MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	ACATT	2	10	1110	1119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021233	GAAGA	2	10	1161	1170	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021233	GTTTT	2	10	1284	1293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021233	TAAAA	2	10	5262	5271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021233	AATTA	2	10	6910	6919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021233	ATGTC	2	10	7859	7868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021233	TAACA	2	10	8252	8261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021233	AAATC	2	10	10957	10966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021233	AAAAT	2	10	16727	16736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021233	TCGTT	2	10	16911	16920	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021233	GAAAA	2	10	19198	19207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021233	TAGGA	2	10	20456	20465	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021233	TTAGT	2	10	20831	20840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021233	TTAAA	2	10	25112	25121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021233	TCAAT	2	10	25309	25318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021233	ACCAC	2	10	32760	32769	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_021233	CTCAT	2	10	32780	32789	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021233	TAAGT	2	10	34308	34317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021233	GTCAA	2	10	36483	36492	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021233	ATGTT	2	10	38934	38943	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021233	AGCTG	2	10	40143	40152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021233	AAATC	2	10	46990	46999	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021233	ATTTT	2	10	47098	47107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021233	ATAAA	2	10	47542	47551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.