MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021235	AATTAA	2	12	2675	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021235	CCATTT	2	12	113014	113025	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021235	ACTACC	2	12	143912	143923	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021235	GTGGAA	2	12	173092	173103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021235	ATAGTA	2	12	190837	190848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021235	TGGAAG	2	12	198812	198823	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021235	GTTGGA	2	12	247329	247340	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021235	CAATTA	2	12	263523	263534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021235	ATAAGA	2	12	271821	271832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021235	TGGAAG	2	12	277265	277276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021235	ATCAGC	2	12	277611	277622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021235	GTTTCT	2	12	277761	277772	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021235	AAGCGA	2	12	319740	319751	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021235	TTCTCT	2	12	475671	475682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021235	ATCGGG	2	12	503233	503244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021235	AATTGA	2	12	551524	551535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021235	TGAGAG	2	12	560291	560302	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021235	AGTGGC	2	12	564960	564971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021235	TGGTAT	2	12	616279	616290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021235	ATTTTG	2	12	617261	617272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021235	TGGAAG	2	12	632420	632431	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021235	GCCCCC	2	12	705145	705156	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_021235	TATTTT	2	12	724927	724938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021235	TAAGGA	2	12	750690	750701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021235	GCTAGT	2	12	757932	757943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021235	TAGCCA	2	12	819074	819085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021235	GACGCT	2	12	836460	836471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021235	ATCACT	2	12	841160	841171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021235	GGTCGA	2	12	843616	843627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021235	AAATAT	2	12	869178	869189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021235	GTTGGT	2	12	899575	899586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021235	ATGTGT	2	12	902367	902378	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021235	TGATAA	2	12	920379	920390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021235	CGATAA	2	12	938334	938345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021235	CTGGGG	2	12	948908	948919	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021235	ACTATA	2	12	981216	981227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021235	TTTTTG	2	12	1015473	1015484	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021235	ATTAAT	2	12	1031036	1031047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021235	TAATTT	2	12	1036872	1036883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021235	AAAATG	2	12	1051090	1051101	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021235	TCCCGT	2	12	1084467	1084478	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021235	TATCGT	2	12	1128674	1128685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021235	CAAATA	2	12	1128686	1128697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021235	GTTTTA	2	12	1134760	1134771	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021235	CCCGGC	2	12	1183446	1183457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021235	CTAGGC	2	12	1288566	1288577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021235	TTTTTC	2	12	1294581	1294592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021235	TAAAGT	2	12	1296213	1296224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021235	CAGTAA	2	12	1352379	1352390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021235	TGACGC	2	12	1414387	1414398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021235	GTCAAA	2	12	1512905	1512916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021235	CACTTC	2	12	1516995	1517006	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021235	TATTAG	2	12	1561948	1561959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021235	ATTTAA	2	12	1565714	1565725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021235	CATCAG	2	12	1593779	1593790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021235	TAAAAT	2	12	1608199	1608210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021235	ATTACT	2	12	1659954	1659965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021235	TGTTTT	2	12	1747615	1747626	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021235	GTTCCA	2	12	1793100	1793111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021235	CACCCT	2	12	1811982	1811993	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021235	AAAATT	2	12	1926450	1926461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021235	CGATTT	2	12	1982059	1982070	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021235	ATTACT	2	12	1982433	1982444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021235	AATTTT	2	12	2014388	2014399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021235	AAATTA	2	12	2030267	2030278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.