MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021278	GCCGCG	2	12	4453	4464	0 %	0 %	50 %	50 %	507423905
2	NC_021278	CTGGCG	2	12	9377	9388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507423910
3	NC_021278	TCCTTG	2	12	12197	12208	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	507423912
4	NC_021278	CGGCGA	2	12	13609	13620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507423913
5	NC_021278	CGAGGT	2	12	17187	17198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507423917
6	NC_021278	GTCGTA	2	12	17653	17664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507423917
7	NC_021278	GATCCG	2	12	22010	22021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507423921
8	NC_021278	TCGGCT	2	12	22177	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507423921
9	NC_021278	GATGGT	2	12	27882	27893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	507423925
10	NC_021278	GTCGCG	2	12	30239	30250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507423926
11	NC_021278	GGCCGC	2	12	31894	31905	0 %	0 %	50 %	50 %	507423927
12	NC_021278	CGTGAA	2	12	31946	31957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507423927
13	NC_021278	CGTCGG	2	12	45915	45926	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507423942
14	NC_021278	CGACGT	2	12	47482	47493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507423942
15	NC_021278	CCGGGA	2	12	49761	49772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507423945
16	NC_021278	CGAGTC	2	12	51059	51070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507423945
17	NC_021278	CGGGCC	2	12	61757	61768	0 %	0 %	50 %	50 %	507423953
18	NC_021278	GGTGTT	2	12	62924	62935	0 %	50 %	50 %	0 %	507423954
19	NC_021278	CGGCAA	2	12	71039	71050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507423962
20	NC_021278	ACGGCC	2	12	77737	77748	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507423967
21	NC_021278	CCCCAG	2	12	77862	77873	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	507423967
22	NC_021278	CGGCCC	2	12	80622	80633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507423969
23	NC_021278	CAGGCT	2	12	85230	85241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507423971
24	NC_021278	TGGCCT	2	12	87449	87460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507423971
25	NC_021278	CGCGGC	2	12	94650	94661	0 %	0 %	50 %	50 %	507423980
26	NC_021278	CCAGCA	2	12	97514	97525	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	507423984
27	NC_021278	CGCCGG	2	12	97886	97897	0 %	0 %	50 %	50 %	507423984
28	NC_021278	TTCGCG	2	12	109081	109092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507423998
29	NC_021278	GACGCG	2	12	115110	115121	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507424002
30	NC_021278	TGGCGG	2	12	125812	125823	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	507424012
31	NC_021278	CGGCTG	2	12	126815	126826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507424013
32	NC_021278	CAGGTG	2	12	127263	127274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507424014
33	NC_021278	CCGCAC	2	12	133544	133555	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	507424019
34	NC_021278	GCGAAC	2	12	134248	134259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507424019
35	NC_021278	ACGACA	2	12	135753	135764	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	507424020
36	NC_021278	GCACCT	2	12	138038	138049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507424023
37	NC_021278	GCCGCG	2	12	138504	138515	0 %	0 %	50 %	50 %	507424023
38	NC_021278	TGCTGA	2	12	144305	144316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507424029
39	NC_021278	TCCTTG	2	12	148626	148637	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	507424033
40	NC_021278	CGGCGA	2	12	150041	150052	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507424034
41	NC_021278	GCCGCG	2	12	150232	150243	0 %	0 %	50 %	50 %	507424034
42	NC_021278	CCCGGC	2	12	153033	153044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507424039
43	NC_021278	CACCGC	2	12	155328	155339	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	507424040
44	NC_021278	AGTTCG	3	18	164846	164863	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507424046
45	NC_021278	GTCACC	2	12	169104	169115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507424048

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.