MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	ATTGAA	2	12	223	234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501675885
2	NC_021236	AAATTA	2	12	1742	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675886
3	NC_021236	ATAAAA	2	12	5925	5936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675889
4	NC_021236	AAATGA	2	12	9076	9087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501675890
5	NC_021236	TGATAT	2	12	10397	10408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675891
6	NC_021236	TTTTTC	2	12	13332	13343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675893
7	NC_021236	AAAATA	2	12	15582	15593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675894
8	NC_021236	CTTTAT	2	12	17992	18003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501675895
9	NC_021236	TTGCTT	2	12	18455	18466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501675896
10	NC_021236	AAATTT	2	12	18584	18595	50 %	50 %	0 %	0 %	501675896
11	NC_021236	TTTTAT	2	12	18787	18798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675897
12	NC_021236	AAACAT	2	12	23383	23394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501675902
13	NC_021236	TATTTT	2	12	24108	24119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675903
14	NC_021236	TAAATT	2	12	26075	26086	50 %	50 %	0 %	0 %	501675904
15	NC_021236	ATCTTT	2	12	27194	27205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501675905
16	NC_021236	TTTTCC	2	12	27244	27255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675905
17	NC_021236	AGATTC	2	12	27560	27571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	501675905
18	NC_021236	TTTTCT	2	12	27882	27893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675905
19	NC_021236	CTAAAC	2	12	28802	28813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501675906
20	NC_021236	AAATAG	2	12	29902	29913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501675907
21	NC_021236	TTATTT	2	12	30138	30149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675907
22	NC_021236	AAACCA	2	12	32453	32464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675909
23	NC_021236	TGCTTC	2	12	33109	33120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	501675909
24	NC_021236	TGTTCT	2	12	33370	33381	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501675909
25	NC_021236	TAATTT	2	12	36027	36038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675913
26	NC_021236	GATTTG	2	12	38222	38233	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501675917
27	NC_021236	TTTACC	2	12	38292	38303	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501675917
28	NC_021236	TTTTAT	2	12	39031	39042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501675917
29	NC_021236	TTGTTT	2	12	39990	40001	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	501675918
30	NC_021236	AAAAGA	2	12	42563	42574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675921
31	NC_021236	CACAAA	2	12	44533	44544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675922
32	NC_021236	ACAAAA	2	12	46332	46343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501675925
33	NC_021236	TTGAAT	2	12	48167	48178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675927
34	NC_021236	AAAAGA	2	12	49368	49379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675928
35	NC_021236	ATAAAA	2	12	50732	50743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501675929
36	NC_021236	GGTAAA	2	12	51459	51470	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	501675929
37	NC_021236	CAAATC	2	12	51529	51540	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501675929
38	NC_021236	AGAATA	2	12	54886	54897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501675933
39	NC_021236	TTTCAA	2	12	55256	55267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	501675934
40	NC_021236	AATTTT	2	12	58761	58772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675939
41	NC_021236	ACCAAA	2	12	60144	60155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675944
42	NC_021236	CAATAT	2	12	60693	60704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	501675945
43	NC_021236	AAAACC	2	12	60914	60925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675947
44	NC_021236	AAAGAA	2	12	62581	62592	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501675948
45	NC_021236	AAACAA	2	12	62596	62607	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501675948
46	NC_021236	GTTGAA	2	12	70127	70138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675957
47	NC_021236	GATTCT	2	12	70223	70234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	501675957
48	NC_021236	AAATTA	2	12	73052	73063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675960
49	NC_021236	TTGCTT	2	12	75232	75243	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501675962
50	NC_021236	CCTTAA	2	12	76036	76047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675962
51	NC_021236	ATCTAA	2	12	78768	78779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	501675967
52	NC_021236	ATTTGG	2	12	79015	79026	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501675967
53	NC_021236	TCTAAA	2	12	79877	79888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	501675968
54	NC_021236	TTTTAA	2	12	81469	81480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675971
55	NC_021236	CCAAAA	3	18	84828	84845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675976
56	NC_021236	TTCTTT	2	12	85257	85268	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675976
57	NC_021236	ATAAAT	2	12	88717	88728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675978
58	NC_021236	TGAAAT	2	12	93067	93078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501675984
59	NC_021236	TTTCTT	2	12	100037	100048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501675989
60	NC_021236	ATATTG	2	12	101926	101937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501675992
61	NC_021236	TTTGGT	2	12	102475	102486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675993
62	NC_021236	ATTCTT	2	12	107176	107187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676003
63	NC_021236	AAATTG	2	12	111061	111072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501676008
