MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	AT	3	6	163	168	50 %	50 %	0 %	0 %	501675885
2	NC_021236	AC	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	501675885
3	NC_021236	AT	3	6	1466	1471	50 %	50 %	0 %	0 %	501675886
4	NC_021236	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	501675887
5	NC_021236	AT	3	6	6203	6208	50 %	50 %	0 %	0 %	501675889
6	NC_021236	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	501675889
7	NC_021236	AT	3	6	10442	10447	50 %	50 %	0 %	0 %	501675891
8	NC_021236	AT	3	6	14830	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	501675893
9	NC_021236	TA	3	6	14880	14885	50 %	50 %	0 %	0 %	501675893
10	NC_021236	TA	3	6	18099	18104	50 %	50 %	0 %	0 %	501675895
11	NC_021236	AT	3	6	18242	18247	50 %	50 %	0 %	0 %	501675895
12	NC_021236	CA	3	6	18322	18327	50 %	0 %	0 %	50 %	501675895
13	NC_021236	TA	3	6	19542	19547	50 %	50 %	0 %	0 %	501675898
14	NC_021236	AT	3	6	19567	19572	50 %	50 %	0 %	0 %	501675898
15	NC_021236	AT	3	6	19638	19643	50 %	50 %	0 %	0 %	501675898
16	NC_021236	AT	3	6	20938	20943	50 %	50 %	0 %	0 %	501675899
17	NC_021236	TA	3	6	23309	23314	50 %	50 %	0 %	0 %	501675902
18	NC_021236	GT	3	6	25014	25019	0 %	50 %	50 %	0 %	501675903
19	NC_021236	GA	3	6	26917	26922	50 %	0 %	50 %	0 %	501675905
20	NC_021236	GA	3	6	30481	30486	50 %	0 %	50 %	0 %	501675908
21	NC_021236	CT	3	6	32571	32576	0 %	50 %	0 %	50 %	501675909
22	NC_021236	TA	3	6	35336	35341	50 %	50 %	0 %	0 %	501675912
23	NC_021236	AT	3	6	35598	35603	50 %	50 %	0 %	0 %	501675912
24	NC_021236	AT	3	6	37392	37397	50 %	50 %	0 %	0 %	501675916
25	NC_021236	TC	3	6	37772	37777	0 %	50 %	0 %	50 %	501675917
26	NC_021236	AT	4	8	38633	38640	50 %	50 %	0 %	0 %	501675917
27	NC_021236	AT	3	6	41403	41408	50 %	50 %	0 %	0 %	501675920
28	NC_021236	AT	3	6	42544	42549	50 %	50 %	0 %	0 %	501675921
29	NC_021236	TA	3	6	42806	42811	50 %	50 %	0 %	0 %	501675921
30	NC_021236	TA	3	6	44261	44266	50 %	50 %	0 %	0 %	501675922
31	NC_021236	AG	5	10	45119	45128	50 %	0 %	50 %	0 %	501675923
32	NC_021236	AT	3	6	46173	46178	50 %	50 %	0 %	0 %	501675925
33	NC_021236	AT	3	6	47754	47759	50 %	50 %	0 %	0 %	501675926
34	NC_021236	TA	3	6	48042	48047	50 %	50 %	0 %	0 %	501675927
35	NC_021236	AT	3	6	48705	48710	50 %	50 %	0 %	0 %	501675927
36	NC_021236	AT	3	6	49349	49354	50 %	50 %	0 %	0 %	501675928
37	NC_021236	TA	3	6	49611	49616	50 %	50 %	0 %	0 %	501675928
38	NC_021236	TA	3	6	50917	50922	50 %	50 %	0 %	0 %	501675929
39	NC_021236	AT	4	8	51122	51129	50 %	50 %	0 %	0 %	501675929
40	NC_021236	GA	3	6	51985	51990	50 %	0 %	50 %	0 %	501675929
41	NC_021236	CA	3	6	52033	52038	50 %	0 %	0 %	50 %	501675929
42	NC_021236	AG	3	6	52789	52794	50 %	0 %	50 %	0 %	501675931
43	NC_021236	TA	3	6	53282	53287	50 %	50 %	0 %	0 %	501675931
44	NC_021236	AT	3	6	53878	53883	50 %	50 %	0 %	0 %	501675933
45	NC_021236	AT	3	6	56436	56441	50 %	50 %	0 %	0 %	501675936
46	NC_021236	AT	3	6	56620	56625	50 %	50 %	0 %	0 %	501675936
47	NC_021236	TA	3	6	58277	58282	50 %	50 %	0 %	0 %	501675939
48	NC_021236	CT	3	6	62850	62855	0 %	50 %	0 %	50 %	501675948
49	NC_021236	CT	4	8	62859	62866	0 %	50 %	0 %	50 %	501675948
50	NC_021236	CA	3	6	65450	65455	50 %	0 %	0 %	50 %	501675952
51	NC_021236	CA	3	6	67502	67507	50 %	0 %	0 %	50 %	501675952
52	NC_021236	AT	3	6	70462	70467	50 %	50 %	0 %	0 %	501675957
53	NC_021236	CA	3	6	74354	74359	50 %	0 %	0 %	50 %	501675961
