MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 1

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021278	TACC	2	8	11941	11948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021278	AGCA	2	8	14409	14416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021278	GACA	2	8	14488	14495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021278	ACTG	2	8	14542	14549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021278	CGAG	2	8	15605	15612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021278	CGGT	2	8	15890	15897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021278	AAAT	2	8	19893	19900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021278	GGGT	2	8	21033	21040	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021278	GTCT	2	8	22665	22672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021278	GCTC	2	8	22763	22770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021278	GCAT	2	8	23306	23313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021278	GATG	2	8	23847	23854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021278	TGAT	2	8	23965	23972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021278	TCAA	2	8	24073	24080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021278	GGCG	2	8	24435	24442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021278	CGGG	2	8	31367	31374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021278	GCTG	2	8	32939	32946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021278	AGCC	2	8	33984	33991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021278	TCGG	2	8	34038	34045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021278	GACT	2	8	35750	35757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021278	CGCA	2	8	39456	39463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021278	TGCT	2	8	39871	39878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021278	GCCG	2	8	40174	40181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021278	TCAC	2	8	45004	45011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021278	ACAA	2	8	49358	49365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021278	CTTC	2	8	57577	57584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021278	CGAA	2	8	57967	57974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021278	GGCG	2	8	59090	59097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021278	ACCT	2	8	59773	59780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021278	CGAG	2	8	60295	60302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021278	CGGC	2	8	60872	60879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021278	CAGC	2	8	60897	60904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021278	CGCA	2	8	67230	67237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021278	AATT	2	8	69877	69884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021278	GCAC	2	8	73466	73473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021278	CACC	2	8	75316	75323	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_021278	CCCG	3	12	75856	75867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_021278	CGAA	2	8	75928	75935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021278	CCAT	2	8	78514	78521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021278	CTGC	2	8	78542	78549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021278	CAAG	2	8	78680	78687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021278	ACCG	2	8	78742	78749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021278	CAGC	2	8	79305	79312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021278	GGCA	2	8	79771	79778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021278	CGGG	2	8	80505	80512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021278	GCAT	2	8	89795	89802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021278	ATTG	2	8	89821	89828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021278	GTGC	2	8	89861	89868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021278	GATG	2	8	90845	90852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021278	ACGG	2	8	91104	91111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021278	AGGC	2	8	99382	99389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021278	TCGC	2	8	102455	102462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021278	AGAC	2	8	113215	113222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021278	GGCG	2	8	113257	113264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021278	GCTC	2	8	115213	115220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021278	ACCA	2	8	116081	116088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021278	GGTT	2	8	116195	116202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021278	CCCG	2	8	117725	117732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_021278	ACAT	2	8	117756	117763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021278	ACCG	2	8	119031	119038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021278	CGAC	2	8	119405	119412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021278	TCCG	2	8	119518	119525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021278	TCCT	2	8	119547	119554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021278	GATA	2	8	120509	120516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021278	TTCA	2	8	120561	120568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021278	GACC	2	8	120569	120576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021278	TCGC	2	8	120670	120677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021278	ATTG	2	8	120962	120969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021278	GAAC	2	8	121133	121140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021278	TGCC	2	8	126165	126172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021278	CCGG	2	8	130710	130717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021278	CATT	2	8	140476	140483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021278	GGAG	2	8	148099	148106	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021278	GGAC	2	8	148212	148219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021278	GACA	2	8	150925	150932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021278	GGTG	2	8	151621	151628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021278	GTGC	2	8	152468	152475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021278	ACCC	2	8	153793	153800	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_021278	GCCG	2	8	156850	156857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021278	CACG	2	8	157738	157745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021278	CGGC	2	8	158206	158213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021278	CAGT	2	8	160213	160220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021278	CCAC	2	8	160325	160332	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_021278	ATCC	2	8	165429	165436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021278	CGTG	2	8	165618	165625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021278	GATC	2	8	166299	166306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021278	CCAC	2	8	166599	166606	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_021278	ACCT	2	8	168055	168062	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021278	CGCC	2	8	168193	168200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_021278	CGCA	2	8	168506	168513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021278	CCGC	2	8	169645	169652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_021278	CATA	3	12	171386	171397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021278	TTAC	2	8	171403	171410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021278	GTAT	2	8	171417	171424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.