MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 1

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021278	GCTG	2	8	756	763	0 %	25 %	50 %	25 %	507423902
2	NC_021278	ACCA	2	8	1130	1137	50 %	0 %	0 %	50 %	507423903
3	NC_021278	GCTG	2	8	1336	1343	0 %	25 %	50 %	25 %	507423903
4	NC_021278	GGGC	2	8	1583	1590	0 %	0 %	75 %	25 %	507423903
5	NC_021278	TGGG	2	8	1622	1629	0 %	25 %	75 %	0 %	507423903
6	NC_021278	CCGC	2	8	1642	1649	0 %	0 %	25 %	75 %	507423903
7	NC_021278	GTGG	2	8	2059	2066	0 %	25 %	75 %	0 %	507423903
8	NC_021278	CCGG	2	8	2231	2238	0 %	0 %	50 %	50 %	507423903
9	NC_021278	GCCG	2	8	3045	3052	0 %	0 %	50 %	50 %	507423904
10	NC_021278	TGGG	2	8	3431	3438	0 %	25 %	75 %	0 %	507423904
11	NC_021278	ACCC	2	8	3523	3530	25 %	0 %	0 %	75 %	507423905
12	NC_021278	TACG	2	8	4166	4173	25 %	25 %	25 %	25 %	507423905
13	NC_021278	GCCC	2	8	4357	4364	0 %	0 %	25 %	75 %	507423905
14	NC_021278	CGAT	2	8	4388	4395	25 %	25 %	25 %	25 %	507423905
15	NC_021278	CACC	2	8	4644	4651	25 %	0 %	0 %	75 %	507423905
16	NC_021278	ACCG	2	8	5335	5342	25 %	0 %	25 %	50 %	507423905
17	NC_021278	CCAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	0 %	75 %	507423906
18	NC_021278	GCGA	2	8	6077	6084	25 %	0 %	50 %	25 %	507423906
19	NC_021278	TGGG	2	8	6341	6348	0 %	25 %	75 %	0 %	507423907
20	NC_021278	CGGT	2	8	6373	6380	0 %	25 %	50 %	25 %	507423907
21	NC_021278	GCTG	2	8	6708	6715	0 %	25 %	50 %	25 %	507423907
22	NC_021278	GGCC	2	8	7733	7740	0 %	0 %	50 %	50 %	507423909
23	NC_021278	CCTG	2	8	7764	7771	0 %	25 %	25 %	50 %	507423909
24	NC_021278	GCCA	2	8	7881	7888	25 %	0 %	25 %	50 %	507423909
25	NC_021278	TCAC	2	8	8373	8380	25 %	25 %	0 %	50 %	507423909
26	NC_021278	CCGG	2	8	8951	8958	0 %	0 %	50 %	50 %	507423910
27	NC_021278	ACTC	2	8	9331	9338	25 %	25 %	0 %	50 %	507423910
28	NC_021278	AACG	2	8	9662	9669	50 %	0 %	25 %	25 %	507423910
29	NC_021278	CGCT	2	8	10212	10219	0 %	25 %	25 %	50 %	507423910
30	NC_021278	AACG	2	8	11080	11087	50 %	0 %	25 %	25 %	507423911
31	NC_021278	CGGC	2	8	11171	11178	0 %	0 %	50 %	50 %	507423911
32	NC_021278	CCCA	2	8	11365	11372	25 %	0 %	0 %	75 %	507423911
33	NC_021278	CTGC	2	8	11748	11755	0 %	25 %	25 %	50 %	507423911
34	NC_021278	TACC	2	8	11941	11948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021278	CATC	2	8	12643	12650	25 %	25 %	0 %	50 %	507423913
36	NC_021278	GCCC	2	8	12664	12671	0 %	0 %	25 %	75 %	507423913
37	NC_021278	TCGC	2	8	12838	12845	0 %	25 %	25 %	50 %	507423913
38	NC_021278	AGCG	2	8	13471	13478	25 %	0 %	50 %	25 %	507423913
39	NC_021278	CCGT	2	8	13542	13549	0 %	25 %	25 %	50 %	507423913
40	NC_021278	CGAC	2	8	13653	13660	25 %	0 %	25 %	50 %	507423913
41	NC_021278	GTCG	2	8	13921	13928	0 %	25 %	50 %	25 %	507423914
42	NC_021278	AGCA	2	8	14409	14416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021278	GACA	2	8	14488	14495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021278	ACTG	2	8	14542	14549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021278	GCCA	2	8	15076	15083	25 %	0 %	25 %	50 %	507423916
46	NC_021278	GCCG	2	8	15236	15243	0 %	0 %	50 %	50 %	507423916
47	NC_021278	GGGT	2	8	15312	15319	0 %	25 %	75 %	0 %	507423916
48	NC_021278	CGAG	2	8	15605	15612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021278	CGGT	2	8	15890	15897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021278	TGCG	2	8	16062	16069	0 %	25 %	50 %	25 %	507423917
51	NC_021278	CAGG	2	8	17013	17020	25 %	0 %	50 %	25 %	507423917
52	NC_021278	GTCG	2	8	17085	17092	0 %	25 %	50 %	25 %	507423917
53	NC_021278	GGTC	2	8	17832	17839	0 %	25 %	50 %	25 %	507423917
