MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 1

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021278	ATGGG	2	10	515	524	20 %	20 %	60 %	0 %	507423902
2	NC_021278	GGGCG	2	10	744	753	0 %	0 %	80 %	20 %	507423902
3	NC_021278	CGGGG	2	10	2299	2308	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021278	CCTCA	2	10	2440	2449	20 %	20 %	0 %	60 %	507423904
5	NC_021278	CCCGC	2	10	8891	8900	0 %	0 %	20 %	80 %	507423910
6	NC_021278	GATCA	2	10	9065	9074	40 %	20 %	20 %	20 %	507423910
7	NC_021278	GCGCT	2	10	11969	11978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021278	GTCGC	2	10	13068	13077	0 %	20 %	40 %	40 %	507423913
9	NC_021278	CTGCC	2	10	13707	13716	0 %	20 %	20 %	60 %	507423913
10	NC_021278	GGCTG	2	10	14040	14049	0 %	20 %	60 %	20 %	507423914
11	NC_021278	GTCTC	2	10	15440	15449	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021278	GCCGA	2	10	16457	16466	20 %	0 %	40 %	40 %	507423917
13	NC_021278	GTCGA	2	10	17266	17275	20 %	20 %	40 %	20 %	507423917
14	NC_021278	CGGGT	2	10	18114	18123	0 %	20 %	60 %	20 %	507423918
15	NC_021278	GTTGC	2	10	19383	19392	0 %	40 %	40 %	20 %	507423919
16	NC_021278	CCGGG	2	10	19672	19681	0 %	0 %	60 %	40 %	507423919
17	NC_021278	CGGCG	2	10	20184	20193	0 %	0 %	60 %	40 %	507423920
18	NC_021278	TCCGG	2	10	20639	20648	0 %	20 %	40 %	40 %	507423920
19	NC_021278	CTGGG	2	10	21501	21510	0 %	20 %	60 %	20 %	507423921
20	NC_021278	GGGCT	2	10	22065	22074	0 %	20 %	60 %	20 %	507423921
21	NC_021278	GCGAC	2	10	22328	22337	20 %	0 %	40 %	40 %	507423921
22	NC_021278	TCGGA	2	10	24342	24351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021278	TCGCG	2	10	25629	25638	0 %	20 %	40 %	40 %	507423924
24	NC_021278	GCCGA	2	10	26096	26105	20 %	0 %	40 %	40 %	507423924
25	NC_021278	CCCAA	2	10	26797	26806	40 %	0 %	0 %	60 %	507423924
26	NC_021278	GGCGC	2	10	30261	30270	0 %	0 %	60 %	40 %	507423926
27	NC_021278	GACCG	2	10	30390	30399	20 %	0 %	40 %	40 %	507423926
28	NC_021278	TTTCA	2	10	31129	31138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021278	CGGAG	2	10	31546	31555	20 %	0 %	60 %	20 %	507423927
30	NC_021278	TCAGC	2	10	32605	32614	20 %	20 %	20 %	40 %	507423928
31	NC_021278	TGCGC	2	10	34001	34010	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021278	GCCTG	2	10	34069	34078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_021278	GCATG	2	10	37679	37688	20 %	20 %	40 %	20 %	507423934
34	NC_021278	TGGAG	2	10	38950	38959	20 %	20 %	60 %	0 %	507423935
35	NC_021278	GGCGA	2	10	39493	39502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021278	CAAGC	2	10	40532	40541	40 %	0 %	20 %	40 %	507423936
37	NC_021278	GACCC	2	10	41242	41251	20 %	0 %	20 %	60 %	507423936
38	NC_021278	GCACC	2	10	41783	41792	20 %	0 %	20 %	60 %	507423937
39	NC_021278	CTGAT	2	10	43204	43213	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021278	CACCT	2	10	44067	44076	20 %	20 %	0 %	60 %	507423939
