MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 180576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021252	CAG	2	6	242006	242011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928786
5002	NC_021252	ACG	2	6	242025	242030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928786
5003	NC_021252	GCC	2	6	242035	242040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928786
5004	NC_021252	TCG	2	6	242143	242148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928786
5005	NC_021252	GTC	2	6	242150	242155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928786
5006	NC_021252	GCC	2	6	242232	242237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928786
5007	NC_021252	GAT	2	6	242303	242308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928786
5008	NC_021252	CGA	2	6	242353	242358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928786
5009	NC_021252	TCG	2	6	242361	242366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928786
5010	NC_021252	TCG	2	6	242441	242446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928787
5011	NC_021252	CTT	2	6	242509	242514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928787
5012	NC_021252	CGC	2	6	242602	242607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928787
5013	NC_021252	CGA	2	6	242706	242711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928787
5014	NC_021252	TGG	2	6	242772	242777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928787
5015	NC_021252	CCG	2	6	242790	242795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928787
5016	NC_021252	ACG	2	6	242825	242830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928787
5017	NC_021252	GCG	2	6	242835	242840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928787
5018	NC_021252	CGG	2	6	242842	242847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928787
5019	NC_021252	GTC	2	6	242863	242868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928787
5020	NC_021252	CGC	2	6	242911	242916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928787
5021	NC_021252	CTT	2	6	242944	242949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928787
5022	NC_021252	CGT	2	6	242979	242984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928787
5023	NC_021252	CGC	2	6	243126	243131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_021252	TCG	2	6	243155	243160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021252	GGC	2	6	243370	243375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928788
5026	NC_021252	CGG	2	6	243378	243383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928788
5027	NC_021252	GCG	2	6	243414	243419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928788
5028	NC_021252	GGA	2	6	243541	243546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928788
5029	NC_021252	CGG	2	6	243566	243571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928788
5030	NC_021252	CGC	2	6	243682	243687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928788
5031	NC_021252	ACG	2	6	243749	243754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928788
5032	NC_021252	CGG	2	6	243795	243800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928788
5033	NC_021252	GCC	2	6	243973	243978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928788
5034	NC_021252	AGC	3	9	243980	243988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928788
5035	NC_021252	GCC	2	6	244164	244169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928789
5036	NC_021252	TCG	2	6	244186	244191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928789
5037	NC_021252	GCG	2	6	244271	244276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
5038	NC_021252	GAT	2	6	244347	244352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928789
5039	NC_021252	GCG	2	6	244379	244384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
5040	NC_021252	GGT	2	6	244454	244459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928789
5041	NC_021252	TTC	2	6	244495	244500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928789
5042	NC_021252	GTA	2	6	244512	244517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928789
5043	NC_021252	GGC	2	6	244630	244635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
5044	NC_021252	GGC	2	6	244671	244676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
5045	NC_021252	GAG	2	6	244720	244725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928789
5046	NC_021252	TCG	2	6	244771	244776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928789
5047	NC_021252	GAT	2	6	244851	244856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928789
5048	NC_021252	CGG	2	6	244940	244945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928789
5049	NC_021252	GTG	2	6	244992	244997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928789
5050	NC_021252	CGC	2	6	245027	245032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928789
5051	NC_021252	GCA	2	6	245057	245062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928789
5052	NC_021252	CGA	2	6	245132	245137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928789
5053	NC_021252	GCC	2	6	245196	245201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928789
5054	NC_021252	CAG	2	6	245467	245472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021252	GTG	2	6	245489	245494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928790
5056	NC_021252	GCA	2	6	245522	245527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928790
5057	NC_021252	TCC	2	6	245534	245539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928790
5058	NC_021252	GCT	2	6	245545	245550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928790
5059	NC_021252	CGG	2	6	245578	245583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928790
5060	NC_021252	CAC	2	6	245689	245694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928790
5061	NC_021252	CTT	2	6	245701	245706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928790
5062	NC_021252	AGG	2	6	245742	245747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928790
5063	NC_021252	GGT	2	6	245762	245767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928790
5064	NC_021252	TGC	2	6	245823	245828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928790
5065	NC_021252	GTC	2	6	245870	245875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928790
5066	NC_021252	GTC	2	6	245921	245926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928790
5067	NC_021252	GAG	2	6	245960	245965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928790