54	NC_021278	GGCG	2	8	18042	18049	0 %	0 %	75 %	25 %	507423918
55	NC_021278	GGTG	2	8	18248	18255	0 %	25 %	75 %	0 %	507423918
56	NC_021278	AAAT	2	8	19893	19900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021278	GGCC	2	8	20250	20257	0 %	0 %	50 %	50 %	507423920
58	NC_021278	CTGG	2	8	20262	20269	0 %	25 %	50 %	25 %	507423920
59	NC_021278	CGGG	2	8	20358	20365	0 %	0 %	75 %	25 %	507423920
60	NC_021278	GGGT	2	8	21033	21040	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021278	CCTG	2	8	22352	22359	0 %	25 %	25 %	50 %	507423921
62	NC_021278	GTCT	2	8	22665	22672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021278	GCTC	2	8	22763	22770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021278	GCAT	2	8	23306	23313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021278	GCCA	2	8	23576	23583	25 %	0 %	25 %	50 %	507423922
66	NC_021278	GATG	2	8	23847	23854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021278	TGAT	2	8	23965	23972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021278	TCAA	2	8	24073	24080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021278	GGCG	2	8	24435	24442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021278	GTCA	2	8	25291	25298	25 %	25 %	25 %	25 %	507423923
71	NC_021278	ATCG	2	8	26405	26412	25 %	25 %	25 %	25 %	507423924
72	NC_021278	ACTG	2	8	27407	27414	25 %	25 %	25 %	25 %	507423924
73	NC_021278	GGTC	2	8	27803	27810	0 %	25 %	50 %	25 %	507423925
74	NC_021278	ATCG	2	8	28074	28081	25 %	25 %	25 %	25 %	507423925
75	NC_021278	CGAT	2	8	28618	28625	25 %	25 %	25 %	25 %	507423925
76	NC_021278	GTGC	2	8	28828	28835	0 %	25 %	50 %	25 %	507423925
77	NC_021278	TCCG	2	8	29053	29060	0 %	25 %	25 %	50 %	507423925
78	NC_021278	CTCG	2	8	29757	29764	0 %	25 %	25 %	50 %	507423926
79	NC_021278	CCCG	2	8	30163	30170	0 %	0 %	25 %	75 %	507423926
80	NC_021278	CGGG	2	8	31367	31374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021278	ACCA	2	8	32509	32516	50 %	0 %	0 %	50 %	507423928
82	NC_021278	GCTG	2	8	32939	32946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021278	AGCC	2	8	33984	33991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021278	TCGG	2	8	34038	34045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021278	GGCC	2	8	35398	35405	0 %	0 %	50 %	50 %	507423931
86	NC_021278	TGAG	2	8	35492	35499	25 %	25 %	50 %	0 %	507423931
87	NC_021278	GACT	2	8	35750	35757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021278	TGAC	2	8	36184	36191	25 %	25 %	25 %	25 %	507423932
89	NC_021278	AGTG	2	8	36524	36531	25 %	25 %	50 %	0 %	507423932
90	NC_021278	GCCG	2	8	36784	36791	0 %	0 %	50 %	50 %	507423933
91	NC_021278	CTTC	2	8	38154	38161	0 %	50 %	0 %	50 %	507423934
92	NC_021278	GCTG	2	8	39193	39200	0 %	25 %	50 %	25 %	507423935
93	NC_021278	CGCA	2	8	39456	39463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021278	TGCT	2	8	39871	39878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021278	GCCG	2	8	40174	40181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021278	GCTG	2	8	40310	40317	0 %	25 %	50 %	25 %	507423936
97	NC_021278	CGGC	2	8	40393	40400	0 %	0 %	50 %	50 %	507423936
98	NC_021278	CAAC	2	8	42252	42259	50 %	0 %	0 %	50 %	507423937
99	NC_021278	CGCC	2	8	42358	42365	0 %	0 %	25 %	75 %	507423937
100	NC_021278	GGGT	2	8	44257	44264	0 %	25 %	75 %	0 %	507423939
101	NC_021278	CCCG	2	8	44338	44345	0 %	0 %	25 %	75 %	507423939
102	NC_021278	TCAC	2	8	45004	45011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021278	TTGC	2	8	46395	46402	0 %	50 %	25 %	25 %	507423942
