MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	CGAA	2	8	121	128	50 %	0 %	25 %	25 %	501148329
2	NC_021233	AATC	2	8	500	507	50 %	25 %	0 %	25 %	501148329
3	NC_021233	ATCG	2	8	629	636	25 %	25 %	25 %	25 %	501148329
4	NC_021233	ACTA	2	8	700	707	50 %	25 %	0 %	25 %	501148329
5	NC_021233	ATTG	2	8	1128	1135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021233	TTAA	2	8	1256	1263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021233	CTTT	2	8	1486	1493	0 %	75 %	0 %	25 %	501148330
8	NC_021233	ATCA	2	8	2022	2029	50 %	25 %	0 %	25 %	501148330
9	NC_021233	GATG	2	8	2575	2582	25 %	25 %	50 %	0 %	501148331
10	NC_021233	AAGG	2	8	3096	3103	50 %	0 %	50 %	0 %	501148332
11	NC_021233	AACA	2	8	3403	3410	75 %	0 %	0 %	25 %	501148332
12	NC_021233	ACCT	2	8	3675	3682	25 %	25 %	0 %	50 %	501148333
13	NC_021233	GCCA	2	8	3950	3957	25 %	0 %	25 %	50 %	501148333
14	NC_021233	TCGC	2	8	4773	4780	0 %	25 %	25 %	50 %	501148334
15	NC_021233	AATT	2	8	5187	5194	50 %	50 %	0 %	0 %	501148335
16	NC_021233	TTGG	2	8	5900	5907	0 %	50 %	50 %	0 %	501148337
17	NC_021233	GAGT	2	8	6285	6292	25 %	25 %	50 %	0 %	501148338
18	NC_021233	TTCA	2	8	6356	6363	25 %	50 %	0 %	25 %	501148338
19	NC_021233	TTCC	2	8	6474	6481	0 %	50 %	0 %	50 %	501148338
20	NC_021233	AATT	2	8	6556	6563	50 %	50 %	0 %	0 %	501148338
21	NC_021233	CAAG	2	8	6698	6705	50 %	0 %	25 %	25 %	501148338
22	NC_021233	ACTA	2	8	7242	7249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021233	ATAG	2	8	7749	7756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021233	AGTT	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021233	CGCA	2	8	8618	8625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021233	ACTA	2	8	8762	8769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021233	ACGA	2	8	8918	8925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021233	TTAC	2	8	9603	9610	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
29	NC_021233	GCTT	2	8	9673	9680	0 %	50 %	25 %	25 %	501148339
30	NC_021233	CTTA	2	8	9698	9705	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
31	NC_021233	TACT	2	8	9708	9715	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
32	NC_021233	TTAC	2	8	9801	9808	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
33	NC_021233	CGTG	2	8	9888	9895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021233	ATCA	2	8	11263	11270	50 %	25 %	0 %	25 %	501148341
35	NC_021233	GAAA	2	8	12673	12680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021233	AAAT	2	8	12887	12894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021233	ATAA	2	8	13307	13314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021233	AATA	2	8	13410	13417	75 %	25 %	0 %	0 %	501148342
39	NC_021233	TAAA	2	8	13571	13578	75 %	25 %	0 %	0 %	501148342
40	NC_021233	AATT	3	12	13918	13929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021233	AGCG	2	8	14620	14627	25 %	0 %	50 %	25 %	501148343
42	NC_021233	TGAA	2	8	15009	15016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021233	GGCT	2	8	15018	15025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021233	AAGG	2	8	15298	15305	50 %	0 %	50 %	0 %	501148344
45	NC_021233	TCAT	2	8	15857	15864	25 %	50 %	0 %	25 %	501148345
46	NC_021233	TGGC	2	8	16175	16182	0 %	25 %	50 %	25 %	501148345