54	NC_021236	TG	3	6	74453	74458	0 %	50 %	50 %	0 %	501675961
55	NC_021236	AT	3	6	77410	77415	50 %	50 %	0 %	0 %	501675964
56	NC_021236	AT	3	6	78283	78288	50 %	50 %	0 %	0 %	501675967
57	NC_021236	TA	3	6	81648	81653	50 %	50 %	0 %	0 %	501675971
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60	NC_021236	AT	3	6	86409	86414	50 %	50 %	0 %	0 %	501675976
61	NC_021236	CA	3	6	86879	86884	50 %	0 %	0 %	50 %	501675976
62	NC_021236	TG	3	6	87177	87182	0 %	50 %	50 %	0 %	501675977
63	NC_021236	TG	3	6	87190	87195	0 %	50 %	50 %	0 %	501675977
64	NC_021236	TG	3	6	87602	87607	0 %	50 %	50 %	0 %	501675977
65	NC_021236	TA	3	6	92285	92290	50 %	50 %	0 %	0 %	501675984
66	NC_021236	AT	3	6	92407	92412	50 %	50 %	0 %	0 %	501675984
67	NC_021236	GA	3	6	93355	93360	50 %	0 %	50 %	0 %	501675984
68	NC_021236	TA	3	6	95557	95562	50 %	50 %	0 %	0 %	501675987
69	NC_021236	AG	3	6	96655	96660	50 %	0 %	50 %	0 %	501675988
70	NC_021236	AT	4	8	96978	96985	50 %	50 %	0 %	0 %	501675988
71	NC_021236	TA	3	6	99788	99793	50 %	50 %	0 %	0 %	501675989
72	NC_021236	TA	3	6	104348	104353	50 %	50 %	0 %	0 %	501675998
73	NC_021236	AT	3	6	105264	105269	50 %	50 %	0 %	0 %	501676000
74	NC_021236	AT	3	6	107033	107038	50 %	50 %	0 %	0 %	501676003
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80	NC_021236	TA	3	6	113236	113241	50 %	50 %	0 %	0 %	501676012
81	NC_021236	AT	3	6	114355	114360	50 %	50 %	0 %	0 %	501676014
82	NC_021236	AT	3	6	116820	116825	50 %	50 %	0 %	0 %	501676017
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85	NC_021236	CT	3	6	120272	120277	0 %	50 %	0 %	50 %	501676020
86	NC_021236	AT	3	6	121626	121631	50 %	50 %	0 %	0 %	501676021
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101	NC_021236	TA	3	6	135622	135627	50 %	50 %	0 %	0 %	501676037
102	NC_021236	TA	3	6	136064	136069	50 %	50 %	0 %	0 %	501676039
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104	NC_021236	AT	3	6	137743	137748	50 %	50 %	0 %	0 %	501676041
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107	NC_021236	AT	3	6	141271	141276	50 %	50 %	0 %	0 %	501676046
108	NC_021236	TA	3	6	141555	141560	50 %	50 %	0 %	0 %	501676046
109	NC_021236	AT	3	6	141891	141896	50 %	50 %	0 %	0 %	501676047
110	NC_021236	AT	3	6	142075	142080	50 %	50 %	0 %	0 %	501676047
111	NC_021236	TA	3	6	144230	144235	50 %	50 %	0 %	0 %	501676050
112	NC_021236	AT	3	6	146952	146957	50 %	50 %	0 %	0 %	501676057
113	NC_021236	AT	3	6	149006	149011	50 %	50 %	0 %	0 %	501676057
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117	NC_021236	AC	3	6	156295	156300	50 %	0 %	0 %	50 %	501676064
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119	NC_021236	GA	3	6	157882	157887	50 %	0 %	50 %	0 %	501676066
120	NC_021236	AT	3	6	162181	162186	50 %	50 %	0 %	0 %	501676070
121	NC_021236	AT	3	6	163471	163476	50 %	50 %	0 %	0 %	501676070
122	NC_021236	AT	3	6	165267	165272	50 %	50 %	0 %	0 %	501676072
123	NC_021236	TA	3	6	167513	167518	50 %	50 %	0 %	0 %	501676073
124	NC_021236	AT	3	6	168755	168760	50 %	50 %	0 %	0 %	501676074
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126	NC_021236	TA	4	8	170121	170128	50 %	50 %	0 %	0 %	501676076
127	NC_021236	TA	3	6	170384	170389	50 %	50 %	0 %	0 %	501676076
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139	NC_021236	AT	3	6	179217	179222	50 %	50 %	0 %	0 %	501676093
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