MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	ACC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148389
2	NC_021234	GCA	2	6	539	544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148389
3	NC_021234	CAA	2	6	634	639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148389
4	NC_021234	CTG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148389
5	NC_021234	TTG	2	6	688	693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148389
6	NC_021234	ATG	2	6	743	748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148389
7	NC_021234	GAT	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148389
8	NC_021234	GCC	2	6	889	894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148389
9	NC_021234	GCA	2	6	989	994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148389
10	NC_021234	TTG	2	6	1049	1054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148389
11	NC_021234	GTT	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148389
12	NC_021234	CTG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148390
13	NC_021234	CGT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148390
14	NC_021234	CCA	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148390
15	NC_021234	GCC	2	6	1540	1545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148390
16	NC_021234	CAA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148390
17	NC_021234	GTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148391
18	NC_021234	TCG	2	6	2326	2331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148391
19	NC_021234	TGT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148391
20	NC_021234	GTT	2	6	2558	2563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148391
21	NC_021234	TGA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148391
22	NC_021234	GAT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148392
23	NC_021234	TAA	2	6	3062	3067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148392
24	NC_021234	TCT	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148392
25	NC_021234	CTG	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148392
26	NC_021234	GTT	2	6	3215	3220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148392
27	NC_021234	TAA	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148392
28	NC_021234	GAT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148392
29	NC_021234	AAC	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148392
30	NC_021234	AAG	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148392
31	NC_021234	ATA	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148392
32	NC_021234	AGT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148392
33	NC_021234	TTA	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148392
34	NC_021234	TAA	2	6	4019	4024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148392
35	NC_021234	AAT	2	6	4101	4106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148392
36	NC_021234	ATA	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148392
37	NC_021234	ATC	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148392
38	NC_021234	AAC	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148392
39	NC_021234	TGT	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148392
40	NC_021234	GTT	2	6	4631	4636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148392
41	NC_021234	GCC	2	6	4702	4707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148392
42	NC_021234	CCA	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148392
43	NC_021234	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148392
44	NC_021234	ACA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148392
45	NC_021234	AAT	2	6	5388	5393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148393
46	NC_021234	TAA	2	6	5485	5490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148393
47	NC_021234	TTA	2	6	5491	5496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148393
48	NC_021234	TCA	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148393
49	NC_021234	ATC	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148393
50	NC_021234	CAA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148394
51	NC_021234	ATG	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148394
52	NC_021234	TTA	2	6	6286	6291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148394
53	NC_021234	GAC	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148394
54	NC_021234	GTA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148394
55	NC_021234	ACG	3	9	6598	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148394
56	NC_021234	AAG	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148395
57	NC_021234	TTA	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148395
58	NC_021234	TAG	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148395
59	NC_021234	GCC	2	6	6938	6943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148395
60	NC_021234	AAG	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148395
61	NC_021234	TGA	2	6	7005	7010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148395
62	NC_021234	ACT	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148395
63	NC_021234	ATA	2	6	7354	7359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148396
64	NC_021234	TCA	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148396
65	NC_021234	TGA	2	6	7412	7417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148396
66	NC_021234	TGT	2	6	7475	7480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148396
67	NC_021234	AAT	2	6	7486	7491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148396
68	NC_021234	GAA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148397
69	NC_021234	TCG	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148397
70	NC_021234	TTG	2	6	7686	7691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148397
71	NC_021234	TCA	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148398
72	NC_021234	CTG	2	6	8498	8503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148398
73	NC_021234	TGG	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148398
74	NC_021234	TGG	2	6	8688	8693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148398
75	NC_021234	AAC	2	6	8704	8709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148398
76	NC_021234	ATT	2	6	8749	8754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148398
77	NC_021234	GAT	3	9	8883	8891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148398
78	NC_021234	GCG	2	6	9032	9037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148399
79	NC_021234	ATT	2	6	9072	9077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148399
80	NC_021234	TCC	2	6	9110	9115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148399
81	NC_021234	GAA	2	6	9169	9174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148399
82	NC_021234	AAC	2	6	9225	9230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148399
83	NC_021234	GTT	2	6	9390	9395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148399
84	NC_021234	AGC	2	6	9428	9433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148399
85	NC_021234	TTG	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148400
86	NC_021234	TAT	2	6	9966	9971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148401
87	NC_021234	GGC	2	6	9998	10003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148401
88	NC_021234	CTT	2	6	10147	10152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148401