41	NC_021278	GGAAG	2	10	44935	44944	40 %	0 %	60 %	0 %	507423939
42	NC_021278	TCTCG	2	10	45255	45264	0 %	40 %	20 %	40 %	507423940
43	NC_021278	CCACC	2	10	47304	47313	20 %	0 %	0 %	80 %	507423942
44	NC_021278	TCCCC	2	10	48305	48314	0 %	20 %	0 %	80 %	507423944
45	NC_021278	ACACC	2	10	49882	49891	40 %	0 %	0 %	60 %	507423945
46	NC_021278	AAAGA	2	10	50663	50672	80 %	0 %	20 %	0 %	507423945
47	NC_021278	CCGAC	2	10	51039	51048	20 %	0 %	20 %	60 %	507423945
48	NC_021278	ACCGA	2	10	51342	51351	40 %	0 %	20 %	40 %	507423945
49	NC_021278	GGCGA	2	10	53069	53078	20 %	0 %	60 %	20 %	507423947
50	NC_021278	GATCG	2	10	55245	55254	20 %	20 %	40 %	20 %	507423948
51	NC_021278	GTGGC	2	10	57859	57868	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021278	GATCA	2	10	58674	58683	40 %	20 %	20 %	20 %	507423952
53	NC_021278	GTCGC	2	10	59198	59207	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021278	GTGGG	2	10	60974	60983	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021278	GCGGG	2	10	61109	61118	0 %	0 %	80 %	20 %	507423953
56	NC_021278	GGGGT	2	10	61150	61159	0 %	20 %	80 %	0 %	507423953
57	NC_021278	GCTTG	2	10	62707	62716	0 %	40 %	40 %	20 %	507423954
58	NC_021278	CGCGG	2	10	62870	62879	0 %	0 %	60 %	40 %	507423954
59	NC_021278	CCGCT	2	10	64139	64148	0 %	20 %	20 %	60 %	507423955
60	NC_021278	CCCAG	2	10	64403	64412	20 %	0 %	20 %	60 %	507423955
61	NC_021278	TCGGG	2	10	64989	64998	0 %	20 %	60 %	20 %	507423956
62	NC_021278	GGCCG	2	10	66607	66616	0 %	0 %	60 %	40 %	507423957
63	NC_021278	GCCGT	2	10	67212	67221	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021278	CTGCC	2	10	67465	67474	0 %	20 %	20 %	60 %	507423958
65	NC_021278	CGCGT	2	10	67939	67948	0 %	20 %	40 %	40 %	507423958
66	NC_021278	GTGGG	2	10	68029	68038	0 %	20 %	80 %	0 %	507423959
67	NC_021278	GCGGG	2	10	68164	68173	0 %	0 %	80 %	20 %	507423959
68	NC_021278	GGGGT	2	10	68205	68214	0 %	20 %	80 %	0 %	507423959
69	NC_021278	CGGCG	2	10	73507	73516	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_021278	GCCGC	2	10	74232	74241	0 %	0 %	40 %	60 %	507423965
71	NC_021278	GCGGT	2	10	76438	76447	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021278	GCACG	2	10	76867	76876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_021278	ACGCG	2	10	77798	77807	20 %	0 %	40 %	40 %	507423967
74	NC_021278	GCCTG	2	10	78804	78813	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_021278	TCCAC	2	10	79074	79083	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_021278	TGCTG	2	10	79578	79587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021278	TGCGG	2	10	84753	84762	0 %	20 %	60 %	20 %	507423970
78	NC_021278	GCCGC	2	10	86395	86404	0 %	0 %	40 %	60 %	507423971
79	NC_021278	GACCA	2	10	86676	86685	40 %	0 %	20 %	40 %	507423971
80	NC_021278	ACCGG	2	10	87099	87108	20 %	0 %	40 %	40 %	507423971
81	NC_021278	GTCGA	2	10	88456	88465	20 %	20 %	40 %	20 %	507423974
