MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	ACATT	2	10	1110	1119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021233	GAAGA	2	10	1161	1170	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021233	GTTTT	2	10	1284	1293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021233	TTCTA	2	10	2664	2673	20 %	60 %	0 %	20 %	501148331
5	NC_021233	GCATG	2	10	4722	4731	20 %	20 %	40 %	20 %	501148334
6	NC_021233	TAAAA	2	10	5262	5271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021233	CAAGT	2	10	6095	6104	40 %	20 %	20 %	20 %	501148337
8	NC_021233	GCTAC	2	10	6272	6281	20 %	20 %	20 %	40 %	501148338
9	NC_021233	AATTA	2	10	6910	6919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021233	ATGTC	2	10	7859	7868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021233	TAACA	2	10	8252	8261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021233	GCTAA	2	10	10176	10185	40 %	20 %	20 %	20 %	501148340
13	NC_021233	AAATC	2	10	10957	10966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021233	GAACA	2	10	11080	11089	60 %	0 %	20 %	20 %	501148341
15	NC_021233	TTTTC	2	10	11124	11133	0 %	80 %	0 %	20 %	501148341
16	NC_021233	TTTGT	2	10	11580	11589	0 %	80 %	20 %	0 %	501148341
17	NC_021233	TCAAA	2	10	14306	14315	60 %	20 %	0 %	20 %	501148343
18	NC_021233	ACTGG	2	10	15903	15912	20 %	20 %	40 %	20 %	501148345
19	NC_021233	AAAAT	2	10	16727	16736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021233	TCGTT	2	10	16911	16920	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021233	GAAAA	2	10	19198	19207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021233	AATTT	2	10	19961	19970	40 %	60 %	0 %	0 %	501148347
23	NC_021233	TAGGA	2	10	20456	20465	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021233	TTAGT	2	10	20831	20840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021233	CAAAT	2	10	21096	21105	60 %	20 %	0 %	20 %	501148349
26	NC_021233	CAGAT	2	10	21494	21503	40 %	20 %	20 %	20 %	501148349
27	NC_021233	TTAAA	2	10	25112	25121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021233	TCAAT	2	10	25309	25318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021233	TCATA	2	10	25539	25548	40 %	40 %	0 %	20 %	501148353
30	NC_021233	ATTGG	2	10	26103	26112	20 %	40 %	40 %	0 %	501148354
31	NC_021233	AGAAA	2	10	26228	26237	80 %	0 %	20 %	0 %	501148354
32	NC_021233	CCAGT	2	10	29020	29029	20 %	20 %	20 %	40 %	501148358
33	NC_021233	TGGCT	2	10	29785	29794	0 %	40 %	40 %	20 %	501148359
34	NC_021233	ATGGA	2	10	30004	30013	40 %	20 %	40 %	0 %	501148359
35	NC_021233	AGTCA	2	10	31472	31481	40 %	20 %	20 %	20 %	501148360
36	NC_021233	ACCAC	2	10	32760	32769	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_021233	CTCAT	2	10	32780	32789	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_021233	ATTTA	2	10	32851	32860	40 %	60 %	0 %	0 %	501148363
39	NC_021233	GCTTC	2	10	33074	33083	0 %	40 %	20 %	40 %	501148363
40	NC_021233	TAAGT	2	10	34308	34317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021233	GTTGA	2	10	34637	34646	20 %	40 %	40 %	0 %	501148365
42	NC_021233	CAAAT	2	10	35257	35266	60 %	20 %	0 %	20 %	501148366
43	NC_021233	GTCAA	2	10	36483	36492	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021233	ACTGA	2	10	37751	37760	40 %	20 %	20 %	20 %	501148369
45	NC_021233	AATTC	2	10	38183	38192	40 %	40 %	0 %	20 %	501148369
46	NC_021233	CCAAT	2	10	38540	38549	40 %	20 %	0 %	40 %	501148369
47	NC_021233	ATGTT	2	10	38934	38943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021233	TAAAA	2	10	39300	39309	80 %	20 %	0 %	0 %	501148370
49	NC_021233	AAAAC	2	10	39603	39612	80 %	0 %	0 %	20 %	501148370
50	NC_021233	AGCTG	2	10	40143	40152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021233	ATTTT	2	10	41483	41492	20 %	80 %	0 %	0 %	501148374
52	NC_021233	AGCTT	2	10	43490	43499	20 %	40 %	20 %	20 %	501148375
53	NC_021233	GCTAA	2	10	46209	46218	40 %	20 %	20 %	20 %	501148378
54	NC_021233	AAATC	2	10	46990	46999	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021233	ATTTT	2	10	47098	47107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021233	ATAAA	2	10	47542	47551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021233	TTTAA	2	10	47937	47946	40 %	60 %	0 %	0 %	501148381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.