47	NC_021233	ATTT	2	8	16545	16552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021233	AAAT	2	8	16562	16569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021233	TCGA	2	8	16586	16593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021233	ATCA	2	8	16934	16941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021233	ATTG	2	8	16951	16958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021233	TCTT	2	8	17385	17392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021233	AGGC	2	8	17927	17934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021233	TTAA	2	8	17950	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021233	TAAA	2	8	17987	17994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021233	TTAG	2	8	18365	18372	25 %	50 %	25 %	0 %	501148346
57	NC_021233	CGAT	2	8	18437	18444	25 %	25 %	25 %	25 %	501148346
58	NC_021233	GATT	2	8	18566	18573	25 %	50 %	25 %	0 %	501148346
59	NC_021233	TTCG	2	8	18945	18952	0 %	50 %	25 %	25 %	501148346
60	NC_021233	AATT	2	8	20115	20122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021233	AGCG	2	8	20314	20321	25 %	0 %	50 %	25 %	501148348
62	NC_021233	ATTA	2	8	20413	20420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021233	CCTG	2	8	20622	20629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021233	TTAT	2	8	20875	20882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021233	TATT	2	8	20888	20895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021233	ATAG	2	8	20900	20907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021233	TAAG	2	8	21031	21038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021233	ACGC	2	8	21571	21578	25 %	0 %	25 %	50 %	501148349
69	NC_021233	ATTT	2	8	21620	21627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021233	AGTT	2	8	21850	21857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021233	GATG	2	8	21926	21933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021233	TCGC	2	8	22353	22360	0 %	25 %	25 %	50 %	501148350
73	NC_021233	TAGA	2	8	23182	23189	50 %	25 %	25 %	0 %	501148351
74	NC_021233	GACA	2	8	23894	23901	50 %	0 %	25 %	25 %	501148351
75	NC_021233	TGAT	2	8	24858	24865	25 %	50 %	25 %	0 %	501148352
76	NC_021233	CAAA	2	8	25087	25094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021233	AATC	2	8	25786	25793	50 %	25 %	0 %	25 %	501148353
78	NC_021233	AAGC	2	8	25854	25861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021233	CTTT	2	8	25894	25901	0 %	75 %	0 %	25 %	501148354
80	NC_021233	CTAC	2	8	26028	26035	25 %	25 %	0 %	50 %	501148354
81	NC_021233	TTAG	2	8	26975	26982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021233	CGAT	2	8	27047	27054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021233	GATT	2	8	27176	27183	25 %	50 %	25 %	0 %	501148356
84	NC_021233	TTCG	2	8	27555	27562	0 %	50 %	25 %	25 %	501148356
85	NC_021233	CGCA	2	8	27999	28006	25 %	0 %	25 %	50 %	501148357
86	NC_021233	ACCA	2	8	28930	28937	50 %	0 %	0 %	50 %	501148358
87	NC_021233	AGGA	2	8	29009	29016	50 %	0 %	50 %	0 %	501148358
88	NC_021233	GATT	2	8	30510	30517	25 %	50 %	25 %	0 %	501148359
89	NC_021233	GGCT	2	8	30660	30667	0 %	25 %	50 %	25 %	501148359
90	NC_021233	CAGG	2	8	30885	30892	25 %	0 %	50 %	25 %	501148359
91	NC_021233	GTCG	2	8	31039	31046	0 %	25 %	50 %	25 %	501148359
92	NC_021233	GGCT	2	8	31336	31343	0 %	25 %	50 %	25 %	501148360
93	NC_021233	AAAC	2	8	31656	31663	75 %	0 %	0 %	25 %	501148361
94	NC_021233	ATGG	2	8	31703	31710	25 %	25 %	50 %	0 %	501148361
95	NC_021233	TTAG	2	8	32056	32063	25 %	50 %	25 %	0 %	501148362
96	NC_021233	CGAT	2	8	32128	32135	25 %	25 %	25 %	25 %	501148362
97	NC_021233	GATT	2	8	32257	32264	25 %	50 %	25 %	0 %	501148362
98	NC_021233	TTCG	2	8	32636	32643	0 %	50 %	25 %	25 %	501148362
99	NC_021233	CAAG	2	8	33280	33287	50 %	0 %	25 %	25 %	501148363