89	NC_021234	AAT	2	6	10202	10207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148401
90	NC_021234	GTG	2	6	10436	10441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148402
91	NC_021234	GTG	2	6	10527	10532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148402
92	NC_021234	AAG	2	6	10551	10556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148402
93	NC_021234	TGA	2	6	10786	10791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
94	NC_021234	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148402
95	NC_021234	GAG	2	6	11105	11110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148402
96	NC_021234	GAT	2	6	11117	11122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
97	NC_021234	CAA	2	6	11180	11185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148402
98	NC_021234	GAT	2	6	11351	11356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
99	NC_021234	GCG	2	6	11359	11364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148402
100	NC_021234	ATT	2	6	11431	11436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148402
101	NC_021234	CAA	2	6	11447	11452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148402
102	NC_021234	TGA	2	6	11641	11646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
103	NC_021234	TTG	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148402
104	NC_021234	ATT	2	6	11662	11667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148402
105	NC_021234	TTA	2	6	11702	11707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148402
106	NC_021234	CAA	2	6	11711	11716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148402
107	NC_021234	TGA	2	6	11751	11756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
108	NC_021234	CCA	2	6	12050	12055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148402
109	NC_021234	CAA	2	6	12080	12085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148402
110	NC_021234	ATC	2	6	12132	12137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148402
111	NC_021234	ATG	2	6	12159	12164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
112	NC_021234	CGA	2	6	12204	12209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148402
113	NC_021234	CAA	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148402
114	NC_021234	GAC	2	6	12266	12271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148402
115	NC_021234	CTA	2	6	12334	12339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148402
116	NC_021234	TGA	2	6	12388	12393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148402
117	NC_021234	GTC	2	6	12557	12562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148403
118	NC_021234	TGA	2	6	12576	12581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148403
119	NC_021234	ATC	2	6	12629	12634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148403
120	NC_021234	CGT	2	6	12856	12861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148403
121	NC_021234	GTG	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148403
122	NC_021234	GAA	2	6	12976	12981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148403
123	NC_021234	TTA	2	6	12988	12993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148403
124	NC_021234	ATT	2	6	13004	13009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148403
125	NC_021234	TGG	2	6	13107	13112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148403
126	NC_021234	ATT	2	6	13200	13205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148403
127	NC_021234	AGG	2	6	13218	13223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148403
128	NC_021234	ACA	2	6	13298	13303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148404
129	NC_021234	CGG	2	6	13310	13315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148404
130	NC_021234	TCT	2	6	13356	13361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148404
131	NC_021234	CTG	2	6	13463	13468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148404
132	NC_021234	TTA	2	6	13475	13480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148404
133	NC_021234	CAA	2	6	13526	13531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148404
134	NC_021234	CAA	2	6	13541	13546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148404
135	NC_021234	CAA	3	9	13556	13564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148404
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139	NC_021234	ATT	2	6	14087	14092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148405
140	NC_021234	AAG	2	6	14142	14147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148405
141	NC_021234	TTA	2	6	14210	14215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148405
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146	NC_021234	ACC	2	6	14729	14734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148405
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150	NC_021234	ATT	2	6	14918	14923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148405
151	NC_021234	TGA	2	6	14995	15000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148405
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158	NC_021234	ACA	2	6	15379	15384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148405
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161	NC_021234	CAA	2	6	15497	15502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148405
162	NC_021234	GCC	2	6	15530	15535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148405
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164	NC_021234	TAT	2	6	16005	16010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148406
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251	NC_021234	ATC	2	6	22668	22673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148410
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253	NC_021234	CCG	2	6	22722	22727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148410
254	NC_021234	CAT	2	6	23393	23398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148410
255	NC_021234	CGG	2	6	23432	23437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148410
256	NC_021234	AAC	2	6	23646	23651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148410
257	NC_021234	ATT	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148411
258	NC_021234	TGT	2	6	24044	24049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148411
259	NC_021234	TCA	2	6	24050	24055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148411
260	NC_021234	ATC	2	6	24192	24197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148411
261	NC_021234	TCG	2	6	24262	24267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148411
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270	NC_021234	TGT	2	6	24608	24613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148411
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281	NC_021234	ATT	2	6	25589	25594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148412
282	NC_021234	ATC	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148412
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286	NC_021234	TGA	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148412
287	NC_021234	ATA	2	6	25833	25838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148412
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294	NC_021234	AAC	2	6	26968	26973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148414
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302	NC_021234	CAA	2	6	28466	28471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.