MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fusobacterium sp. 4_8

Total Repeats: 475

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021281	TTTCA	2	10	14805	14814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021281	CTTAT	2	10	17558	17567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021281	TTAAA	2	10	22513	22522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021281	AATAT	2	10	24538	24547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021281	ATAAA	2	10	31090	31099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021281	TAAGA	2	10	39405	39414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021281	ATAGG	2	10	39542	39551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021281	TATAA	2	10	42329	42338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021281	TTTTA	2	10	44484	44493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021281	AATTT	2	10	44497	44506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021281	TAATA	2	10	47001	47010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021281	GAGAT	2	10	52321	52330	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021281	TAATG	2	10	54027	54036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021281	GAAAG	2	10	55323	55332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021281	GAATA	2	10	56886	56895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021281	TTAAA	2	10	57941	57950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021281	AGTTT	2	10	57970	57979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021281	TAGCA	2	10	74103	74112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021281	GCTCA	2	10	92060	92069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021281	TTAAA	2	10	93816	93825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021281	TCGTG	2	10	94900	94909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021281	TCTAT	2	10	95393	95402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021281	TTTAC	2	10	100445	100454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021281	AAAAG	2	10	104116	104125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021281	TATAA	2	10	106077	106086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021281	GTTTA	2	10	106933	106942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021281	TATAT	2	10	110811	110820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021281	AATAT	2	10	116750	116759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021281	ATTAA	2	10	116770	116779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021281	TATTT	2	10	118828	118837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021281	ATATA	2	10	118838	118847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021281	TAAAA	2	10	118871	118880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021281	TTATT	2	10	118959	118968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021281	TATAT	2	10	119054	119063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021281	AAGGT	2	10	119945	119954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021281	TAAAA	2	10	123555	123564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021281	TTATT	2	10	125967	125976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021281	TCGCT	2	10	130271	130280	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021281	TGGTA	2	10	132651	132660	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021281	GTATA	2	10	142663	142672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021281	TAAAT	2	10	142675	142684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021281	TATAG	2	10	142788	142797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021281	ATATA	2	10	143409	143418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021281	AAATA	2	10	145307	145316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021281	AAATT	2	10	147563	147572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021281	TAAAA	2	10	150510	150519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021281	AAATT	2	10	152577	152586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021281	ATATA	2	10	153682	153691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021281	AATTA	2	10	156665	156674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021281	AATTT	2	10	158003	158012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021281	TAAAA	2	10	158905	158914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021281	TTAAT	2	10	164027	164036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021281	TATAA	2	10	164130	164139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021281	AAATA	2	10	173193	173202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021281	CTCTT	2	10	174789	174798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021281	GATAT	2	10	174913	174922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021281	ACAAA	2	10	176518	176527	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021281	AAGGA	2	10	181911	181920	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021281	TAAAA	2	10	181970	181979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021281	TCGTG	2	10	183057	183066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021281	TCTAT	2	10	183550	183559	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021281	TTTCA	2	10	203280	203289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021281	AAAAG	2	10	203456	203465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021281	GTAAG	2	10	221938	221947	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021281	AAAAT	2	10	227661	227670	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021281	TTTTA	2	10	227955	227964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021281	TTTTC	2	10	243040	243049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021281	ATATA	2	10	243089	243098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021281	TAAAA	2	10	250479	250488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021281	AATAA	2	10	262618	262627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021281	ATTTT	2	10	274551	274560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021281	TAAAA	2	10	278601	278610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021281	ATACT	2	10	278768	278777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021281	ATTAT	2	10	279635	279644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021281	TAAAA	2	10	300142	300151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021281	TAAAA	2	10	302799	302808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021281	TTAAA	2	10	308540	308549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021281	TAATG	2	10	308964	308973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021281	ATTTT	2	10	315749	315758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021281	ATAAA	2	10	317124	317133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021281	TTTAT	2	10	317348	317357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021281	AATAA	2	10	320075	320084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021281	TTTTA	2	10	320881	320890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021281	TTATA	2	10	322568	322577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021281	ATTTT	2	10	328613	328622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021281	AAATG	2	10	328700	328709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021281	TAGTG	2	10	332009	332018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021281	AAAAT	2	10	333719	333728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021281	TATAA	2	10	343572	343581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021281	