MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	CAA	2	6	201	206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148329
2	NC_021233	CTA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148329
3	NC_021233	ATG	2	6	536	541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148329
4	NC_021233	TTA	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148329
5	NC_021233	GAC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148329
6	NC_021233	GTA	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148329
7	NC_021233	ACG	3	9	929	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148329
8	NC_021233	AGC	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148330
9	NC_021233	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148330
10	NC_021233	CAT	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148330
11	NC_021233	CGG	2	6	1707	1712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148330
12	NC_021233	CGG	2	6	1737	1742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148330
13	NC_021233	GCC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148330
14	NC_021233	GTT	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148330
15	NC_021233	CGG	2	6	2116	2121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148331
16	NC_021233	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148331
17	NC_021233	TTC	2	6	2249	2254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148331
18	NC_021233	CGT	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148331
19	NC_021233	GCT	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148331
20	NC_021233	GCT	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148331
21	NC_021233	GAC	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148331
22	NC_021233	CAA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148331
23	NC_021233	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148331
24	NC_021233	TGG	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148331
25	NC_021233	AGA	3	9	2718	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148331
26	NC_021233	TAT	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148332
27	NC_021233	GTC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148332
28	NC_021233	GGA	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148332
29	NC_021233	GCA	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148332
30	NC_021233	GCT	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148332
31	NC_021233	GTT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148332
32	NC_021233	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148332
33	NC_021233	TGA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148332
34	NC_021233	GTG	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148332
35	NC_021233	CAG	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148332
36	NC_021233	CAC	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148332
37	NC_021233	GAG	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148333
38	NC_021233	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
39	NC_021233	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148333
40	NC_021233	ATC	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148333
41	NC_021233	TTA	2	6	3557	3562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148333
42	NC_021233	AAG	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
43	NC_021233	CAG	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
44	NC_021233	ACG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
45	NC_021233	CCA	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148333
46	NC_021233	CAA	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148333
47	NC_021233	CAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148333
48	NC_021233	ATT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148333
49	NC_021233	AGC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
50	NC_021233	GCA	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
51	NC_021233	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
52	NC_021233	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
53	NC_021233	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148333
54	NC_021233	TAA	2	6	4249	4254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148333
55	NC_021233	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
56	NC_021233	TGG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148334
57	NC_021233	ACC	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148334
58	NC_021233	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148335
59	NC_021233	TTG	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148335
60	NC_021233	TCA	2	6	5475	5480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148336
61	NC_021233	AAT	2	6	5490	5495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148336
62	NC_021233	ATT	2	6	5508	5513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148336
63	NC_021233	TCT	2	6	5514	5519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148336
64	NC_021233	TTC	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148336
65	NC_021233	TCA	2	6	5553	5558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148336
66	NC_021233	TAA	2	6	5600	5605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148336
67	NC_021233	ACT	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148336
68	NC_021233	GAT	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148336
69	NC_021233	ATC	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148337
70	NC_021233	GTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148337
71	NC_021233	TAA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148337
72	NC_021233	AGC	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148337
73	NC_021233	ATT	3	9	6085	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148337
74	NC_021233	CAA	2	6	6158	6163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148338
75	NC_021233	GCT	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148338
76	NC_021233	TTC	2	6	9320	9325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148339
77	NC_021233	AGT	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148339
78	NC_021233	TAC	2	6	9619	9624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148339
79	NC_021233	CAT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148339
80	NC_021233	GTT	2	6	9778	9783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148339
81	NC_021233	TCA	2	6	10186	10191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148340
82	NC_021233	AAT	2	6	10322	10327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148340
83	NC_021233	GTT	2	6	10367	10372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148340
84	NC_021233	ACC	2	6	10382	10387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148340
85	NC_021233	ACC	2	6	10526	10531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148340
86	NC_021233	CAG	2	6	10549	10554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148340
87	NC_021233	ATG	2	6	10587	10592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148340
88	NC_021233	ATC	2	6	11034	11039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148341
89	NC_021233	TCC	2	6	11149	11154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148341
90	NC_021233	CAG	2	6	11208	11213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148341
91	NC_021233	TTA	2	6	11405	11410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148341
92	NC_021233	CTT	2	6	11484	11489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148341
93	NC_021233	AAC	2	6	11491	11496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148341
94	NC_021233	CCA	2	6	11621	11626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148341
95	NC_021233	TGA	2	6	11644	11649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148341
96	NC_021233	CCA	2	6	11726	11731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148341
97	NC_021233	TTG	2	6	11830	11835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148341
98	NC_021233	CAC	2	6	11844	11849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148341
99	NC_021233	TTA	2	6	11855	11860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148341
100	NC_021233	CCT	2	6	13347	13352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148342
101	NC_021233	CTA	2	6	13563	13568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148342
102	NC_021233	ATG	2	6	13591	13596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148342
103	NC_021233	CAC	2	6	13614	13619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148342
