MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fusobacterium sp. 4_8

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021281	TAATAT	2	12	24451	24462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021281	TAATAT	2	12	24560	24571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021281	TAAAAA	2	12	46630	46641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021281	TTAAAA	2	12	50358	50369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021281	AAAAAT	2	12	92824	92835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021281	GAGATA	2	12	94833	94844	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021281	AAATTA	2	12	100330	100341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021281	ATAAAA	2	12	106840	106851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021281	ATAAAT	2	12	110419	110430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021281	AAAATA	2	12	111567	111578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021281	AAATAA	2	12	123844	123855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021281	AAAACT	2	12	147159	147170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021281	TTAAAA	2	12	150529	150540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021281	TAATTT	2	12	197332	197343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021281	TAATTT	2	12	203725	203736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021281	ACCTTA	2	12	209701	209712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021281	AAATTA	2	12	255805	255816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021281	CTATAA	2	12	255902	255913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021281	TTTAAT	2	12	289859	289870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021281	TATAAT	2	12	296883	296894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021281	CTTTTT	2	12	328482	328493	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021281	TTTTAT	2	12	335137	335148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021281	ATTTTA	2	12	342169	342180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021281	AAGATA	2	12	345815	345826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021281	TAAAAA	2	12	361033	361044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021281	TTTTAA	2	12	362740	362751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021281	AAATAT	2	12	427977	427988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021281	AAAAAT	2	12	502427	502438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021281	AAATAA	2	12	543050	543061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021281	TTTCCA	2	12	545988	545999	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021281	AGAAAT	2	12	568133	568144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021281	ATAAAT	2	12	570030	570041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021281	TAAGAG	2	12	605431	605442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021281	ATTTCT	2	12	611488	611499	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021281	ATTTTT	2	12	620289	620300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021281	TTATAA	2	12	620961	620972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021281	TATTTG	2	12	622142	622153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021281	ACATTT	2	12	622198	622209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021281	AAAATA	2	12	638936	638947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021281	AAATTA	2	12	665503	665514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021281	TAAAAT	2	12	675648	675659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021281	CCCTTT	2	12	675729	675740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021281	ATAAAA	2	12	710903	710914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021281	TAAAAA	2	12	745117	745128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021281	AAAAAT	2	12	760797	760808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021281	ACACTA	2	12	768455	768466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021281	ATTTTT	2	12	770246	770257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021281	TTTTAT	2	12	789144	789155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021281	CTTTTC	2	12	794391	794402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021281	AAAATT	2	12	794424	794435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021281	GAAAAA	2	12	806307	806318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021281	AAAGAT	2	12	807114	807125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021281	AGAATT	2	12	807164	807175	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021281	ACAATT	2	12	811542	811553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021281	AAATGA	2	12	817617	817628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021281	TAAAAT	2	12	834742	834753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021281	ATATTA	2	12	864919	864930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021281	GATATT	2	12	905086	905097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021281	TAAAAT	2	12	939328	939339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021281	GATTTA	2	12	944375	944386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021281	ATAATT	2	12	949761	949772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021281	TTATTT	2	12	952665	952676	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021281	AAAAAT	2	12	962150	962161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021281	TTTCTT	2	12	978289	978300	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021281	TTATTT	2	12	1001451	1001462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021281	GAAAAT	2	12	1021022	1021033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021281	TAAAAA	2	12	1069008	1069019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021281	AGAAAA	2	12	1071533	1071544	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021281	TATTTT	2	12	1102025	1102036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021281	AAATAA	2	12	1112407	1112418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021281	TAAAAA	2	12	1112482	1112493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021281	TAAAAT	2	12	1131476	1131487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021281	AATAAA	2	12	1133171	1133182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021281	TAAAAA	2	12	1151441	1151452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021281	ATTTTT	2	12	1160473	1160484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021281	ATTTTT	2	12	1166446	1166457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021281	TAGTGT	2	12	1197046	1197057	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021281	CTTTAT	2	12	1210339	1210350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021281	ATAAAT	2	12	1217812	1217823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021281	ATTATA	2	12	1219199	1219210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021281	ATAAGT	2	12	1229086	1229097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021281	TAAAAA	2	12	1252175	1252186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021281	TAAATT	2	12	1274352	1274363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021281	TAAAAT	2	12	1283150	1283161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021281	AGAAAA	2	12	1298402	1298413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021281	AAAGGA	2	12	1363801	1363812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021281	ATTTTT	2	12	1368856	1368867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021281	AAATAA	2	12	1372426	1372437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021281	ATTTTA	2	12	1374213	1374224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021281	CCATAA	2	12	1401163	1401174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021281	TTATTT	2	12	1409171	1409182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021281	TAAAAA	2	12	1417025	1417036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021281	TTTTAT	2	12	1425303	1425314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021281	AATTTT	2	12	1478063	1478074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021281	ATTTTT	2	12	1483786	1483797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021281	AATATC	2	12	1520752	1520763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021281	TTAATT	2	12	1541044	1541055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021281	AAGTAA	2	12	1557404	1557415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021281	TAAAAT	2	12	1563070	1563081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021281	TATTAA	2	12	1571350	1571361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021281	GAAAAA	2	12	1576910	1576921	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021281	ACTGAA	2	12	1580690	1580701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021281	TAAAAG	2	12	1601316	1601327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021281	AAAAAT	2	12	1637288	1637299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021281	ATTAAT	2	12	1637684	1637695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021281	ATAAGG	2	12	1650864	1650875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021281	ATTTTT	2	12	1653440	1653451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021281	TAATAT	2	12	1658583	1658594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021281	CTTTTT	2	12	1664963	1664974	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021281	TATCTA	2	12	1712814	1712825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021281	TTTTAA	2	12	1728590	1728601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021281	ATTTTT	2	12	1765777	1765788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021281	ATATTT	2	12	1768331	1768342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021281	ATTTTA	2	12	1774848	1774859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021281	AGAATA	2	12	1786452	1786463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021281	TCTACA	2	12	1787455	1787466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021281	TAAAAT	2	12	1835877	1835888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021281	ATTTTT	2	12	1842404	1842415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021281	TAATTT	2	12	1852262	1852273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021281	ATTTTT	2	12	1922857	1922868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021281	TTTAAA	2	12	1987937	1987948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021281	TTCTCT	2	12	2007757	2007768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021281	TTTGAT	2	12	2037250	2037261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021281	TATTAA	2	12	2065206	2065217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021281	AGACTG	2	12	2069424	2069435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021281	TTTTTA	2	12	2075738	2075749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021281	ATTTTT	2	12	2086204	2086215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021281	ATATAA	2	12	2087116	2087127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021281	TCTTAT	2	12	2096042	2096053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021281	TTATTT	2	12	2096117	2096128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021281	TCAAAA	2	12	2105526	2105537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021281	ATATTT	2	12	2120847	2120858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021281	AATTTT	2	12	2173288	2173299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021281	TTATTT	2	12	2177187	2177198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021281	TTTTTA	2	12	2200878	2200889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021281	AATATT	2	12	2207705	2207716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021281	AATTAA	2	12	2234023	2234034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021281	TTATTT	2	12	2247543	2247554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021281	TTTTAA	2	12	2254989	2255000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021281	TTTTAT	2	12	2260902	2260913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.