5068	NC_021252	GCC	2	6	245990	245995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928791
5069	NC_021252	CGA	2	6	246034	246039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928791
5070	NC_021252	CCG	2	6	246153	246158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928791
5071	NC_021252	CGT	2	6	246283	246288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928791
5072	NC_021252	GTC	2	6	246344	246349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928791
5073	NC_021252	GCC	2	6	246350	246355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928791
5074	NC_021252	GTC	2	6	246359	246364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928791
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5076	NC_021252	ACG	2	6	246417	246422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928791
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5081	NC_021252	TCG	2	6	246648	246653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928791
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5089	NC_021252	GCA	2	6	246982	246987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928791
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5102	NC_021252	CGA	2	6	247489	247494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928791
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5105	NC_021252	TGG	2	6	247679	247684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928791
5106	NC_021252	CCG	2	6	247704	247709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928791
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5108	NC_021252	GAT	2	6	248073	248078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928792
5109	NC_021252	CTC	2	6	248079	248084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928792
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5118	NC_021252	GGC	2	6	248433	248438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928792
5119	NC_021252	GTG	2	6	248523	248528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928792
5120	NC_021252	ATC	2	6	248535	248540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928792
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5122	NC_021252	TCG	2	6	248584	248589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928792
5123	NC_021252	TCG	2	6	248680	248685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928792
5124	NC_021252	CGC	2	6	248735	248740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928792
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5132	NC_021252	CTG	2	6	248985	248990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928792
5133	NC_021252	CGC	2	6	248993	248998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928792
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5160	NC_021252	TAG	2	6	250257	250262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5237	NC_021252	CGC	2	6	253549	253554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928798
5238	NC_021252	CGA	2	6	253603	253608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
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5241	NC_021252	GCG	2	6	253674	253679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928798
5242	NC_021252	GAC	2	6	253724	253729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928798
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5322	NC_021252	TCG	2	6	257733	257738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928804
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5346	NC_021252	GCC	2	6	258928	258933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
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5350	NC_021252	CGT	2	6	258973	258978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928805
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5352	NC_021252	CAG	3	9	259045	259053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928805
5353	NC_021252	ACC	2	6	259127	259132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928805
5354	NC_021252	GCC	2	6	259151	259156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
5355	NC_021252	GCC	3	9	259160	259168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
5356	NC_021252	GCC	2	6	259216	259221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
5357	NC_021252	GCC	2	6	259229	259234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
5358	NC_021252	CGG	2	6	259239	259244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928805
5359	NC_021252	CGA	2	6	259248	259253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928805
5360	NC_021252	TCG	2	6	259277	259282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928805
5361	NC_021252	GCC	2	6	259298	259303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
5362	NC_021252	CGG	2	6	259347	259352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928805
5363	NC_021252	GCC	2	6	259357	259362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928805
5364	NC_021252	CGG	2	6	259398	259403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928805
5365	NC_021252	GGT	2	6	259408	259413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928805
5366	NC_021252	GCA	2	6	259428	259433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928805
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5368	NC_021252	GAC	2	6	259634	259639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5369	NC_021252	GCG	2	6	259664	259669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928806
5370	NC_021252	CGT	2	6	259672	259677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5371	NC_021252	ATC	2	6	259686	259691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928806
5372	NC_021252	CGC	2	6	259807	259812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928806
5373	NC_021252	GCC	2	6	259917	259922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928806
5374	NC_021252	GAA	2	6	259931	259936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928806
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5376	NC_021252	CGA	2	6	260104	260109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5377	NC_021252	CTT	2	6	260111	260116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928806
5378	NC_021252	TGC	2	6	260148	260153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5379	NC_021252	CGA	2	6	260158	260163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5380	NC_021252	GCG	3	9	260220	260228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928806
