MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 2

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021279	CCCA	2	8	378	385	25 %	0 %	0 %	75 %	507418866
2	NC_021279	ACCC	2	8	966	973	25 %	0 %	0 %	75 %	507418866
3	NC_021279	CACC	2	8	1073	1080	25 %	0 %	0 %	75 %	507418866
4	NC_021279	TTCA	2	8	2159	2166	25 %	50 %	0 %	25 %	507418867
5	NC_021279	ATTC	2	8	2459	2466	25 %	50 %	0 %	25 %	507418867
6	NC_021279	CCAA	2	8	2569	2576	50 %	0 %	0 %	50 %	507418867
7	NC_021279	CAGT	2	8	3423	3430	25 %	25 %	25 %	25 %	507418869
8	NC_021279	ACCC	2	8	4411	4418	25 %	0 %	0 %	75 %	507418869
9	NC_021279	CACC	2	8	4518	4525	25 %	0 %	0 %	75 %	507418869
10	NC_021279	CAAC	2	8	4667	4674	50 %	0 %	0 %	50 %	507418870
11	NC_021279	ATCT	2	8	4920	4927	25 %	50 %	0 %	25 %	507418871
12	NC_021279	GCAC	2	8	5002	5009	25 %	0 %	25 %	50 %	507418871
13	NC_021279	AGAT	2	8	6867	6874	50 %	25 %	25 %	0 %	507418872
14	NC_021279	GCCC	2	8	6958	6965	0 %	0 %	25 %	75 %	507418872
15	NC_021279	GTGG	2	8	7580	7587	0 %	25 %	75 %	0 %	507418872
16	NC_021279	ACGC	2	8	7751	7758	25 %	0 %	25 %	50 %	507418872
17	NC_021279	ATCG	2	8	7926	7933	25 %	25 %	25 %	25 %	507418873
18	NC_021279	GGCC	2	8	8133	8140	0 %	0 %	50 %	50 %	507418873
19	NC_021279	CGGC	2	8	9782	9789	0 %	0 %	50 %	50 %	507418875
20	NC_021279	TCCC	2	8	10389	10396	0 %	25 %	0 %	75 %	507418875
21	NC_021279	CGCC	2	8	10423	10430	0 %	0 %	25 %	75 %	507418875
22	NC_021279	ACGA	2	8	10566	10573	50 %	0 %	25 %	25 %	507418875
23	NC_021279	AGAA	2	8	10652	10659	75 %	0 %	25 %	0 %	507418875
24	NC_021279	CGCC	2	8	11711	11718	0 %	0 %	25 %	75 %	507418876
25	NC_021279	TCGG	2	8	11724	11731	0 %	25 %	50 %	25 %	507418876
26	NC_021279	GCGG	2	8	12272	12279	0 %	0 %	75 %	25 %	507418877
27	NC_021279	GTTC	2	8	13662	13669	0 %	50 %	25 %	25 %	507418879
28	NC_021279	GGGT	2	8	14039	14046	0 %	25 %	75 %	0 %	507418879
29	NC_021279	CTGC	2	8	14073	14080	0 %	25 %	25 %	50 %	507418879
30	NC_021279	GAAG	2	8	15216	15223	50 %	0 %	50 %	0 %	507418880
31	NC_021279	CCGG	2	8	15372	15379	0 %	0 %	50 %	50 %	507418880
32	NC_021279	TGGT	2	8	15613	15620	0 %	50 %	50 %	0 %	507418880
33	NC_021279	GCGA	2	8	15701	15708	25 %	0 %	50 %	25 %	507418880
34	NC_021279	CCGA	2	8	15819	15826	25 %	0 %	25 %	50 %	507418880
35	NC_021279	CCGG	2	8	16060	16067	0 %	0 %	50 %	50 %	507418881
36	NC_021279	GGCA	2	8	16074	16081	25 %	0 %	50 %	25 %	507418881
37	NC_021279	CCCA	2	8	16909	16916	25 %	0 %	0 %	75 %	507418882
38	NC_021279	ACCG	2	8	16924	16931	25 %	0 %	25 %	50 %	507418882
39	NC_021279	GGCG	2	8	19008	19015	0 %	0 %	75 %	25 %	507418884
40	NC_021279	GATC	2	8	19881	19888	25 %	25 %	25 %	25 %	507418884
41	NC_021279	CAGC	2	8	19915	19922	25 %	0 %	25 %	50 %	507418884
42	NC_021279	GACC	2	8	20091	20098	25 %	0 %	25 %	50 %	507418884
43	NC_021279	AGCC	2	8	20799	20806	25 %	0 %	25 %	50 %	507418885
44	NC_021279	CTGG	2	8	23612	23619	0 %	25 %	50 %	25 %	507418887
45	NC_021279	GGGA	2	8	23642	23649	25 %	0 %	75 %	0 %	507418887
46	NC_021279	TCGA	2	8	23815	23822	25 %	25 %	25 %	25 %	507418887