TGAAA	2	10	344030	344039	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021281	AATTA	2	10	345280	345289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021281	ATTGA	2	10	353860	353869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021281	AAAAT	2	10	362843	362852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021281	TAGCT	2	10	364007	364016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021281	ATATT	2	10	364096	364105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021281	TAAAA	2	10	370550	370559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021281	TCTTT	2	10	386340	386349	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021281	TTGAG	2	10	395894	395903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021281	TATTT	2	10	403077	403086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021281	TATAA	2	10	418438	418447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021281	TTATA	2	10	420455	420464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021281	TAAAA	2	10	428126	428135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021281	AAAAT	2	10	428199	428208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021281	AAGTA	2	10	439986	439995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021281	TAATT	2	10	440952	440961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021281	TAATT	2	10	442056	442065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021281	ATTTT	2	10	446706	446715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021281	GTTTA	2	10	450215	450224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021281	AAAAT	2	10	460137	460146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021281	ATTTT	2	10	460376	460385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021281	GATAT	2	10	473076	473085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021281	AATTA	2	10	479159	479168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021281	TAAAA	2	10	487323	487332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021281	GTAAG	2	10	489589	489598	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021281	TATAG	2	10	489828	489837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021281	AATAT	2	10	509296	509305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021281	AAAAT	2	10	512869	512878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021281	GGTTG	2	10	512899	512908	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021281	AAGGA	2	10	517881	517890	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021281	TAATT	2	10	524600	524609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021281	ATTAA	2	10	525726	525735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021281	TAAAT	2	10	537033	537042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021281	AAGGA	2	10	537195	537204	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021281	TTAAA	2	10	537254	537263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021281	TCGTG	2	10	538339	538348	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021281	TCTAT	2	10	538832	538841	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021281	TAATA	2	10	542205	542214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021281	TTTTA	2	10	546210	546219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021281	AAATT	2	10	550187	550196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021281	TAAAA	2	10	558005	558014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021281	CAATT	2	10	558089	558098	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021281	TAAAA	2	10	564418	564427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021281	TATAA	2	10	567179	567188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021281	GAAAT	2	10	567633	567642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021281	ATAAA	2	10	567684	567693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021281	AATTC	2	10	568035	568044	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021281	TAATA	2	10	585254	585263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021281	ATATA	2	10	590425	590434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021281	TCTTG	2	10	595923	595932	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021281	CATAA	2	10	597896	597905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021281	ATTTT	2	10	607788	607797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021281	TAATT	2	10	612379	612388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021281	ATAAA	2	10	625941	625950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021281	TAAAT	2	10	631971	631980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021281	TAATA	2	10	646544	646553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021281	TAAAA	2	10	646795	646804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021281	TAAAA	2	10	663916	663925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021281	AAAAG	2	10	664584	664593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021281	ATACT	2	10	665716	665725	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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433	NC_021281	TTTTA	2	10	2118456	2118465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_021281	ATGAT	2	10	2118490	2118499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_021281	AATTA	2	10	2131866	2131875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_021281	AATAA	2	10	2152156	2152165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_021281	ATTTA	2	10	2173969	2173978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_021281	AACTT	2	10	2176970	2176979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
449	NC_021281	AATAG	2	10	2186397	2186406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021281	CTATA	2	10	2187829	2187838	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
451	NC_021281	TTTTA	3	15	2187852	2187866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_021281	AGTAT	2	10	2190152	2190161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021281	TATAA	2	10	2194126	2194135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021281	TACAA	2	10	2197706	2197715	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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456	NC_021281	AATAA	2	10	2223676	2223685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021281	ATATA	2	10	2224313	2224322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_021281	ATATA	2	10	2230563	2230572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_021281	CTATA	2	10	2232022	2232031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
462	NC_021281	ACCTT	2	10	2232259	2232268	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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464	NC_021281	ATAAA	2	10	2236032	2236041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_021281	AGTTA	2	10	2236077	2236086	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
466	NC_021281	ATTAA	2	10	2241613	2241622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_021281	CTTTT	2	10	2245460	2245469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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471	NC_021281	ATTTT	2	10	2253395	2253404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_021281	TTTAA	2	10	2253453	2253462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_021281	TAAAA	2	10	2255265	2255274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_021281	TATTT	2	10	2261004	2261013	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021281	ATTTT	3	15	2261125	2261139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.