MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 14

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	GCCCTG	2	12	3201	3212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	501148332
2	NC_021233	AGTTAA	2	12	3763	3774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501148333
3	NC_021233	ACGATA	2	12	8345	8356	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021233	TTGCTG	2	12	9446	9457	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	501148339
5	NC_021233	ATCTTT	2	12	13525	13536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501148342
6	NC_021233	ATTTTC	2	12	13684	13695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501148342
7	NC_021233	TCGCCA	2	12	28530	28541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	501148358
8	NC_021233	TATCCA	2	12	29754	29765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148359
9	NC_021233	ACATAT	2	12	31562	31573	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021233	TGGCAA	2	12	33128	33139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	501148363
11	NC_021233	TGGGGC	2	12	34789	34800	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	501148365
12	NC_021233	ATGCAG	2	12	37941	37952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	501148369
13	NC_021233	CACACG	2	12	42224	42235	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	501148375
14	NC_021233	CGCCAG	2	12	44299	44310	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	501148376

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.