47	NC_021279	GTTG	2	8	25016	25023	0 %	50 %	50 %	0 %	507418889
48	NC_021279	AGGC	2	8	25268	25275	25 %	0 %	50 %	25 %	507418889
49	NC_021279	TGAC	2	8	28226	28233	25 %	25 %	25 %	25 %	507418890
50	NC_021279	CGAT	2	8	29318	29325	25 %	25 %	25 %	25 %	507418891
51	NC_021279	CCAG	2	8	30237	30244	25 %	0 %	25 %	50 %	507418892
52	NC_021279	GTGG	2	8	30288	30295	0 %	25 %	75 %	0 %	507418892
53	NC_021279	CTCA	2	8	30772	30779	25 %	25 %	0 %	50 %	507418892
54	NC_021279	GCGA	2	8	30796	30803	25 %	0 %	50 %	25 %	507418892
55	NC_021279	CGAC	2	8	32027	32034	25 %	0 %	25 %	50 %	507418893
56	NC_021279	CCCA	2	8	32127	32134	25 %	0 %	0 %	75 %	507418893
57	NC_021279	TCAA	2	8	32171	32178	50 %	25 %	0 %	25 %	507418893
58	NC_021279	GCTC	2	8	32190	32197	0 %	25 %	25 %	50 %	507418893
59	NC_021279	GCCA	2	8	32508	32515	25 %	0 %	25 %	50 %	507418893
60	NC_021279	TGAG	2	8	34314	34321	25 %	25 %	50 %	0 %	507418895
61	NC_021279	GACC	2	8	37003	37010	25 %	0 %	25 %	50 %	507418896
62	NC_021279	CACC	2	8	41787	41794	25 %	0 %	0 %	75 %	507418901
63	NC_021279	CCGA	2	8	42730	42737	25 %	0 %	25 %	50 %	507418902
64	NC_021279	TACC	2	8	42769	42776	25 %	25 %	0 %	50 %	507418902
65	NC_021279	CTAC	2	8	43458	43465	25 %	25 %	0 %	50 %	507418903
66	NC_021279	GCAC	2	8	45881	45888	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
67	NC_021279	GCAC	2	8	46563	46570	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
68	NC_021279	CGAC	2	8	46616	46623	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
69	NC_021279	TCGA	2	8	47721	47728	25 %	25 %	25 %	25 %	507418904
70	NC_021279	ACCG	2	8	47802	47809	25 %	0 %	25 %	50 %	507418904
71	NC_021279	AGCG	2	8	48324	48331	25 %	0 %	50 %	25 %	507418904
72	NC_021279	CCGG	2	8	49049	49056	0 %	0 %	50 %	50 %	507418905
73	NC_021279	CGAT	2	8	49222	49229	25 %	25 %	25 %	25 %	507418905
74	NC_021279	CAGC	2	8	49409	49416	25 %	0 %	25 %	50 %	507418905
75	NC_021279	TGCG	2	8	49818	49825	0 %	25 %	50 %	25 %	507418905
76	NC_021279	CGGC	2	8	50089	50096	0 %	0 %	50 %	50 %	507418905
77	NC_021279	CGCC	2	8	52234	52241	0 %	0 %	25 %	75 %	507418907
78	NC_021279	CCGT	2	8	52382	52389	0 %	25 %	25 %	50 %	507418907
79	NC_021279	CAGG	2	8	53549	53556	25 %	0 %	50 %	25 %	507418907
80	NC_021279	ATCG	2	8	53690	53697	25 %	25 %	25 %	25 %	507418907
81	NC_021279	GCCT	2	8	54469	54476	0 %	25 %	25 %	50 %	507418908
82	NC_021279	CACC	2	8	54597	54604	25 %	0 %	0 %	75 %	507418908
83	NC_021279	CCAA	2	8	54631	54638	50 %	0 %	0 %	50 %	507418908
84	NC_021279	GGCG	2	8	55080	55087	0 %	0 %	75 %	25 %	507418908
85	NC_021279	CATC	2	8	55233	55240	25 %	25 %	0 %	50 %	507418908
86	NC_021279	CCGG	2	8	55348	55355	0 %	0 %	50 %	50 %	507418908
87	NC_021279	ACCC	2	8	55709	55716	25 %	0 %	0 %	75 %	507418908
88	NC_021279	CCAC	2	8	55917	55924	25 %	0 %	0 %	75 %	507418908
89	NC_021279	GCGG	2	8	55956	55963	0 %	0 %	75 %	25 %	507418908
90	NC_021279	GGGT	2	8	56098	56105	0 %	25 %	75 %	0 %	507418909
91	NC_021279	CCGG	2	8	56163	56170	0 %	0 %	50 %	50 %	507418909
92	NC_021279	CCCG	2	8	56581	56588	0 %	0 %	25 %	75 %	507418909
