MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	A	6	6	718	723	100 %	0 %	0 %	0 %	501148389
2	NC_021234	T	6	6	1113	1118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021234	T	7	7	1656	1662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021234	A	6	6	2159	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021234	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	501148392
6	NC_021234	T	6	6	3914	3919	0 %	100 %	0 %	0 %	501148392
7	NC_021234	T	6	6	3997	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	501148392
8	NC_021234	T	7	7	4635	4641	0 %	100 %	0 %	0 %	501148392
9	NC_021234	T	6	6	4744	4749	0 %	100 %	0 %	0 %	501148392
10	NC_021234	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	501148392
11	NC_021234	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	501148393
12	NC_021234	T	6	6	5503	5508	0 %	100 %	0 %	0 %	501148393
13	NC_021234	A	6	6	5707	5712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021234	A	6	6	5990	5995	100 %	0 %	0 %	0 %	501148394
15	NC_021234	T	6	6	6759	6764	0 %	100 %	0 %	0 %	501148395
16	NC_021234	T	6	6	7531	7536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021234	A	7	7	7793	7799	100 %	0 %	0 %	0 %	501148397
18	NC_021234	T	7	7	7864	7870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021234	A	7	7	8404	8410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021234	A	6	6	9116	9121	100 %	0 %	0 %	0 %	501148399
21	NC_021234	A	6	6	9318	9323	100 %	0 %	0 %	0 %	501148399
22	NC_021234	A	6	6	9325	9330	100 %	0 %	0 %	0 %	501148399
23	NC_021234	T	6	6	9894	9899	0 %	100 %	0 %	0 %	501148400
24	NC_021234	T	6	6	10007	10012	0 %	100 %	0 %	0 %	501148401
25	NC_021234	T	7	7	10104	10110	0 %	100 %	0 %	0 %	501148401
26	NC_021234	A	6	6	10612	10617	100 %	0 %	0 %	0 %	501148402
27	NC_021234	A	6	6	11000	11005	100 %	0 %	0 %	0 %	501148402
28	NC_021234	A	6	6	11007	11012	100 %	0 %	0 %	0 %	501148402
29	NC_021234	A	7	7	11064	11070	100 %	0 %	0 %	0 %	501148402
30	NC_021234	A	6	6	11465	11470	100 %	0 %	0 %	0 %	501148402
31	NC_021234	A	6	6	11510	11515	100 %	0 %	0 %	0 %	501148402
32	NC_021234	T	6	6	12179	12184	0 %	100 %	0 %	0 %	501148402
33	NC_021234	A	7	7	13238	13244	100 %	0 %	0 %	0 %	501148404
34	NC_021234	T	6	6	13429	13434	0 %	100 %	0 %	0 %	501148404
35	NC_021234	A	7	7	13723	13729	100 %	0 %	0 %	0 %	501148405
36	NC_021234	A	6	6	14758	14763	100 %	0 %	0 %	0 %	501148405
37	NC_021234	A	6	6	17030	17035	100 %	0 %	0 %	0 %	501148407
38	NC_021234	A	6	6	17124	17129	100 %	0 %	0 %	0 %	501148407
39	NC_021234	T	6	6	17406	17411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021234	T	7	7	17713	17719	0 %	100 %	0 %	0 %	501148408
41	NC_021234	T	6	6	18261	18266	0 %	100 %	0 %	0 %	501148408
42	NC_021234	T	6	6	18357	18362	0 %	100 %	0 %	0 %	501148408
43	NC_021234	T	6	6	19153	19158	0 %	100 %	0 %	0 %	501148409
44	NC_021234	T	6	6	19889	19894	0 %	100 %	0 %	0 %	501148409
45	NC_021234	A	6	6	20377	20382	100 %	0 %	0 %	0 %	501148409
46	NC_021234	T	7	7	20765	20771	0 %	100 %	0 %	0 %	501148410
47	NC_021234	T	7	7	22556	22562	0 %	100 %	0 %	0 %	501148410
48	NC_021234	T	7	7	23202	23208	0 %	100 %	0 %	0 %	501148410
49	NC_021234	T	6	6	24229	24234	0 %	100 %	0 %	0 %	501148411
50	NC_021234	A	6	6	24381	24386	100 %	0 %	0 %	0 %	501148411
51	NC_021234	T	6	6	24628	24633	0 %	100 %	0 %	0 %	501148411
52	NC_021234	T	6	6	25009	25014	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
53	NC_021234	T	8	8	25117	25124	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
54	NC_021234	T	7	7	25442	25448	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
55	NC_021234	T	7	7	25511	25517	0 %	100 %	0 %	0 %	501148412
56	NC_021234	T	6	6	26272	26277	0 %	100 %	0 %	0 %	501148413
57	NC_021234	T	8	8	26425	26432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021234	T	6	6	26442	26447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021234	T	6	6	26699	26704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021234	A	6	6	26900	26905	100 %	0 %	0 %	0 %	501148414
61	NC_021234	T	7	7	27627	27633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021234	T	7	7	28052	28058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.