MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	TGGT	2	8	9	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021234	TGAT	2	8	2002	2009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021234	TTTA	2	8	2126	2133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021234	TTGC	2	8	5027	5034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021234	CATT	2	8	6713	6720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021234	CTAT	2	8	7219	7226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021234	CTTA	2	8	8005	8012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021234	CTTT	2	8	9539	9546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021234	ATGA	2	8	9639	9646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021234	GTTG	2	8	10353	10360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021234	AAAG	2	8	10428	10435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021234	AGTC	2	8	26196	26203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021234	TCAT	2	8	28701	28708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021234	TTTG	2	8	29221	29228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021234	TTCG	2	8	29410	29417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021234	AATG	2	8	29464	29471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021234	TGAA	2	8	29661	29668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021234	CAAC	2	8	29733	29740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021234	CTTT	2	8	29910	29917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021234	TTGC	2	8	29976	29983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021234	GCAT	2	8	29986	29993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021234	AATT	2	8	30516	30523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.