104	NC_021233	AGT	2	6	13672	13677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148342
105	NC_021233	GGT	2	6	14201	14206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148343
106	NC_021233	CGG	2	6	14215	14220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148343
107	NC_021233	GTA	2	6	14223	14228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148343
108	NC_021233	ATA	2	6	14235	14240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148343
109	NC_021233	AAC	2	6	14264	14269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148343
110	NC_021233	ATA	2	6	14298	14303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148343
111	NC_021233	GTA	2	6	14349	14354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148343
112	NC_021233	GAA	2	6	14419	14424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148343
113	NC_021233	TAA	2	6	14458	14463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148343
114	NC_021233	CAA	2	6	14564	14569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148343
115	NC_021233	TTA	2	6	14647	14652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148343
116	NC_021233	CAA	2	6	14671	14676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148343
117	NC_021233	AAG	2	6	14750	14755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148343
118	NC_021233	TTA	2	6	14762	14767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148343
119	NC_021233	CAA	2	6	14839	14844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148343
120	NC_021233	GCA	2	6	15248	15253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148344
121	NC_021233	TTG	2	6	15324	15329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148344
122	NC_021233	GTG	2	6	15788	15793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148345
123	NC_021233	ACA	2	6	16061	16066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148345
124	NC_021233	GAC	2	6	16083	16088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148345
125	NC_021233	TGG	2	6	16110	16115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148345
126	NC_021233	CGT	3	9	18136	18144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148346
127	NC_021233	TAC	2	6	18222	18227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148346
128	NC_021233	GTC	2	6	18392	18397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148346
129	NC_021233	TAA	2	6	18451	18456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148346
130	NC_021233	ATC	2	6	18530	18535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148346
131	NC_021233	TAG	2	6	18681	18686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148346
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135	NC_021233	TGA	2	6	19583	19588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148347
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154	NC_021233	CTT	2	6	22313	22318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148350
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239	NC_021233	CAT	2	6	30267	30272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148359
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250	NC_021233	CAA	2	6	31066	31071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148359
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254	NC_021233	CAA	2	6	31315	31320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148360
255	NC_021233	TGC	2	6	31364	31369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148360
256	NC_021233	ACA	2	6	31482	31487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148360
257	NC_021233	CCA	2	6	31491	31496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148360
258	NC_021233	GCA	2	6	31634	31639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148361
259	NC_021233	CGT	3	9	31827	31835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148362
260	NC_021233	TAC	2	6	31913	31918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148362
261	NC_021233	GTC	2	6	32083	32088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148362
262	NC_021233	TAA	2	6	32142	32147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148362
263	NC_021233	ATC	2	6	32221	32226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148362
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266	NC_021233	ACA	2	6	32820	32825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148363
267	NC_021233	CAA	2	6	32938	32943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148363
268	NC_021233	ACA	2	6	33061	33066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148363
269	NC_021233	TGA	2	6	33381	33386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148364
270	NC_021233	TGA	2	6	33516	33521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148364
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292	NC_021233	CTT	2	6	35445	35450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148366
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377	NC_021233	CAA	2	6	43636	43641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148375
378	NC_021233	GAC	2	6	43648	43653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148375
379	NC_021233	TGA	2	6	43770	43775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
380	NC_021233	ACT	2	6	44350	44355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148376
381	NC_021233	TGA	2	6	44389	44394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148376
382	NC_021233	ACC	2	6	44468	44473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148376
383	NC_021233	GAA	2	6	44507	44512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148376
384	NC_021233	CGA	2	6	44544	44549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148376
385	NC_021233	CAA	2	6	44582	44587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148376
386	NC_021233	TAT	2	6	46036	46041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148377
387	NC_021233	TGC	2	6	46073	46078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148377
388	NC_021233	AAT	2	6	46127	46132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148377
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390	NC_021233	AAT	2	6	46355	46360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148378
391	NC_021233	GTT	2	6	46400	46405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148378
392	NC_021233	ACC	2	6	46415	46420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148378
393	NC_021233	ACC	2	6	46559	46564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148378
394	NC_021233	CAG	2	6	46582	46587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148378
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397	NC_021233	CGA	2	6	47435	47440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148379
398	NC_021233	TTC	2	6	47443	47448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148379
399	NC_021233	ATT	2	6	47594	47599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148380
400	NC_021233	AAC	2	6	47604	47609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148380
401	NC_021233	TCA	2	6	47668	47673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148380
402	NC_021233	TGA	2	6	47700	47705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148380
403	NC_021233	TAT	2	6	47726	47731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148380
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407	NC_021233	CTT	2	6	48103	48108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148381
408	NC_021233	GGC	2	6	48142	48147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148381
409	NC_021233	CTA	2	6	48165	48170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148381
410	NC_021233	TAA	2	6	48251	48256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148381
411	NC_021233	TCT	2	6	48265	48270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148381
412	NC_021233	CGT	3	9	48479	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148382
413	NC_021233	TAC	2	6	48565	48570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148382
414	NC_021233	GTC	2	6	48735	48740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148382
415	NC_021233	TAA	2	6	48794	48799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148382
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419	NC_021233	CAA	2	6	49475	49480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148383
420	NC_021233	TCT	2	6	49554	49559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148383
421	NC_021233	TAT	2	6	49761	49766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148384
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.