MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 3127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	AAT	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021236	CTG	2	6	2612	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021236	AAT	2	6	2814	2819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021236	TTA	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021236	GAA	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021236	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021236	ATA	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021236	ATT	2	6	2992	2997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021236	AAC	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021236	GAT	2	6	3126	3131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021236	TTA	2	6	3196	3201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021236	ACA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021236	TAA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021236	ATA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021236	TAT	2	6	3558	3563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021236	CGG	2	6	3608	3613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021236	GCC	2	6	3651	3656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021236	AAT	2	6	3659	3664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021236	ATG	2	6	3886	3891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021236	TCA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021236	GAT	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021236	TGT	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021236	TAA	2	6	4218	4223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021236	AGT	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021236	TAA	2	6	4607	4612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021236	TAA	2	6	4736	4741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021236	TGG	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021236	ATT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021236	TAT	2	6	4896	4901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021236	ACT	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021236	TGA	2	6	4949	4954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021236	ACA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021236	TGA	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021236	TAT	2	6	5213	5218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021236	TAC	2	6	5340	5345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021236	AGA	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021236	TAA	2	6	5376	5381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021236	GAT	2	6	5386	5391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021236	ATA	2	6	5396	5401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021236	ATT	2	6	5473	5478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021236	TAG	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021236	CTA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021236	GCT	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021236	ATT	2	6	6921	6926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021236	TAA	2	6	7025	7030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021236	TGG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021236	TTA	2	6	7248	7253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021236	ATT	2	6	7288	7293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021236	TTG	2	6	7720	7725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021236	TTA	2	6	7808	7813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021236	GAT	2	6	7817	7822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021236	GTA	2	6	7979	7984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021236	TAA	2	6	8078	8083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021236	AAG	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021236	ATA	2	6	8099	8104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021236	ATT	2	6	8175	8180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021236	AAT	2	6	8286	8291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021236	ATT	2	6	9993	9998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021236	TTG	2	6	10136	10141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021236	ATC	2	6	10173	10178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021236	AAT	2	6	10332	10337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021236	ATT	2	6	11317	11322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021236	TTA	2	6	11327	11332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021236	AGG	2	6	11579	11584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021236	TAA	2	6	11724	11729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021236	ATT	2	6	11773	11778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021236	ATG	2	6	12064	12069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021236	TTC	2	6	12097	12102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021236	ATC	2	6	12166	12171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021236	AAT	2	6	12203	12208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021236	TTC	2	6	12214	12219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021236	CTT	2	6	12227	12232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021236	TCA	2	6	12285	12290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021236	GAG	2	6	12295	12300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021236	TTC	2	6	12326	12331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021236	TGA	2	6	12417	12422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021236	TTG	2	6	12470	12475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021236	ACC	2	6	12494	12499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021236	ACA	2	6	12577	12582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021236	GTT	2	6	12671	12676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021236	TTG	2	6	12770	12775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021236	TCA	2	6	12789	12794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021236	ATT	2	6	12795	12800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021236	TTC	2	6	12892	12897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021236	CTT	2	6	12987	12992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021236	TCA	2	6	13038	13043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021236	ATT	2	6	13106	13111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021236	TAT	2	6	13118	13123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021236	GTA	2	6	13136	13141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021236	ATT	2	6	14924	14929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021236	TTA	2	6	15835	15840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021236	GGA	2	6	15866	15871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021236	GTT	2	6	15908	15913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021236	ATT	2	6	15992	15997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021236	ATT	2	6	16024	16029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021236	CAA	2	6	16063	16068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021236	ATA	2	6	16241	16246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021236	AGC	2	6	16282	16287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021236	TAA	2	6	16342	16347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021236	AAT	2	6	16437	16442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021236	TAT	2	6	16476	16481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021236	TAA	2	6	16521	16526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021236	TAA	2	6	16587	16592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021236	ATT	2	6	16694	16699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021236	TAT	2	6	16751	16756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021236	AAT	3	9	16802	16810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021236	AAT	2	6	16817	16822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021236	TTA	2	6	16823	16828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021236	CTT	2	6	16903	16908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021236	AAG	2	6	16913	16918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021236	ATT	2	6	16982	16987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021236	ATT	2	6	17020	17025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021236	ATT	2	6	17041	17046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021236	GAT	2	6	17047	17052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021236	ACA	2	6	17144	17149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021236	ATA	2	6	17183	17188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021236	ATT	2	6	17329	17334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021236	TTA	2	6	17390	17395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021236	TTA	2	6	17419	17424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021236	TTA	2	6	18631	18636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021236	TAA	3	9	18659	18667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021236	TGT	2	6	18703	18708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021236	AAT	2	6	19002	19007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021236	AAT	2	6	19047	19052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021236	TGT	2	6	19059	19064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021236	TTA	2	6	19122	19127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021236	ATT	2	6	19144	19149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021236	ATT	2	6	19166	19171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021236	TAT	2	6	19277	19282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021236	ATT	2	6	19342	19347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021236	ATA	2	6	19389	19394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021236	AAG	2	6	20069	20074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021236	ATA	2	6	20155	20160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021236	ATT	2	6	20202	20207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021236	TGT	2	6	20252	20257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021236	AGA	2	6	20363	20368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021236	ATA	2	6	20428	20433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021236	TAT	2	6	20512	20517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021236	CAT	2	6	20565	20570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021236	AAT	2	6	20727	20732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021236	GTT	2	6	20800	20805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021236	ACA	2	6	20808	20813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021236	ACT	2	6	20831	20836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021236	ATT	2	6	24047	24052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021236	ACA	2	6	24082	24087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_021236	GGA	2	6	31523	31528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_021236	ATT	2	6	105870	105875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_021236	ATT	2	6	109446	109451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_021236	ATT	2	6	109695	109700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_021236	ATG	2	6	110888	110893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_021236	ATT	2	6	117057	117062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_021236	ATT	2	6	117065	117070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_021236	AAC	2	6	117465	117470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_021236	CTT	2	6	117508	117513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_021236	ATT	2	6	117542	117547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021236	TTA	2	6	117581	117586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_021236	ACA	2	6	117642	117647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_021236	ATT	2	6	117660	117665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021236	ATC	2	6	117694	117699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_021236	ACA	2	6	117788	117793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_021236	TCT	2	6	120147	120152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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