MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma chrysopicola DF-1

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021280	TAAAA	2	10	2922	2931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021280	TATAA	2	10	17893	17902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021280	CTTTT	2	10	18866	18875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021280	ATCAA	2	10	58466	58475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021280	TAATA	2	10	67098	67107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021280	TAAAA	2	10	67117	67126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021280	TTTTA	2	10	68421	68430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021280	ATTGT	2	10	71533	71542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021280	AATTA	2	10	89377	89386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021280	GTTAA	2	10	96340	96349	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021280	TAAAA	2	10	109254	109263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021280	ATTTA	2	10	110987	110996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021280	GAAAG	2	10	116087	116096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021280	TAATT	2	10	117131	117140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021280	GGAAA	2	10	120546	120555	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021280	ATATA	2	10	132105	132114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021280	CTAAT	2	10	134612	134621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021280	TTATA	2	10	136527	136536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021280	TAAAA	2	10	143591	143600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021280	TTTTA	2	10	144906	144915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021280	TATTT	2	10	151665	151674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021280	AAAAT	2	10	163380	163389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021280	TTAGC	2	10	190977	190986	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021280	ATTTT	2	10	195932	195941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021280	ATTTT	2	10	203042	203051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021280	AATTA	2	10	208028	208037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021280	ATTTA	2	10	212700	212709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021280	TGTTA	2	10	221213	221222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021280	ATAAG	2	10	221268	221277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021280	ATTTA	2	10	254541	254550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021280	TTAAA	2	10	260964	260973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021280	TAAAA	2	10	270263	270272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021280	TTAAG	2	10	288942	288951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021280	GATAA	2	10	290651	290660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021280	CTTAT	2	10	293548	293557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021280	ATATA	2	10	303066	303075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021280	TATAA	2	10	319665	319674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021280	TAACA	2	10	328092	328101	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021280	TATAA	2	10	336181	336190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021280	TAGTA	2	10	343581	343590	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021280	ATTTT	2	10	347201	347210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021280	ATTAT	2	10	366632	366641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021280	AATCT	2	10	375142	375151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021280	CAAAA	2	10	377019	377028	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021280	GAAAA	2	10	378274	378283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021280	GCAAT	2	10	378592	378601	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021280	CAATT	2	10	381410	381419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021280	AAAAG	2	10	381455	381464	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021280	AAAAG	2	10	381974	381983	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021280	AAGCA	2	10	382025	382034	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021280	AATTT	2	10	383059	383068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021280	GAAAA	2	10	383080	383089	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021280	ATTTA	2	10	387853	387862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021280	TTTTA	2	10	388332	388341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021280	GAGAA	2	10	392460	392469	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021280	TTTTA	2	10	404972	404981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021280	AATTA	2	10	405599	405608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021280	TATTT	2	10	419541	419550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021280	ATGTA	2	10	427412	427421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021280	ATCTA	2	10	432890	432899	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021280	TTAAT	2	10	434580	434589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021280	GGGAG	2	10	435137	435146	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021280	TATTT	2	10	439200	439209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021280	TTAGT	2	10	457843	457852	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021280	ATTAA	2	10	458893	458902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021280	TGAAA	2	10	462847	462856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021280	TATAT	2	10	462989	462998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021280	TAATG	2	10	464294	464303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021280	TAAAA	2	10	464310	464319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021280	CTTTT	2	10	465589	465598	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021280	TATTT	2	10	466089	466098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021280	TAAAA	2	10	467846	467855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021280	ATTTT	2	10	467879	467888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021280	TATAC	2	10	467894	467903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021280	ATATT	2	10	467907	467916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021280	ATTTT	2	10	483451	483460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021280	AATAT	2	10	483607	483616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021280	TATTT	2	10	483706	483715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021280	TGAAT	2	10	485450	485459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021280	TTTTA	2	10	487108	487117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021280	AAAAT	2	10	487184	487193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021280	ATCAG	2	10	487205	487214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021280	TTTTA	2	10	490206	490215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021280	AATTT	2	10	490344	490353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021280	ATTAG	2	10	490356	490365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021280	AAATG	2	10	491570	491579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021280	AATAT	2	10	494999	495008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021280	ATTAA	2	10	496604	496613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021280	TGAAT	2	10	496953	496962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021280	TTGAT	2	10	504816	504825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021280	TTTTA	2	10	504999	505008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021280	TTAAA	2	10	505677	505686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021280	ATGGT	2	10	510463	510472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021280	TAATA	2	10	510512	510521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021280	ATTTT	2	10	510539	510548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021280	ATATT	2	10	510646	510655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021280	CTTTT	2	10	510714	510723	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021280	TTTTC	2	10	510780	510789	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021280	GAAAA	2	10	514233	514242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021280	AAATA	2	10	514243	514252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021280	ATTTT	2	10	516642	516651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021280	ATAAA	2	10	522868	522877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021280	ATTTT	2	10	526553	526562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021280	TAAAA	2	10	527573	527582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021280	TATTT	2	10	527611	527620	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021280	TATTT	2	10	528860	528869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021280	TAATT	2	10	529570	529579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021280	TTTCC	2	10	532307	532316	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021280	TCTTA	2	10	533086	533095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021280	TTTTA	2	10	535328	535337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021280	AATTT	2	10	536772	536781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021280	TTTAT	2	10	549493	549502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021280	ATTCA	2	10	549555	549564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021280	TATAA	2	10	549617	549626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021280	TATTT	2	10	549726	549735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021280	AACCA	2	10	549810	549819	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021280	TAATT	2	10	550032	550041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021280	TGTTA	2	10	556435	556444	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021280	AATTA	2	10	571940	571949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021280	TTAAT	2	10	574720	574729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021280	ATATT	2	10	592882	592891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021280	TATTT	2	10	592892	592901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021280	TAAAA	2	10	619916	619925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021280	CAATA	2	10	621840	621849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021280	ATTAT	2	10	624624	624633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021280	TTTTA	2	10	629921	629930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021280	TAATT	2	10	630343	630352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021280	AAATT	2	10	630551	630560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021280	TATTT	2	10	630703	630712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021280	TCCTT	2	10	635526	635535	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021280	TTTTG	2	10	645113	645122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021280	TAAAA	2	10	645229	645238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021280	TTTAT	2	10	648185	648194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021280	AATAA	2	10	653011	653020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021280	TAAAA	2	10	669361	669370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021280	TCATT	2	10	671741	671750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021280	GTATA	2	10	674490	674499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021280	TATAT	2	10	679390	679399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021280	CATTT	2	10	680145	680154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021280	TAAAA	2	10	683138	683147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021280	AGGTA	2	10	683172	683181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021280	TATAC	2	10	683282	683291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021280	TAAAA	2	10	683428	683437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021280	TTAAA	2	10	683847	683856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021280	ATTCA	2	10	685999	686008	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021280	GTTAA	2	10	689081	689090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021280	AATAA	2	10	689133	689142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021280	TTATT	2	10	693407	693416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_021280	TGATT	2	10	820307	820316	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021280	ATTTT	2	10	820327	820336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021280	ATAAA	2	10	820392	820401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_021280	TAAAA	2	10	851635	851644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021280	TAAAA	2	10	856403	856412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_021280	TAAAA	2	10	1070849	1070858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_021280	ACTTT	2	10	1085787	1085796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_021280	AACTT	2	10	1088229	1088238	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
252	NC_021280	TAAAT	2	10	1097678	1097687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021280	TTATA	2	10	1099831	1099840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021280	ATTAC	2	10	1104670	1104679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_021280	ATTTT	2	10	1105895	1105904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.