100	NC_021233	GTTA	2	8	33576	33583	25 %	50 %	25 %	0 %	501148364
101	NC_021233	AGCG	2	8	33811	33818	25 %	0 %	50 %	25 %	501148364
102	NC_021233	ATTT	2	8	33842	33849	25 %	75 %	0 %	0 %	501148364
103	NC_021233	GGTG	2	8	34289	34296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021233	ATTG	2	8	34324	34331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021233	TGTA	2	8	34386	34393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021233	TTTG	2	8	34749	34756	0 %	75 %	25 %	0 %	501148365
107	NC_021233	TTTC	2	8	35007	35014	0 %	75 %	0 %	25 %	501148366
108	NC_021233	GCAA	2	8	35459	35466	50 %	0 %	25 %	25 %	501148366
109	NC_021233	CACC	2	8	35957	35964	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_021233	AACA	2	8	36225	36232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021233	CGAC	2	8	36351	36358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021233	ACAG	2	8	36648	36655	50 %	0 %	25 %	25 %	501148367
113	NC_021233	CAAA	2	8	38525	38532	75 %	0 %	0 %	25 %	501148369
114	NC_021233	ATGA	2	8	38597	38604	50 %	25 %	25 %	0 %	501148369
115	NC_021233	TGAG	2	8	40378	40385	25 %	25 %	50 %	0 %	501148372
116	NC_021233	ACTC	2	8	40464	40471	25 %	25 %	0 %	50 %	501148372
117	NC_021233	TCAA	2	8	40795	40802	50 %	25 %	0 %	25 %	501148372
118	NC_021233	CTTT	2	8	40924	40931	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021233	ATGA	2	8	41024	41031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021233	TGAC	2	8	41825	41832	25 %	25 %	25 %	25 %	501148375
121	NC_021233	ATTT	2	8	41982	41989	25 %	75 %	0 %	0 %	501148375
122	NC_021233	AAAG	2	8	42051	42058	75 %	0 %	25 %	0 %	501148375
123	NC_021233	AGAA	2	8	42131	42138	75 %	0 %	25 %	0 %	501148375
124	NC_021233	TGGT	2	8	42364	42371	0 %	50 %	50 %	0 %	501148375
125	NC_021233	GAAA	2	8	42544	42551	75 %	0 %	25 %	0 %	501148375
126	NC_021233	TTAA	2	8	42775	42782	50 %	50 %	0 %	0 %	501148375
127	NC_021233	TAAA	2	8	42866	42873	75 %	25 %	0 %	0 %	501148375
128	NC_021233	AACG	2	8	43000	43007	50 %	0 %	25 %	25 %	501148375
129	NC_021233	GCAA	2	8	43422	43429	50 %	0 %	25 %	25 %	501148375
130	NC_021233	TTAT	2	8	43476	43483	25 %	75 %	0 %	0 %	501148375
131	NC_021233	CTAC	2	8	44839	44846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021233	GAAT	2	8	45019	45026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021233	GTTT	2	8	45446	45453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021233	AAGA	2	8	45536	45543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021233	GCCA	2	8	45725	45732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021233	TTAG	2	8	45876	45883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021233	AGTA	2	8	47071	47078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021233	AATG	2	8	48365	48372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021233	TTAG	2	8	48708	48715	25 %	50 %	25 %	0 %	501148382
140	NC_021233	CGAT	2	8	48780	48787	25 %	25 %	25 %	25 %	501148382
141	NC_021233	GATT	2	8	48909	48916	25 %	50 %	25 %	0 %	501148382
142	NC_021233	TTCG	2	8	49288	49295	0 %	50 %	25 %	25 %	501148382
143	NC_021233	AATT	2	8	49485	49492	50 %	50 %	0 %	0 %	501148383
144	NC_021233	ACGA	2	8	49793	49800	50 %	0 %	25 %	25 %	501148384
145	NC_021233	AAGT	2	8	49910	49917	50 %	25 %	25 %	0 %	501148384
146	NC_021233	AATT	2	8	50279	50286	50 %	50 %	0 %	0 %	501148385
147	NC_021233	GCCA	2	8	50794	50801	25 %	0 %	25 %	50 %	501148385
148	NC_021233	AGAT	2	8	50814	50821	50 %	25 %	25 %	0 %	501148385

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.