104	NC_021278	CGGC	2	8	46575	46582	0 %	0 %	50 %	50 %	507423942
105	NC_021278	CGGC	2	8	46761	46768	0 %	0 %	50 %	50 %	507423942
106	NC_021278	GGTC	2	8	47946	47953	0 %	25 %	50 %	25 %	507423944
107	NC_021278	TGCC	2	8	48554	48561	0 %	25 %	25 %	50 %	507423944
108	NC_021278	CGAG	2	8	48878	48885	25 %	0 %	50 %	25 %	507423944
109	NC_021278	ACAA	2	8	49358	49365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021278	GACC	2	8	49906	49913	25 %	0 %	25 %	50 %	507423945
111	NC_021278	GCCG	2	8	50374	50381	0 %	0 %	50 %	50 %	507423945
112	NC_021278	GTGG	2	8	50870	50877	0 %	25 %	75 %	0 %	507423945
113	NC_021278	GCCA	2	8	52266	52273	25 %	0 %	25 %	50 %	507423946
114	NC_021278	GGCC	2	8	52947	52954	0 %	0 %	50 %	50 %	507423947
115	NC_021278	AACC	2	8	53476	53483	50 %	0 %	0 %	50 %	507423947
116	NC_021278	GCAC	2	8	53618	53625	25 %	0 %	25 %	50 %	507423947
117	NC_021278	GCTC	2	8	53666	53673	0 %	25 %	25 %	50 %	507423947
118	NC_021278	CCGA	2	8	53766	53773	25 %	0 %	25 %	50 %	507423947
119	NC_021278	GGCG	2	8	54888	54895	0 %	0 %	75 %	25 %	507423948
120	NC_021278	GGTT	2	8	54993	55000	0 %	50 %	50 %	0 %	507423948
121	NC_021278	CCGC	2	8	55021	55028	0 %	0 %	25 %	75 %	507423948
122	NC_021278	GCCG	2	8	56839	56846	0 %	0 %	50 %	50 %	507423950
123	NC_021278	CTTC	2	8	57577	57584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021278	CGAA	2	8	57967	57974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021278	CTTG	2	8	58116	58123	0 %	50 %	25 %	25 %	507423952
126	NC_021278	TGCC	2	8	58496	58503	0 %	25 %	25 %	50 %	507423952
127	NC_021278	CAAT	2	8	58730	58737	50 %	25 %	0 %	25 %	507423952
128	NC_021278	GGCC	2	8	58880	58887	0 %	0 %	50 %	50 %	507423952
129	NC_021278	GGCG	2	8	59090	59097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021278	ACCT	2	8	59773	59780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021278	CGAG	2	8	60295	60302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021278	CGGC	2	8	60872	60879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021278	CAGC	2	8	60897	60904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021278	GGGT	2	8	61078	61085	0 %	25 %	75 %	0 %	507423953
135	NC_021278	GCGG	2	8	62678	62685	0 %	0 %	75 %	25 %	507423954
136	NC_021278	GGCG	2	8	62851	62858	0 %	0 %	75 %	25 %	507423954
137	NC_021278	CGAC	2	8	63070	63077	25 %	0 %	25 %	50 %	507423954
138	NC_021278	CCGG	2	8	63114	63121	0 %	0 %	50 %	50 %	507423954
139	NC_021278	CACC	2	8	63220	63227	25 %	0 %	0 %	75 %	507423954
140	NC_021278	TTAC	2	8	63390	63397	25 %	50 %	0 %	25 %	507423954
141	NC_021278	CCGG	2	8	63447	63454	0 %	0 %	50 %	50 %	507423954
142	NC_021278	CCGG	2	8	64701	64708	0 %	0 %	50 %	50 %	507423955
143	NC_021278	GCTG	2	8	65041	65048	0 %	25 %	50 %	25 %	507423956
144	NC_021278	ACTC	2	8	65357	65364	25 %	25 %	0 %	50 %	507423956
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419	NC_021278	CATA	3	12	171386	171397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
420	NC_021278	TTAC	2	8	171403	171410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
421	NC_021278	GTAT	2	8	171417	171424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
422	NC_021278	GGCC	2	8	171933	171940	0 %	0 %	50 %	50 %	507424051
423	NC_021278	ACGT	2	8	172070	172077	25 %	25 %	25 %	25 %	507424051
424	NC_021278	GCAC	2	8	172191	172198	25 %	0 %	25 %	50 %	507424051
425	NC_021278	CCGA	2	8	172386	172393	25 %	0 %	25 %	50 %	507424052
426	NC_021278	CCGC	2	8	172419	172426	0 %	0 %	25 %	75 %	507424052
427	NC_021278	GCCG	2	8	172469	172476	0 %	0 %	50 %	50 %	507424052

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.