGTT	2	8	24394	24401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021283	AATT	2	8	24795	24802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021283	ATTA	2	8	25878	25885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021283	AAAT	2	8	25964	25971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021283	TTAT	2	8	26624	26631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021283	TAAG	2	8	29668	29675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021283	ATTT	2	8	29741	29748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021283	AATT	2	8	36261	36268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021283	AGTA	2	8	39439	39446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021283	AACC	2	8	40066	40073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021283	AATC	2	8	40076	40083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021283	TTAG	2	8	40114	40121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021283	ATTT	2	8	47577	47584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021283	AATC	2	8	53564	53571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021283	AATA	2	8	59475	59482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021283	AATT	2	8	60675	60682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021283	TCTT	2	8	70250	70257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021283	AAAT	2	8	80445	80452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021283	TATT	2	8	89560	89567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021283	AATT	2	8	89800	89807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021283	ATAA	2	8	94466	94473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021283	AATT	2	8	94563	94570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021283	ATTT	2	8	96193	96200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021283	ATTT	2	8	103669	103676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021283	CTAC	2	8	103825	103832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021283	AAAT	2	8	104731	104738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021283	GAAT	2	8	109621	109628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021283	TTTA	2	8	110058	110065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021283	AAAC	2	8	110159	110166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021283	ATGT	2	8	111186	111193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021283	ATTT	2	8	111276	111283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021283	TAAA	2	8	116656	116663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021283	AAAG	2	8	116778	116785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021283	AAAT	2	8	119782	119789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021283	TTAA	2	8	119792	119799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021283	GTTT	2	8	120463	120470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021283	ATTA	2	8	120517	120524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021283	CATC	2	8	120692	120699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021283	TTAA	2	8	120805	120812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021283	AAAT	2	8	131422	131429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021283	TTAA	2	8	132390	132397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021283	TTTA	2	8	132985	132992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021283	AAAC	2	8	133108	133115	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021283	TGAT	2	8	133165	133172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021283	AAAT	2	8	139470	139477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021283	ATTT	2	8	139561	139568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021283	ATTT	2	8	139708	139715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021283	TAAA	2	8	139740	139747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021283	GAGT	2	8	140781	140788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021283	GTTC	2	8	140817	140824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021283	TAAA	2	8	147909	147916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021283	TAAA	2	8	153733	153740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021283	TTCG	2	8	155971	155978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021283	ATTA	2	8	156512	156519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021283	AATT	2	8	156521	156528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021283	TTCA	2	8	162560	162567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021283	TAAA	2	8	168128	168135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021283	AAAT	2	8	168194	168201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021283	TAAA	2	8	168254	168261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021283	ATTA	2	8	168475	168482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021283	TAAT	2	8	171919	171926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021283	TAAT	2	8	177442	177449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021283	TTAA	2	8	186792	186799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021283	ATTA	2	8	189714	189721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021283	ATTA	2	8	190780	190787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021283	CTAA	2	8	190827	190834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021283	AATT	2	8	194627	194634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021283	ACAA	2	8	196243	196250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021283	AAAG	2	8	197222	197229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021283	ATTA	2	8	199652	199659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021283	TTGT	2	8	199700	199707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021283	TAAA	2	8	199893	199900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021283	TACT	2	8	200128	200135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021283	ATTA	2	8	202022	202029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021283	TTGT	2	8	202070	202077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021283	TTAA	2	8	202149	202156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021283	ACAT	2	8	202203	202210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021283	TTAT	2	8	202647	202654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021283	TTAA	2	8	205045	205052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021283	ATTA	2	8	207206	207213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021283	GCAG	2	8	208435	208442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021283	TAAT	2	8	210366	210373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021283	TAAT	2	8	214220	214227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021283	TAAT	2	8	214230	214237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021283	TTTG	2	8	214359	214366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021283	TAAA	2	8	221617	221624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021283	ATTT	2	8	238056	238063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021283	TTAA	2	8	238122	238129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021283	TAAA	2	8	253650	253657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021283	TAAT	2	8	253860	253867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021283	TAAA	2	8	253905	253912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021283	AACT	2	8	254091	254098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021283	TATT	2	8	254153	254160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021283	TAAA	2	8	254192	254199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021283	AAAT	2	8	254268	254275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021283	TAAT	2	8	263620	263627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021283	AAGG	2	8	263654	263661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021283	AAAT	2	8	271495	271502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021283	AAAT	2	8	271719	271726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021283	TTAA	2	8	271874	271881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021283	AATT	2	8	273072	273079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021283	ATTT	2	8	273099	273106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021283	AAAT	2	8	273262	273269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021283	ACTT	2	8	275394	275401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021283	TAAT	2	8	275404	275411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021283	ATTA	2	8	275412	275419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021283	AATT	2	8	277407	277414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021283	TAAA	2	8	277439	277446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021283	ATAA	2	8	281872	281879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021283	TAAT	2	8	281894	281901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021283	CAAG	2	8	293154	293161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021283	TCAA	2	8	297389	297396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021283	ATTT	2	8	298617	298624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021283	TTTC	2	8	298643	298650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021283	GGAA	2	8	300725	300732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021283	CTAA	2	8	300783	300790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021283	TAAT	2	8	309481	309488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021283	TAAT	2	8	309491	309498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021283	TGAA	2	8	319567	319574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021283	ATAA	2	8	322246	322253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021283	TTTA	21	84	322294	322377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021283	TTTA	2	8	325101	325108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021283	AATT	2	8	325160	325167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021283	TTAT	2	8	325168	325175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021283	ATTT	2	8	325182	325189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021283	ATTT	2	8	327407	327414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021283	GATA	2	8	340256	340263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021283	AATA	2	8	340298	340305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021283	TTAA	2	8	346993	347000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021283	TTAT	2	8	350354	350361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021283	AATT	3	12	350576	350587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021283	TATT	2	8	354949	354956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021283	ATTA	2	8	354996	355003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021283	ATTT	2	8	360261	360268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021283	AATT	2	8	367435	367442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021283	AGGC	2	8	367482	367489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021283	CAAA	2	8	370282	370289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021283	ATTT	2	8	370302	370309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021283	CAAT	2	8	370775	370782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021283	TATG	2	8	371389	371396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_021283	TCTT	2	8	904153	904160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
452	NC_021283	TAAA	2	8	904394	904401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021283	AACT	2	8	905849	905856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_021283	AGGT	2	8	905974	905981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_021283	CATG	2	8	906045	906052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_021283	ACTA	2	8	906258	906265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_021283	ATAA	2	8	906349	906356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_021283	ATTA	2	8	906457	906464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_021283	GATT	2	8	918488	918495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
460	NC_021283	TAAA	2	8	920993	921000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.