MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	AGCC	2	8	930	937	25 %	0 %	25 %	50 %	501148389
2	NC_021234	AATC	2	8	2371	2378	50 %	25 %	0 %	25 %	501148391
3	NC_021234	CTTA	2	8	3000	3007	25 %	50 %	0 %	25 %	501148392
4	NC_021234	CAAT	2	8	3161	3168	50 %	25 %	0 %	25 %	501148392
5	NC_021234	TCTA	2	8	3171	3178	25 %	50 %	0 %	25 %	501148392
6	NC_021234	TGTC	2	8	3490	3497	0 %	50 %	25 %	25 %	501148392
7	NC_021234	CTTT	2	8	3646	3653	0 %	75 %	0 %	25 %	501148392
8	NC_021234	ATAA	2	8	4552	4559	75 %	25 %	0 %	0 %	501148392
9	NC_021234	GATC	2	8	4863	4870	25 %	25 %	25 %	25 %	501148392
10	NC_021234	CAAT	2	8	4916	4923	50 %	25 %	0 %	25 %	501148392
11	NC_021234	CGAA	2	8	5790	5797	50 %	0 %	25 %	25 %	501148394
12	NC_021234	AATC	2	8	6169	6176	50 %	25 %	0 %	25 %	501148394
13	NC_021234	ATCG	2	8	6298	6305	25 %	25 %	25 %	25 %	501148394
14	NC_021234	ACTA	2	8	6369	6376	50 %	25 %	0 %	25 %	501148394
15	NC_021234	TGAG	2	8	8993	9000	25 %	25 %	50 %	0 %	501148399
16	NC_021234	ACTC	2	8	9079	9086	25 %	25 %	0 %	50 %	501148399
17	NC_021234	TCAA	2	8	9410	9417	50 %	25 %	0 %	25 %	501148399
18	NC_021234	GTCA	2	8	10579	10586	25 %	25 %	25 %	25 %	501148402
19	NC_021234	AAAG	2	8	10666	10673	75 %	0 %	25 %	0 %	501148402
20	NC_021234	AGAA	2	8	10746	10753	75 %	0 %	25 %	0 %	501148402
21	NC_021234	CTAA	2	8	10856	10863	50 %	25 %	0 %	25 %	501148402
22	NC_021234	GAAA	2	8	11162	11169	75 %	0 %	25 %	0 %	501148402
23	NC_021234	TTAA	2	8	11393	11400	50 %	50 %	0 %	0 %	501148402
24	NC_021234	CTCA	2	8	11458	11465	25 %	25 %	0 %	50 %	501148402
25	NC_021234	TAAA	2	8	11484	11491	75 %	25 %	0 %	0 %	501148402
26	NC_021234	AATT	2	8	11565	11572	50 %	50 %	0 %	0 %	501148402
27	NC_021234	AACG	2	8	11618	11625	50 %	0 %	25 %	25 %	501148402
28	NC_021234	GCAA	2	8	12040	12047	50 %	0 %	25 %	25 %	501148402
29	NC_021234	TTAT	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	501148402
30	NC_021234	TTAG	2	8	13343	13350	25 %	50 %	25 %	0 %	501148404
31	NC_021234	TGAA	2	8	13643	13650	50 %	25 %	25 %	0 %	501148404
32	NC_021234	GAAT	2	8	14181	14188	50 %	25 %	25 %	0 %	501148405
33	NC_021234	GCCA	2	8	14567	14574	25 %	0 %	25 %	50 %	501148405
34	NC_021234	TAAA	2	8	15570	15577	75 %	25 %	0 %	0 %	501148405
35	NC_021234	CAAG	2	8	15601	15608	50 %	0 %	25 %	25 %	501148405
36	NC_021234	GTTA	2	8	15673	15680	25 %	50 %	25 %	0 %	501148405
37	NC_021234	GTTG	2	8	18155	18162	0 %	50 %	50 %	0 %	501148408
38	NC_021234	TCAT	2	8	18479	18486	25 %	50 %	0 %	25 %	501148408
39	NC_021234	ACAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	501148408
40	NC_021234	CTGA	2	8	18965	18972	25 %	25 %	25 %	25 %	501148409
41	NC_021234	AATA	2	8	19220	19227	75 %	25 %	0 %	0 %	501148409
42	NC_021234	CCTT	2	8	19362	19369	0 %	50 %	0 %	50 %	501148409
43	NC_021234	TAAG	2	8	19577	19584	50 %	25 %	25 %	0 %	501148409
44	NC_021234	ATTC	2	8	19667	19674	25 %	50 %	0 %	25 %	501148409
45	NC_021234	ATAG	2	8	19790	19797	50 %	25 %	25 %	0 %	501148409
46	NC_021234	AATA	2	8	20391	20398	75 %	25 %	0 %	0 %	501148409
47	NC_021234	AATT	2	8	20898	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	501148410
48	NC_021234	AATT	2	8	21042	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	501148410
49	NC_021234	AATT	2	8	21665	21672	50 %	50 %	0 %	0 %	501148410
50	NC_021234	TGAC	2	8	22103	22110	25 %	25 %	25 %	25 %	501148410
51	NC_021234	CAAA	2	8	22825	22832	75 %	0 %	0 %	25 %	501148410
52	NC_021234	ATTG	2	8	23618	23625	25 %	50 %	25 %	0 %	501148410
53	NC_021234	AAAT	2	8	24423	24430	75 %	25 %	0 %	0 %	501148411
54	NC_021234	CTTT	2	8	24640	24647	0 %	75 %	0 %	25 %	501148411
55	NC_021234	TAAG	2	8	25418	25425	50 %	25 %	25 %	0 %	501148412
56	NC_021234	CTTT	2	8	25477	25484	0 %	75 %	0 %	25 %	501148412
57	NC_021234	TCCA	2	8	25739	25746	25 %	25 %	0 %	50 %	501148412
58	NC_021234	AAAT	2	8	25747	25754	75 %	25 %	0 %	0 %	501148412
59	NC_021234	TTTA	2	8	25946	25953	25 %	75 %	0 %	0 %	501148412
60	NC_021234	TAAC	2	8	25986	25993	50 %	25 %	0 %	25 %	501148412
61	NC_021234	ATTG	2	8	26219	26226	25 %	50 %	25 %	0 %	501148413
62	NC_021234	ATGG	2	8	28212	28219	25 %	25 %	50 %	0 %	501148415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.