MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Fusobacterium sp. 4_8 plasmid

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021277	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382353
2	NC_021277	TCA	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382353
3	NC_021277	TCA	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382353
4	NC_021277	TAA	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382354
5	NC_021277	GAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382354
6	NC_021277	TTA	3	9	764	772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382354
7	NC_021277	GAT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
8	NC_021277	ATA	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382354
9	NC_021277	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
10	NC_021277	TAG	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
11	NC_021277	ATT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
12	NC_021277	GAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382355
13	NC_021277	ATA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
14	NC_021277	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
15	NC_021277	ATA	2	6	1390	1395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
16	NC_021277	AAG	3	9	1471	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
17	NC_021277	GAA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
18	NC_021277	GAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
19	NC_021277	AGA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
20	NC_021277	GAA	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
21	NC_021277	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
22	NC_021277	GAA	2	6	1707	1712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
23	NC_021277	ATA	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
24	NC_021277	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
25	NC_021277	AAG	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
26	NC_021277	GAA	2	6	1953	1958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
27	NC_021277	TTA	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
28	NC_021277	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
29	NC_021277	AAG	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
30	NC_021277	TAA	2	6	2053	2058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
31	NC_021277	TAA	2	6	2153	2158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
32	NC_021277	ATA	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
33	NC_021277	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
34	NC_021277	ATA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
35	NC_021277	GAA	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
36	NC_021277	AGA	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
37	NC_021277	TAA	2	6	2594	2599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
38	NC_021277	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
39	NC_021277	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382355
40	NC_021277	GAA	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
41	NC_021277	AAT	2	6	2769	2774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
42	NC_021277	AGA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
43	NC_021277	AGA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
44	NC_021277	AGA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
45	NC_021277	TTA	2	6	3159	3164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
46	NC_021277	GAA	3	9	3201	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
47	NC_021277	GAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
48	NC_021277	AGA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
49	NC_021277	ATG	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382356
50	NC_021277	AGA	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
51	NC_021277	AGA	2	6	3600	3605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
52	NC_021277	GAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
53	NC_021277	TAA	2	6	3765	3770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
54	NC_021277	AGA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
55	NC_021277	AGA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
56	NC_021277	AAG	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
57	NC_021277	ATA	2	6	3962	3967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
58	NC_021277	TGA	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382356
59	NC_021277	AAT	2	6	4015	4020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
60	NC_021277	TAA	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
61	NC_021277	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
62	NC_021277	AAT	3	9	4146	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
63	NC_021277	ATT	2	6	4239	4244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382356
64	NC_021277	GAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
65	NC_021277	AGA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382357
66	NC_021277	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382357
67	NC_021277	TAA	2	6	5236	5241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382357
68	NC_021277	ATT	2	6	5331	5336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
69	NC_021277	ATG	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382358
70	NC_021277	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
71	NC_021277	TAA	2	6	5608	5613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382358
72	NC_021277	TAT	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
73	NC_021277	TAA	3	9	5746	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382358
74	NC_021277	GAA	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382358
75	NC_021277	ATG	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382359
76	NC_021277	AGA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382360
77	NC_021277	TAA	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382360
78	NC_021277	GTG	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507382360
79	NC_021277	GAA	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382360
80	NC_021277	ATT	2	6	6350	6355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382360
81	NC_021277	GAA	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382361
82	NC_021277	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382361
83	NC_021277	TAA	2	6	6583	6588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382361
84	NC_021277	AAT	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382361
85	NC_021277	TAA	2	6	6919	6924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382362
86	NC_021277	TAG	2	6	7018	7023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382362
87	NC_021277	GAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382362
88	NC_021277	TAA	2	6	7201	7206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382362
89	NC_021277	TAA	2	6	7208	7213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382362
90	NC_021277	AGT	2	6	7223	7228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382362
91	NC_021277	AAC	2	6	7310	7315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382362
92	NC_021277	AGA	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382363
93	NC_021277	AGA	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382363
94	NC_021277	ATA	2	6	7494	7499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382363
95	NC_021277	TTA	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382363
96	NC_021277	TAA	2	6	7572	7577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382363
97	NC_021277	CAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382363
98	NC_021277	AGA	2	6	7642	7647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382363
99	NC_021277	ATT	2	6	7654	7659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382363
100	NC_021277	AAC	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382364
101	NC_021277	GAA	2	6	8029	8034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382364
102	NC_021277	TTC	2	6	8162	8167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507382364
103	NC_021277	ATT	2	6	8776	8781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382365
104	NC_021277	TAT	2	6	8806	8811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382365
105	NC_021277	CTA	2	6	8848	8853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382365
106	NC_021277	AAT	3	9	9038	9046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382365
107	NC_021277	ATA	3	9	9990	9998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382366
108	NC_021277	TAA	2	6	10018	10023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382366
109	NC_021277	GAA	2	6	10094	10099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382366
110	NC_021277	GAA	2	6	10149	10154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382366
111	NC_021277	CTT	2	6	10160	10165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507382366
112	NC_021277	AGA	3	9	10174	10182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382366
113	NC_021277	AAC	2	6	10192	10197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382366
114	NC_021277	ATA	2	6	10551	10556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382367
115	NC_021277	ACC	2	6	10726	10731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507382367
116	NC_021277	TGA	2	6	10766	10771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382367
117	NC_021277	TTA	2	6	10804	10809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382367
118	NC_021277	TGA	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382367
119	NC_021277	TTG	2	6	10862	10867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507382367
120	NC_021277	AGA	2	6	11063	11068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382367
121	NC_021277	ATT	2	6	11221	11226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382367
122	NC_021277	TCA	2	6	11246	11251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382367
123	NC_021277	ATC	2	6	11288	11293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382367
124	NC_021277	TAG	2	6	11308	11313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382367
125	NC_021277	AGA	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382367
126	NC_021277	TGG	2	6	11467	11472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507382367
127	NC_021277	AGA	2	6	11477	11482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382367
128	NC_021277	ATA	2	6	11538	11543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382367
129	NC_021277	TGG	2	6	11579	11584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507382367
130	NC_021277	AGA	2	6	11618	11623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382367
131	NC_021277	AGA	2	6	11642	11647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382367
132	NC_021277	TAT	2	6	11667	11672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382367
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.