MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021282	GCAAAT	2	12	125043	125054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021282	GCCGAC	2	12	179056	179067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021282	CGATGA	2	12	224513	224524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021282	GAGTCT	2	12	232263	232274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021282	TACGGT	2	12	243425	243436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021282	GACCCC	2	12	248963	248974	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021282	GCTCGG	2	12	285070	285081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021282	CTCGGC	2	12	285938	285949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021282	GTCAGG	2	12	291220	291231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021282	GGTGTG	2	12	294726	294737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021282	CCGCCA	2	12	306252	306263	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021282	TTGTCC	2	12	436194	436205	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021282	CGACCG	2	12	450210	450221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021282	GGGCGC	2	12	452607	452618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021282	GCCCGC	2	12	642984	642995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021282	CAATGG	2	12	644121	644132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021282	CGGCTC	2	12	668190	668201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021282	CTGATT	2	12	687770	687781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021282	GGGCGC	2	12	735813	735824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021282	CCGTCG	2	12	765705	765716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021282	TATCTG	2	12	770449	770460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021282	TAATGA	2	12	859005	859016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021282	CCTCAC	2	12	948526	948537	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021282	TATCGA	2	12	993961	993972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021282	CTGGGT	2	12	1016725	1016736	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021282	CGACCC	2	12	1057538	1057549	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021282	CGCCCG	2	12	1067050	1067061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021282	AAACGT	2	12	1073140	1073151	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021282	ATGATA	2	12	1080850	1080861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021282	TAGACG	2	12	1125131	1125142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021282	TGCTTT	2	12	1136894	1136905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021282	GACGCC	2	12	1139637	1139648	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021282	AACCTG	2	12	1143060	1143071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021282	ATGGTT	2	12	1258157	1258168	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021282	GCCGCG	2	12	1281299	1281310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021282	GCAGAA	2	12	1300214	1300225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021282	GTAACT	2	12	1355956	1355967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021282	AGTGCA	2	12	1490083	1490094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021282	GCTTGG	2	12	1582895	1582906	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021282	TTCATT	2	12	1583123	1583134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021282	CATCTA	2	12	1590295	1590306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021282	GCATCG	2	12	1605606	1605617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021282	CGTGAT	2	12	1652858	1652869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021282	GTGTCG	2	12	1678857	1678868	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021282	TGACGT	2	12	1718660	1718671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021282	GGGGTG	2	12	1900403	1900414	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021282	GAGTGT	2	12	1929598	1929609	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021282	CTCGTT	2	12	2325077	2325088	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021282	GCTGTC	2	12	2364940	2364951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021282	CTTAGG	2	12	2399484	2399495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021282	GGGGAC	2	12	2420304	2420315	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021282	CAACGC	2	12	2556947	2556958	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021282	CGCCGG	2	12	2570343	2570354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021282	TGCTGA	2	12	2642133	2642144	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021282	ACCCGA	2	12	2714944	2714955	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021282	GACCGT	2	12	2847930	2847941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021282	TGACGA	2	12	2907527	2907538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021282	GCTGAC	2	12	2978009	2978020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021282	AGGACG	2	12	3020787	3020798	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021282	CCGACA	2	12	3024949	3024960	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021282	CATGCG	3	18	3130373	3130390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021282	CTGCAC	2	12	3216173	3216184	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021282	CCGAGG	2	12	3354889	3354900	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021282	AGATCC	2	12	3396160	3396171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021282	CCCCGG	2	12	3464861	3464872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021282	CCGGAG	2	12	3464887	3464898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021282	CAGCGC	2	12	3483876	3483887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021282	CGGCGA	2	12	3498363	3498374	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021282	ACCGGC	2	12	3516089	3516100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021282	TCACGG	2	12	3532053	3532064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021282	CATCAG	2	12	3569425	3569436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021282	CAGCGG	2	12	3593903	3593914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021282	CAGACA	2	12	3637969	3637980	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021282	TGACAT	2	12	3664491	3664502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021282	CACTGT	2	12	3712423	3712434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021282	GGTTTG	2	12	3893955	3893966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021282	CTCCGG	2	12	4138542	4138553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021282	GCCCCC	2	12	4193870	4193881	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_021282	GTGCCT	2	12	4202517	4202528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021282	TGCCGA	5	30	4203999	4204028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021282	CCGCTC	2	12	4208016	4208027	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021282	GGGCCC	3	18	4209306	4209323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021282	CCCGTG	2	12	4377449	4377460	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021282	CGCGGG	2	12	4379383	4379394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021282	GCTCTG	2	12	4389275	4389286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021282	AAACGT	2	12	4408146	4408157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021282	CCGCGC	2	12	4499278	4499289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021282	AGCGCG	2	12	4799294	4799305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021282	TCGATT	2	12	4816592	4816603	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021282	CTCGAA	2	12	4823818	4823829	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021282	CCCCTC	2	12	4956736	4956747	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_021282	TCACCG	2	12	4991860	4991871	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.