5381	NC_021252	CAC	2	6	260231	260236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928806
5382	NC_021252	GGC	3	9	260266	260274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928806
5383	NC_021252	CTG	2	6	260324	260329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5384	NC_021252	TCG	2	6	260352	260357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928806
5385	NC_021252	TGA	2	6	260407	260412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928806
5386	NC_021252	CCG	2	6	260436	260441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928806
5387	NC_021252	CAT	2	6	260513	260518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5388	NC_021252	GTC	2	6	260643	260648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928807
5389	NC_021252	GCC	3	9	260652	260660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928807
5390	NC_021252	CGT	2	6	260681	260686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928807
5391	NC_021252	CGA	3	9	260708	260716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928807
5392	NC_021252	GAG	2	6	260727	260732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928807
5393	NC_021252	GCC	2	6	260733	260738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928807
5394	NC_021252	CGA	2	6	260771	260776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928807
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5397	NC_021252	GCT	2	6	260852	260857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928807
5398	NC_021252	CAC	2	6	260924	260929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928807
5399	NC_021252	CTG	2	6	261094	261099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928807
5400	NC_021252	GGT	2	6	261194	261199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928807
5401	NC_021252	TGC	2	6	261205	261210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928807
5402	NC_021252	GCG	2	6	261228	261233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928807
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5422	NC_021252	CGT	2	6	262164	262169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928808
5423	NC_021252	CGT	2	6	262171	262176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928808
5424	NC_021252	GAC	2	6	262225	262230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928808
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5432	NC_021252	TCG	2	6	262718	262723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928809
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5459	NC_021252	CGT	2	6	264166	264171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5460	NC_021252	CGA	2	6	264220	264225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928811
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5463	NC_021252	CGG	2	6	264538	264543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928811
5464	NC_021252	CGT	3	9	264565	264573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928811
5465	NC_021252	CGA	2	6	264606	264611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928811
5466	NC_021252	CGG	2	6	264697	264702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928811
5467	NC_021252	TGC	2	6	264777	264782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928811
5468	NC_021252	GAA	2	6	264830	264835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928811
5469	NC_021252	GGC	2	6	264850	264855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928811
5470	NC_021252	GCG	2	6	264882	264887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928811
5471	NC_021252	GAT	2	6	264901	264906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928811
5472	NC_021252	GGA	2	6	265018	265023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928811
5473	NC_021252	CGA	2	6	265036	265041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928811
5474	NC_021252	CGC	2	6	265105	265110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928811
5475	NC_021252	CGC	3	9	265131	265139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928811
5476	NC_021252	CGT	2	6	265225	265230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928811
5477	NC_021252	CTT	2	6	265309	265314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928811
5478	NC_021252	GCT	2	6	265339	265344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5479	NC_021252	CGC	2	6	265429	265434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928812
5480	NC_021252	GCG	2	6	265455	265460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928812
5481	NC_021252	CCG	2	6	265477	265482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928812
5482	NC_021252	CGC	2	6	265491	265496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928812
5483	NC_021252	CGC	2	6	265517	265522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928812
5484	NC_021252	CTG	2	6	265526	265531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928812
5485	NC_021252	CGA	2	6	265579	265584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928812
5486	NC_021252	TGG	2	6	265713	265718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928812
5487	NC_021252	CGT	2	6	265744	265749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928812
5488	NC_021252	GCG	2	6	265753	265758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928812
5489	NC_021252	CCT	2	6	265768	265773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928812
5490	NC_021252	CAG	2	6	265775	265780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928812
5491	NC_021252	ATC	2	6	265788	265793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928812
5492	NC_021252	TTC	2	6	265820	265825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928812
5493	NC_021252	TCC	2	6	265845	265850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928812
5494	NC_021252	CTC	2	6	265856	265861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928812
5495	NC_021252	GCG	2	6	265881	265886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928812
5496	NC_021252	CGA	2	6	265921	265926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928812
5497	NC_021252	CCA	2	6	265927	265932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928812
5498	NC_021252	CCG	3	9	265950	265958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928812
5499	NC_021252	GGT	2	6	265967	265972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928812
5500	NC_021252	TCG	2	6	266073	266078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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