82	NC_021278	GACCG	2	10	89987	89996	20 %	0 %	40 %	40 %	507423975
83	NC_021278	GTCCG	2	10	93601	93610	0 %	20 %	40 %	40 %	507423978
84	NC_021278	GATCG	2	10	93742	93751	20 %	20 %	40 %	20 %	507423978
85	NC_021278	GCGCG	2	10	94736	94745	0 %	0 %	60 %	40 %	507423980
86	NC_021278	GCCGC	2	10	95601	95610	0 %	0 %	40 %	60 %	507423981
87	NC_021278	CGGCG	2	10	95621	95630	0 %	0 %	60 %	40 %	507423981
88	NC_021278	ACCGT	2	10	96421	96430	20 %	20 %	20 %	40 %	507423982
89	NC_021278	CGCGC	2	10	96453	96462	0 %	0 %	40 %	60 %	507423982
90	NC_021278	GAACC	2	10	96492	96501	40 %	0 %	20 %	40 %	507423982
91	NC_021278	GGTGC	2	10	97798	97807	0 %	20 %	60 %	20 %	507423984
92	NC_021278	CAGCG	2	10	100024	100033	20 %	0 %	40 %	40 %	507423987
93	NC_021278	CGGTG	2	10	101307	101316	0 %	20 %	60 %	20 %	507423988
94	NC_021278	TGTAC	2	10	101351	101360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021278	AGCCC	2	10	102562	102571	20 %	0 %	20 %	60 %	507423991
96	NC_021278	CTCGG	2	10	102711	102720	0 %	20 %	40 %	40 %	507423991
97	NC_021278	GGCGT	2	10	103880	103889	0 %	20 %	60 %	20 %	507423992
98	NC_021278	CATGG	2	10	105593	105602	20 %	20 %	40 %	20 %	507423994
99	NC_021278	ATCTC	2	10	105702	105711	20 %	40 %	0 %	40 %	507423994
100	NC_021278	CTGGA	2	10	106006	106015	20 %	20 %	40 %	20 %	507423994
101	NC_021278	GCCGC	2	10	106782	106791	0 %	0 %	40 %	60 %	507423995
102	NC_021278	GCGCG	2	10	107237	107246	0 %	0 %	60 %	40 %	507423995
103	NC_021278	CAGCG	2	10	107505	107514	20 %	0 %	40 %	40 %	507423996
104	NC_021278	GCACG	2	10	107739	107748	20 %	0 %	40 %	40 %	507423996
105	NC_021278	CTCGG	2	10	108478	108487	0 %	20 %	40 %	40 %	507423997
106	NC_021278	CGGAC	2	10	108573	108582	20 %	0 %	40 %	40 %	507423997
107	NC_021278	CGGGG	2	10	109742	109751	0 %	0 %	80 %	20 %	507423999
108	NC_021278	GTGAG	2	10	110179	110188	20 %	20 %	60 %	0 %	507423999
109	NC_021278	ACCCC	2	10	112904	112913	20 %	0 %	0 %	80 %	507424001
110	NC_021278	CGCAC	2	10	113054	113063	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_021278	CCACC	2	10	113389	113398	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_021278	CCATC	2	10	114228	114237	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_021278	CGCGC	3	15	114897	114911	0 %	0 %	40 %	60 %	507424002
114	NC_021278	GCACC	2	10	116409	116418	20 %	0 %	20 %	60 %	507424004
115	NC_021278	GCAAA	2	10	118632	118641	60 %	0 %	20 %	20 %	507424005
116	NC_021278	GGCCT	2	10	121275	121284	0 %	20 %	40 %	40 %	507424007
117	NC_021278	GCACG	2	10	121415	121424	20 %	0 %	40 %	40 %	507424007
118	NC_021278	GGCCC	2	10	122711	122720	0 %	0 %	40 %	60 %	507424008
119	NC_021278	GCCCT	2	10	122871	122880	0 %	20 %	20 %	60 %	507424008
120	NC_021278	TGGTC	2	10	126053	126062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021278	GACGC	2	10	127008	127017	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_021278	CCCGA	2	10	127566	127575	20 %	0 %	20 %	60 %	507424014