64	NC_021236	ATTTTG	2	12	121732	121743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	501676021
65	NC_021236	TAATTT	2	12	124507	124518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676023
66	NC_021236	ATTTTT	2	12	125261	125272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501676025
67	NC_021236	TCAATT	2	12	125948	125959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	501676026
68	NC_021236	AAAAGA	2	12	129732	129743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676029
69	NC_021236	AAAGAA	2	12	133598	133609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676035
70	NC_021236	TGCTGG	2	12	135937	135948	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	501676039
71	NC_021236	ATAAAA	2	12	137305	137316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501676040
72	NC_021236	AATTTT	2	12	145434	145445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676052
73	NC_021236	AAAAGT	2	12	146229	146240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501676055
74	NC_021236	CCAAAT	2	12	147028	147039	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676057
75	NC_021236	AAAGAA	2	12	150752	150763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676059
76	NC_021236	AAAAGA	2	12	152395	152406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676059
77	NC_021236	AATCCA	2	12	155202	155213	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501676062
78	NC_021236	CAAAAA	2	12	156351	156362	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501676064
79	NC_021236	TTAAAA	2	12	159167	159178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676067
80	NC_021236	GAAAAA	2	12	161290	161301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676068
81	NC_021236	CAAAGA	2	12	161597	161608	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	501676070
82	NC_021236	CAAAAT	2	12	165286	165297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501676072
83	NC_021236	TAATTT	2	12	168181	168192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676073
84	NC_021236	TAATTT	2	12	172669	172680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501676079
85	NC_021236	ATTTGG	2	12	175204	175215	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676081
86	NC_021236	TTGAGT	2	12	177080	177091	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676089
87	NC_021236	TGCCGT	2	12	178390	178401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501676092
88	NC_021236	TCTTTA	2	12	178867	178878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676093
89	NC_021236	ATTCTT	2	12	181403	181414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676096
90	NC_021236	ACCAGT	2	12	182784	182795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501676098
91	NC_021236	CCTTTA	2	12	186166	186177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501676101
92	NC_021236	TTAAAA	2	12	188051	188062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676102
93	NC_021236	AGAAAA	2	12	191201	191212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676105
94	NC_021236	AAAGAT	2	12	191571	191582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	501676105
95	NC_021236	AAAACA	2	12	197521	197532	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501676110
96	NC_021236	CTTATC	2	12	199152	199163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501676112
97	NC_021236	TTAGAG	2	12	202392	202403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501676116
98	NC_021236	TAAAAA	2	12	207544	207555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501676120
99	NC_021236	TTTCTT	2	12	208568	208579	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501676121
100	NC_021236	AAAATT	2	12	210006	210017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676124
101	NC_021236	AATTTG	2	12	217652	217663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501676138
102	NC_021236	GAAAAA	2	12	219873	219884	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676141
103	NC_021236	CAAAAA	2	12	220602	220613	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	501676141
104	NC_021236	TGATTT	2	12	220622	220633	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	501676141
105	NC_021236	TGTTGA	2	12	221674	221685	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676142
106	NC_021236	TTTTTG	2	12	222882	222893	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	501676143
107	NC_021236	GAAATT	2	12	226731	226742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501676146
108	NC_021236	GGCTTT	2	12	227801	227812	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	501676146
109	NC_021236	GTGATT	2	12	230421	230432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	501676148
110	NC_021236	GAAAAA	2	12	230763	230774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	501676148
111	NC_021236	ATAAAA	2	12	232489	232500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	501676150
112	NC_021236	TTGCAA	2	12	232901	232912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	501676150
113	NC_021236	TTATTT	2	12	233307	233318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501676151
114	NC_021236	CTTTAT	2	12	233729	233740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676151
115	NC_021236	AAAATT	2	12	234055	234066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501676151
116	NC_021236	GTTAAT	2	12	237082	237093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501676157
117	NC_021236	CATTTG	2	12	238955	238966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	501676159
118	NC_021236	TTTTTC	2	12	241014	241025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501676161
119	NC_021236	TTTTCT	2	12	244253	244264	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	501676168
120	NC_021236	TTTTGC	2	12	244789	244800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501676169
121	NC_021236	ATTTTT	2	12	246200	246211	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	501676169
122	NC_021236	TTTCTG	2	12	247751	247762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	501676171
123	NC_021236	TCATTT	2	12	248098	248109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501676171
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