MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021251	ACCGCG	2	12	32428	32439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021251	CGTCGG	2	12	68250	68261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021251	CAACGG	2	12	77773	77784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021251	CTCGGT	2	12	147475	147486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021251	AGATTC	2	12	328631	328642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021251	GGTCGC	2	12	340472	340483	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021251	GCCAGC	2	12	443654	443665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021251	CCGATA	2	12	474816	474827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021251	ATAGTC	2	12	541307	541318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021251	ACCAGT	2	12	589310	589321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021251	CGCCGT	2	12	718315	718326	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021251	CGCGGG	2	12	828799	828810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021251	CCGGCG	2	12	862008	862019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021251	ACCGGG	2	12	868729	868740	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021251	GCGGCC	2	12	906978	906989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021251	ACAGCA	2	12	908351	908362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021251	CTGGGT	2	12	923187	923198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021251	CAGTCG	2	12	930634	930645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021251	TCGGGT	2	12	964135	964146	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021251	GAGCGG	2	12	1022790	1022801	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021251	CAACGG	2	12	1027930	1027941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021251	GATCGA	2	12	1027981	1027992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021251	GACTGC	2	12	1032385	1032396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021251	CGCCGG	2	12	1051246	1051257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021251	GGCGCA	2	12	1095125	1095136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021251	CAATGC	2	12	1122217	1122228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021251	TTGGTG	2	12	1150353	1150364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021251	TTCCGT	2	12	1161046	1161057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021251	GTTGGC	2	12	1167608	1167619	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021251	TAGCCA	2	12	1194982	1194993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021251	AGTTAC	2	12	1220673	1220684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021251	CAGCAC	2	12	1368751	1368762	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021251	TCGACA	2	12	1368836	1368847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021251	CCGAGT	2	12	1419817	1419828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021251	CACGCG	2	12	1526579	1526590	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021251	ATATTC	2	12	1562962	1562973	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021251	GCCCCT	2	12	1636381	1636392	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021251	GCCCCT	2	12	1640163	1640174	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021251	CGAGTG	2	12	1784185	1784196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021251	GGCGCC	2	12	1830410	1830421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021251	CCGCGG	2	12	1894155	1894166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021251	TAGCGG	2	12	1921316	1921327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021251	ACCGCA	2	12	1923253	1923264	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021251	GCTGGG	2	12	1980835	1980846	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021251	GGTGAT	2	12	2027073	2027084	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021251	TTCGGC	2	12	2040982	2040993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021251	AGAGGG	2	12	2061116	2061127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021251	ACCGTG	2	12	2127588	2127599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021251	GCTGGG	2	12	2130219	2130230	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021251	CGCGAG	2	12	2164224	2164235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021251	CGGTTG	2	12	2223135	2223146	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021251	GCCGCA	2	12	2226039	2226050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021251	CGGCTC	2	12	2255351	2255362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021251	TTCTAT	2	12	2366954	2366965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021251	CTCAAC	2	12	2411033	2411044	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021251	CCGCTG	2	12	2431640	2431651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021251	CACCGC	2	12	2440097	2440108	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021251	GCGTCG	2	12	2492355	2492366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021251	CACGAC	2	12	2510525	2510536	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021251	GCAACC	2	12	2630068	2630079	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021251	CACGTG	2	12	2711493	2711504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021251	GAGGTC	2	12	2715105	2715116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021251	CCGGCA	2	12	2728922	2728933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021251	TCAAAC	2	12	2788863	2788874	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021251	GCACCC	2	12	2816931	2816942	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021251	CGACGG	2	12	2865206	2865217	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021251	GCCCGA	2	12	2872304	2872315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021251	GTATTG	2	12	2910740	2910751	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021251	CCGTTG	2	12	2920676	2920687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021251	GGCGCC	2	12	2940364	2940375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021251	CGGAAG	2	12	2947833	2947844	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021251	CGACTC	2	12	2974820	2974831	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021251	CATATT	2	12	3008514	3008525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021251	CCGGCA	2	12	3073941	3073952	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021251	CGTTGC	2	12	3094955	3094966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021251	GTCGAA	2	12	3116761	3116772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021251	TCGCCG	2	12	3280625	3280636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021251	TCGCCG	2	12	3280682	3280693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021251	CGCCAC	2	12	3296709	3296720	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021251	GGCCGG	2	12	3302408	3302419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021251	CGTAGG	2	12	3371354	3371365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021251	CGATGC	2	12	3405292	3405303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021251	TGTACA	2	12	3420604	3420615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021251	ACCAAC	2	12	3425953	3425964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021251	CCGTTG	2	12	3447651	3447662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021251	GCTCCT	2	12	3478029	3478040	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021251	TCCGCT	2	12	3541153	3541164	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021251	GCCTCC	2	12	3633029	3633040	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021251	CCCAAA	2	12	3703166	3703177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021251	GCGCAG	2	12	3776764	3776775	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021251	TGTACA	2	12	3797471	3797482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021251	TCCTCT	2	12	3882950	3882961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021251	TCGGAG	2	12	3907287	3907298	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021251	CCGCTC	2	12	3911316	3911327	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021251	CGTTGG	2	12	3923956	3923967	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021251	CGGCCG	2	12	3928096	3928107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021251	CGCCGG	2	12	3930677	3930688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021251	CGCCAA	2	12	3931219	3931230	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021251	CGGCAA	2	12	3932138	3932149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021251	CGGCAA	2	12	3945631	3945642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021251	GGCCGG	2	12	3946000	3946011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021251	CGGCGA	2	12	4010746	4010757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021251	CGAACA	2	12	4018530	4018541	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021251	GGCGAG	2	12	4113125	4113136	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021251	GCGCCG	2	12	4153868	4153879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021251	TGGCGG	2	12	4201920	4201931	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021251	CTCATC	2	12	4269369	4269380	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021251	GGGTTG	2	12	4326636	4326647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.