MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 1017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021235	GCCG	2	8	2660	2667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021235	CCAC	2	8	16487	16494	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_021235	GATG	2	8	16544	16551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021235	GAAC	2	8	23682	23689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021235	GGAA	2	8	24433	24440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021235	AGTT	2	8	24509	24516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021235	GGAT	2	8	24593	24600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021235	TGAT	2	8	26019	26026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021235	CTTT	2	8	26415	26422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021235	GGGA	2	8	26424	26431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021235	TTAT	2	8	33669	33676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021235	GCAA	2	8	33712	33719	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021235	AAGT	2	8	39043	39050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021235	AAGT	2	8	39164	39171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021235	ACCA	2	8	39176	39183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021235	GTCT	2	8	41088	41095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021235	CATT	2	8	41217	41224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021235	AGTA	2	8	50123	50130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021235	AGTG	2	8	51895	51902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021235	ACCA	2	8	51906	51913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021235	AACT	2	8	57538	57545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021235	CCTC	2	8	59249	59256	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021235	TTTA	2	8	62204	62211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021235	AGGA	2	8	63035	63042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021235	TAAA	2	8	66100	66107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021235	TAGT	2	8	66287	66294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021235	AACT	2	8	69203	69210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021235	CCAA	2	8	72372	72379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021235	AAGT	2	8	73386	73393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021235	GGCT	2	8	73399	73406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021235	GGAA	2	8	78092	78099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021235	AAAC	2	8	78113	78120	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021235	ATCC	2	8	86127	86134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021235	ATTA	2	8	86166	86173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021235	AATT	2	8	86174	86181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021235	ACTG	2	8	91672	91679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021235	ATTA	2	8	92062	92069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021235	TAAT	2	8	93572	93579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021235	GATT	2	8	94056	94063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021235	TGTT	2	8	94340	94347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021235	AACC	2	8	95597	95604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021235	TGGT	2	8	95689	95696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021235	AATA	2	8	96758	96765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021235	TTTA	2	8	103234	103241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021235	GATT	2	8	103316	103323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021235	AAGG	2	8	103348	103355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021235	AGGG	2	8	105134	105141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021235	TTTA	2	8	113074	113081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021235	AGAA	2	8	113131	113138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021235	GAGT	2	8	122789	122796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021235	ATTA	2	8	123006	123013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021235	GGCA	2	8	123629	123636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021235	AACC	2	8	127145	127152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021235	ACCA	2	8	127265	127272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021235	GAAA	2	8	127420	127427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021235	ATCC	2	8	134242	134249	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021235	ATTA	2	8	134281	134288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021235	AGTT	2	8	135578	135585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021235	AACT	2	8	139217	139224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021235	AGTG	2	8	140524	140531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021235	ACCA	2	8	143305	143312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021235	CGTA	2	8	152910	152917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021235	ATCC	2	8	154889	154896	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021235	ATTA	2	8	154928	154935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021235	GCAC	2	8	156327	156334	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021235	TTAG	2	8	161681	161688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021235	CCAC	2	8	162788	162795	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_021235	TGAT	2	8	162845	162852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021235	ACTT	2	8	165932	165939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021235	GATT	2	8	168539	168546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021235	TGAT	2	8	168562	168569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021235	TGGA	2	8	168719	168726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021235	GTGA	2	8	168898	168905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021235	GCAA	2	8	169766	169773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021235	AGCC	2	8	169951	169958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021235	AACT	2	8	170206	170213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021235	AGAA	2	8	170456	170463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021235	TAGG	2	8	172375	172382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021235	GACA	2	8	172610	172617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021235	TATG	2	8	172981	172988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021235	GAAA	2	8	173346	173353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021235	GTCG	2	8	174147	174154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021235	AATT	2	8	174207	174214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021235	CCAG	2	8	175565	175572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021235	CCGC	2	8	175679	175686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_021235	CCGG	2	8	178129	178136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021235	CAAA	2	8	180861	180868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021235	CGCC	2	8	181471	181478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_021235	AACC	2	8	188496	188503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021235	TAAA	2	8	188521	188528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021235	GGAG	2	8	193840	193847	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021235	ATTG	2	8	194259	194266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021235	TGAT	2	8	194281	194288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021235	TGGA	2	8	194438	194445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021235	GTGA	2	8	194617	194624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021235	GCAA	2	8	195485	195492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021235	AGCC	2	8	195670	195677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021235	AACT	2	8	195925	195932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021235	AGAA	2	8	196175	196182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021235	TAGG	2	8	198094	198101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021235	GACA	2	8	198329	198336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021235	TATG	2	8	198700	198707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021235	CCAA	2	8	199056	199063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021235	GCCT	2	8	199167	199174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021235	TTAC	2	8	202794	202801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021235	CACC	2	8	204575	204582	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_021235	GGAT	2	8	206473	206480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021235	ACTT	2	8	212606	212613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021235	TCAT	2	8	214756	214763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021235	AATG	2	8	215071	215078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021235	GCTG	2	8	218161	218168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021235	AATT	2	8	224770	224777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021235	GCTT	2	8	237316	237323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021235	TAAA	2	8	239310	239317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021235	AGGG	2	8	241681	241688	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021235	CAAG	2	8	247241	247248	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021235	AAAG	2	8	247597	247604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021235	TAAT	2	8	247750	247757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021235	GGAT	2	8	247788	247795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021235	AGTT	2	8	251038	251045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021235	GTTA	2	8	254214	254221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021235	TACG	2	8	264295	264302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021235	AAAT	2	8	272003	272010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021235	ATTG	2	8	272517	272524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021235	TGAT	2	8	272539	272546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021235	TGGA	2	8	272696	272703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021235	GTGA	2	8	272875	272882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021235	GCAA	2	8	273743	273750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021235	AGCC	2	8	273928	273935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021235	AACT	2	8	274378	274385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021235	AGAA	2	8	274628	274635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021235	TAGG	2	8	276547	276554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021235	GACA	2	8	276782	276789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021235	TATG	2	8	277153	277160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021235	ATAG	2	8	277874	277881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021235	GTTT	2	8	278188	278195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021235	TTGT	2	8	278777	278784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021235	CCAG	2	8	279613	279620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021235	ATTT	2	8	279861	279868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021235	AACC	2	8	279877	279884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021235	AGAA	2	8	280129	280136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021235	TGTT	2	8	283398	283405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021235	AACA	2	8	283455	283462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021235	AAAG	2	8	287154	287161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021235	CGAT	2	8	287471	287478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021235	ATTT	2	8	288167	288174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021235	CTGA	2	8	288266	288273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021235	GGGA	2	8	290767	290774	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021235	CTAA	2	8	302048	302055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021235	TTAA	2	8	305115	305122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021235	CGTT	2	8	314677	314684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021235	GTTG	2	8	317011	317018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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