93	NC_021279	TCTT	2	8	57502	57509	0 %	75 %	0 %	25 %	507418909
94	NC_021279	GTTG	2	8	57650	57657	0 %	50 %	50 %	0 %	507418909
95	NC_021279	CAGC	2	8	58275	58282	25 %	0 %	25 %	50 %	507418909
96	NC_021279	TTTG	2	8	58557	58564	0 %	75 %	25 %	0 %	507418909
97	NC_021279	CACG	2	8	60069	60076	25 %	0 %	25 %	50 %	507418912
98	NC_021279	GTGA	2	8	60342	60349	25 %	25 %	50 %	0 %	507418912
99	NC_021279	CAGC	2	8	61036	61043	25 %	0 %	25 %	50 %	507418913
100	NC_021279	GCAG	2	8	61231	61238	25 %	0 %	50 %	25 %	507418913
101	NC_021279	TCGG	2	8	61816	61823	0 %	25 %	50 %	25 %	507418913
102	NC_021279	AGAT	2	8	62590	62597	50 %	25 %	25 %	0 %	507418915
103	NC_021279	TCAG	2	8	62692	62699	25 %	25 %	25 %	25 %	507418915
104	NC_021279	TGTT	2	8	63988	63995	0 %	75 %	25 %	0 %	507418916
105	NC_021279	AGCA	2	8	64179	64186	50 %	0 %	25 %	25 %	507418916
106	NC_021279	GCCC	2	8	64211	64218	0 %	0 %	25 %	75 %	507418916
107	NC_021279	CAGC	2	8	64279	64286	25 %	0 %	25 %	50 %	507418916
108	NC_021279	AGCC	2	8	65693	65700	25 %	0 %	25 %	50 %	507418918
109	NC_021279	AACA	2	8	65935	65942	75 %	0 %	0 %	25 %	507418918
110	NC_021279	GTGG	2	8	67291	67298	0 %	25 %	75 %	0 %	507418920
111	NC_021279	CACC	2	8	67732	67739	25 %	0 %	0 %	75 %	507418920
112	NC_021279	CCGC	2	8	67803	67810	0 %	0 %	25 %	75 %	507418920
113	NC_021279	GGCA	2	8	68455	68462	25 %	0 %	50 %	25 %	507418920
114	NC_021279	GTCG	2	8	68738	68745	0 %	25 %	50 %	25 %	507418921
115	NC_021279	CAGC	2	8	69118	69125	25 %	0 %	25 %	50 %	507418921
116	NC_021279	GCTG	2	8	69635	69642	0 %	25 %	50 %	25 %	507418921
117	NC_021279	ATCG	2	8	69923	69930	25 %	25 %	25 %	25 %	507418921
118	NC_021279	GCCG	2	8	70441	70448	0 %	0 %	50 %	50 %	507418922
119	NC_021279	CGAC	2	8	70989	70996	25 %	0 %	25 %	50 %	507418922
120	NC_021279	TCTT	2	8	71570	71577	0 %	75 %	0 %	25 %	507418922
121	NC_021279	CCGG	2	8	72314	72321	0 %	0 %	50 %	50 %	507418923
122	NC_021279	ACCG	2	8	72532	72539	25 %	0 %	25 %	50 %	507418923
123	NC_021279	TGCG	2	8	73225	73232	0 %	25 %	50 %	25 %	507418923
124	NC_021279	CTGA	2	8	75666	75673	25 %	25 %	25 %	25 %	507418925
125	NC_021279	CGCC	2	8	76148	76155	0 %	0 %	25 %	75 %	507418925
126	NC_021279	GCCC	2	8	76379	76386	0 %	0 %	25 %	75 %	507418925
127	NC_021279	CCGA	2	8	78220	78227	25 %	0 %	25 %	50 %	507418927
128	NC_021279	TGCC	2	8	79112	79119	0 %	25 %	25 %	50 %	507418929
129	NC_021279	CCGG	2	8	79612	79619	0 %	0 %	50 %	50 %	507418929
130	NC_021279	CCAA	2	8	82857	82864	50 %	0 %	0 %	50 %	507418931
131	NC_021279	AGGC	2	8	82981	82988	25 %	0 %	50 %	25 %	507418931
132	NC_021279	CGAT	2	8	83185	83192	25 %	25 %	25 %	25 %	507418931
133	NC_021279	CCTG	2	8	83492	83499	0 %	25 %	25 %	50 %	507418931
134	NC_021279	TACG	2	8	83680	83687	25 %	25 %	25 %	25 %	507418931
135	NC_021279	CGCA	2	8	83842	83849	25 %	0 %	25 %	50 %	507418931
136	NC_021279	GCGG	2	8	84068	84075	0 %	0 %	75 %	25 %	507418931
137	NC_021279	AGGC	2	8	84268	84275	25 %	0 %	50 %	25 %	507418931
138	NC_021279	TCGC	2	8	84409	84416	0 %	25 %	25 %	50 %	507418931
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.