123	NC_021278	TCGGC	2	10	128087	128096	0 %	20 %	40 %	40 %	507424014
124	NC_021278	GCCCG	2	10	128346	128355	0 %	0 %	40 %	60 %	507424014
125	NC_021278	AGCGA	2	10	128687	128696	40 %	0 %	40 %	20 %	507424015
126	NC_021278	CCCGA	2	10	130084	130093	20 %	0 %	20 %	60 %	507424016
127	NC_021278	CGTTC	2	10	134846	134855	0 %	40 %	20 %	40 %	507424019
128	NC_021278	CGGGG	2	10	136350	136359	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021278	CCTCA	2	10	136491	136500	20 %	20 %	0 %	60 %	507424022
130	NC_021278	TGACC	2	10	139577	139586	20 %	20 %	20 %	40 %	507424023
131	NC_021278	GGCGA	2	10	140206	140215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021278	GTGGC	2	10	140588	140597	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021278	TCGGT	2	10	140656	140665	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021278	CGGGC	2	10	140803	140812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_021278	GCCGC	2	10	141204	141213	0 %	0 %	40 %	60 %	507424025
136	NC_021278	CTGCG	2	10	141480	141489	0 %	20 %	40 %	40 %	507424025
137	NC_021278	ACCTC	2	10	144418	144427	20 %	20 %	0 %	60 %	507424029
138	NC_021278	CATGA	2	10	144582	144591	40 %	20 %	20 %	20 %	507424029
139	NC_021278	GCGCC	2	10	147503	147512	0 %	0 %	40 %	60 %	507424032
140	NC_021278	GTCGC	2	10	149497	149506	0 %	20 %	40 %	40 %	507424034
141	NC_021278	CTGCC	2	10	150139	150148	0 %	20 %	20 %	60 %	507424034
142	NC_021278	GGGGA	2	10	151579	151588	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021278	ATGCG	2	10	153136	153145	20 %	20 %	40 %	20 %	507424039
144	NC_021278	CGCGG	2	10	153495	153504	0 %	0 %	60 %	40 %	507424039
145	NC_021278	ACGGC	2	10	153526	153535	20 %	0 %	40 %	40 %	507424039
146	NC_021278	GCGCC	2	10	155129	155138	0 %	0 %	40 %	60 %	507424040
147	NC_021278	CCACA	2	10	155387	155396	40 %	0 %	0 %	60 %	507424040
148	NC_021278	GTCGA	2	10	159303	159312	20 %	20 %	40 %	20 %	507424041
149	NC_021278	AGAAA	2	10	161833	161842	80 %	0 %	20 %	0 %	507424043
150	NC_021278	TCACC	2	10	162814	162823	20 %	20 %	0 %	60 %	507424044
151	NC_021278	CGAAG	2	10	163222	163231	40 %	0 %	40 %	20 %	507424044
152	NC_021278	AGGTC	2	10	164015	164024	20 %	20 %	40 %	20 %	507424045
153	NC_021278	GCTCG	2	10	164231	164240	0 %	20 %	40 %	40 %	507424045
154	NC_021278	TCGGC	2	10	165852	165861	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_021278	GAAGA	2	10	166318	166327	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021278	CGCGG	2	10	166918	166927	0 %	0 %	60 %	40 %	507424047
157	NC_021278	ATCGC	2	10	167061	167070	20 %	20 %	20 %	40 %	507424047
158	NC_021278	AACGG	2	10	168066	168075	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_021278	CGGGC	2	10	170132	170141	0 %	0 %	60 %	40 %	507424049
160	NC_021278	CCCAC	2	10	170259	170268	20 %	0 %	0 %	80 %	507424049
161	NC_021278	CGCGC	2	10	170653	170662	0 %	0 %	40 %	60 %	507424050

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.