MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 2

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021279	GCCACC	2	12	504	515	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	507418866
2	NC_021279	CTGCGC	2	12	954	965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507418866
3	NC_021279	GCCGAC	2	12	2292	2303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507418867
4	NC_021279	GCCACC	2	12	3949	3960	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	507418869
5	NC_021279	CTGCGC	2	12	4399	4410	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507418869
6	NC_021279	TATGAA	2	12	5743	5754	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021279	GGAATC	2	12	5761	5772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021279	ATCGGT	2	12	5828	5839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021279	CAGCTC	2	12	8695	8706	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021279	CACCGC	2	12	16641	16652	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	507418882
11	NC_021279	CGTCGG	2	12	19332	19343	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507418884
12	NC_021279	CCCGGC	2	12	19564	19575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507418884
13	NC_021279	GACGGC	2	12	23305	23316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021279	TCAGGT	2	12	23383	23394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021279	GAGCCC	2	12	30950	30961	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507418892
16	NC_021279	GTACCG	2	12	31159	31170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507418892
17	NC_021279	TCGTCA	2	12	31451	31462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021279	CGCAAA	2	12	34034	34045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021279	CAGGCG	2	12	40045	40056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021279	CATCAA	2	12	41306	41317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021279	GGCCAC	2	12	41610	41621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507418901
22	NC_021279	CACCAA	2	12	42599	42610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021279	CTACGA	2	12	43141	43152	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507418903
24	NC_021279	CGCCGG	2	12	46997	47008	0 %	0 %	50 %	50 %	507418904
25	NC_021279	ACGTGT	2	12	47062	47073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507418904
26	NC_021279	AGCGTC	2	12	47676	47687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507418904
27	NC_021279	CGACCA	2	12	49481	49492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	507418905
28	NC_021279	CTTGGT	2	12	49617	49628	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	507418905
29	NC_021279	CCGGCA	2	12	50955	50966	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507418906
30	NC_021279	CTTCGG	2	12	52957	52968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507418907
31	NC_021279	ATCTCA	2	12	52977	52988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507418907
32	NC_021279	AACCGG	2	12	54217	54228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507418908
33	NC_021279	CGATCG	2	12	55497	55508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507418908
34	NC_021279	TAGGGC	2	12	58823	58834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507418910
35	NC_021279	TGCCGG	2	12	64797	64808	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021279	AGCACC	2	12	66723	66734	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	507418919
37	NC_021279	CATGAT	2	12	67363	67374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	507418920
38	NC_021279	GTCACC	2	12	71378	71389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507418922
39	NC_021279	CAGCGC	2	12	72201	72212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507418923
40	NC_021279	TCAGCG	2	12	77671	77682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507418926
41	NC_021279	GCTCAC	2	12	84808	84819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507418931
42	NC_021279	GGCGCA	2	12	86499	86510	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507418932
43	NC_021279	GCCTCA	2	12	87672	87683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507418932
44	NC_021279	CGGATA	2	12	88445	88456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507418933
45	NC_021279	CGCTAT	2	12	88957	88968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021279	GTCCGG	2	12	91142	91153	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507418936
47	NC_021279	GACCTT	2	12	91991	92002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507418937
48	NC_021279	GCGACC	2	12	94051	94062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507418939
49	NC_021279	ATCAGC	2	12	95501	95512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	507418940
50	NC_021279	GGCATC	2	12	95714	95725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507418940
51	NC_021279	CCGGCG	2	12	96436	96447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.