MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Fusobacterium sp. 4_8 plasmid

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021277	TTC	2	6	83	88	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021277	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382353
3	NC_021277	TCA	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382353
4	NC_021277	TCA	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382353
5	NC_021277	GTA	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021277	TAA	2	6	437	442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021277	ATT	2	6	471	476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021277	ATT	2	6	605	610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021277	CAA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021277	TAA	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382354
11	NC_021277	GAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382354
12	NC_021277	TTA	3	9	764	772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382354
13	NC_021277	GAT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
14	NC_021277	ATA	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382354
15	NC_021277	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
16	NC_021277	TAG	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
17	NC_021277	ATT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
18	NC_021277	GAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382355
19	NC_021277	ATA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
20	NC_021277	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
21	NC_021277	ATA	2	6	1390	1395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
22	NC_021277	AAG	3	9	1471	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
23	NC_021277	GAA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
24	NC_021277	GAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
25	NC_021277	AGA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
26	NC_021277	GAA	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
27	NC_021277	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
28	NC_021277	GAA	2	6	1707	1712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
29	NC_021277	ATA	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
30	NC_021277	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
31	NC_021277	AAG	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
32	NC_021277	GAA	2	6	1953	1958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
33	NC_021277	TTA	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
34	NC_021277	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
35	NC_021277	AAG	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
36	NC_021277	TAA	2	6	2053	2058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
37	NC_021277	TAA	2	6	2153	2158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
38	NC_021277	ATA	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
39	NC_021277	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
40	NC_021277	ATA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
41	NC_021277	GAA	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
42	NC_021277	AGA	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
43	NC_021277	TAA	2	6	2594	2599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
44	NC_021277	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
45	NC_021277	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382355
46	NC_021277	GAA	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
47	NC_021277	AAT	2	6	2769	2774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
48	NC_021277	AGA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
49	NC_021277	AGA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
50	NC_021277	AGA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
51	NC_021277	TTA	2	6	3159	3164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
52	NC_021277	GAA	3	9	3201	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
53	NC_021277	GAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
54	NC_021277	AGA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
55	NC_021277	ATG	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382356
56	NC_021277	AGA	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
57	NC_021277	AGA	2	6	3600	3605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
58	NC_021277	GAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
59	NC_021277	TAA	2	6	3765	3770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
60	NC_021277	AGA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
61	NC_021277	AGA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
62	NC_021277	AAG	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
63	NC_021277	ATA	2	6	3962	3967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
64	NC_021277	TGA	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382356
65	NC_021277	AAT	2	6	4015	4020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
66	NC_021277	TAA	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
67	NC_021277	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
68	NC_021277	AAT	3	9	4146	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
69	NC_021277	ATT	2	6	4239	4244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382356
70	NC_021277	GAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
71	NC_021277	TTA	2	6	4312	4317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021277	AAC	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021277	TAT	2	6	4383	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021277	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021277	ACT	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021277	TAC	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021277	ATT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021277	ATA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021277	ATA	2	6	4694	4699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021277	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021277	TCA	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021277	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021277	AGA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382357
84	NC_021277	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382357
85	NC_021277	TAA	2	6	5236	5241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382357
86	NC_021277	ATT	2	6	5331	5336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
87	NC_021277	ATG	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382358
88	NC_021277	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
89	NC_021277	TAA	2	6	5608	5613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382358
90	NC_021277	TAT	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
91	NC_021277	TAA	3	9	5746	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382358
92	NC_021277	GAA	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382358
93	NC_021277	ATG	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382359
94	NC_021277	AGA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382360
95	NC_021277	TAA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382360
96	NC_021277	GTG	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507382360
97	NC_021277	GAA	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382360
98	NC_021277	ATT	2	6	6350	6355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382360
99	NC_021277	GAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382361
100	NC_021277	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382361
101	NC_021277	TAA	2	6	6583	6588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382361
102	NC_021277	AAT	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382361
103	NC_021277	GAA	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021277	TAA	2	6	6919	6924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382362
105	NC_021277	TAG	2	6	7018	7023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382362
106	NC_021277	GAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382362
107	NC_021277	TAA	2	6	7201	7206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382362
108	NC_021277	TAA	2	6	7208	7213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382362
109	NC_021277	AGT	2	6	7223	7228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382362
110	NC_021277	AAC	2	6	7310	7315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382362
111	NC_021277	AGA	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382363
112	NC_021277	AGA	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382363
113	NC_021277	ATA	2	6	7494	7499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382363
114	NC_021277	TTA	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382363
115	NC_021277	TAA	2	6	7572	7577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382363
116	NC_021277	CAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382363
117	NC_021277	AGA	2	6	7642	7647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382363
118	NC_021277	ATT	2	6	7654	7659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382363
119	NC_021277	TAT	2	6	7769	7774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021277	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021277	TGT	2	6	7883	7888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021277	TAA	2	6	7912	7917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021277	TAA	2	6	7925	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021277	AGG	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021277	AAT	2	6	7967	7972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021277	AAC	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382364
127	NC_021277	GAA	2	6	8029	8034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382364
128	NC_021277	TTC	2	6	8162	8167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507382364
129	NC_021277	TAA	2	6	8246	8251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021277	TAT	2	6	8321	8326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021277	ACC	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021277	AGT	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021277	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021277	ATA	2	6	8475	8480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021277	AGG	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021277	TAA	2	6	8563	8568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021277	TTA	2	6	8577	8582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.