MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021232	TAAGCG	2	12	40628	40639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021232	CAAAAA	2	12	88135	88146	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021232	CAGAGA	2	12	253891	253902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021232	CCTTTA	2	12	297925	297936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021232	AGGCTG	2	12	326828	326839	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021232	TAAAAT	2	12	408457	408468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021232	GGCGAC	2	12	435321	435332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021232	GGTCTT	2	12	484416	484427	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021232	CGACGT	2	12	484464	484475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021232	CGGACT	2	12	542125	542136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021232	TGAGTA	2	12	560280	560291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021232	GGGCGC	2	12	604350	604361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021232	TGATAG	2	12	605103	605114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021232	GTCGGC	2	12	652201	652212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021232	CCCTCA	2	12	656678	656689	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021232	GAGGGG	2	12	661187	661198	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021232	GTATTT	2	12	698116	698127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021232	TCCCTC	2	12	703180	703191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021232	AGGGTG	2	12	703204	703215	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021232	GTCAAC	2	12	718989	719000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021232	AATATA	2	12	720647	720658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021232	GATGGC	2	12	742403	742414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021232	AAAAAC	2	12	780324	780335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021232	GAAGAG	2	12	784102	784113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021232	TTTTTG	2	12	848200	848211	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021232	ATCCAT	2	12	855280	855291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021232	GACGGC	2	12	893903	893914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021232	AATGAT	2	12	936910	936921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021232	GCTGAT	2	12	982220	982231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021232	GCCCTG	2	12	1028457	1028468	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021232	AGCGCG	2	12	1040190	1040201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021232	TTTTTA	2	12	1054595	1054606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021232	CGCCAG	2	12	1087689	1087700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021232	AAATAT	2	12	1115085	1115096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021232	TCAGGC	2	12	1263852	1263863	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021232	ATGTCG	2	12	1289800	1289811	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021232	AAATAT	2	12	1315796	1315807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021232	GCCAGC	2	12	1351644	1351655	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021232	TAAACC	2	12	1351916	1351927	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021232	GGCTGC	2	12	1377239	1377250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021232	TAAAAT	2	12	1390412	1390423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021232	CGCAAC	2	12	1391012	1391023	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021232	GTGGGC	2	12	1391952	1391963	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021232	TTTTTG	2	12	1424901	1424912	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021232	CCCTGC	4	24	1425132	1425155	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021232	GCGCCG	2	12	1478059	1478070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021232	GCCTGC	2	12	1529405	1529416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021232	ACGAGA	2	12	1555830	1555841	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021232	ACTTTC	2	12	1575421	1575432	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021232	GCAAAC	2	12	1650998	1651009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021232	CGCAGC	2	12	1722791	1722802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021232	CGAATC	2	12	1731358	1731369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021232	TTTATT	2	12	1742237	1742248	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021232	TTCATA	2	12	1783804	1783815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021232	AAACAA	2	12	1792328	1792339	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021232	TCTCCT	2	12	1796265	1796276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021232	ACTTAT	2	12	1801488	1801499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021232	ATCGCC	2	12	1809278	1809289	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021232	GTTTAC	2	12	1838450	1838461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021232	TAGCAA	2	12	1849696	1849707	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021232	CTTTTT	2	12	1857567	1857578	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021232	GATCGC	2	12	1861389	1861400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021232	GTTAAC	2	12	1861412	1861423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021232	TTTTTC	2	12	1861569	1861580	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021232	GCCAGC	2	12	1950686	1950697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021232	AGCTGA	2	12	1957858	1957869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021232	GTGGCT	2	12	2010013	2010024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021232	CTCCCT	2	12	2021983	2021994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021232	GCACTT	2	12	2037418	2037429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021232	GTTTTT	2	12	2046042	2046053	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021232	CGCAAC	2	12	2065060	2065071	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021232	TTTTCT	2	12	2095156	2095167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021232	CTCCCC	2	12	2116782	2116793	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_021232	TTAATG	2	12	2118944	2118955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021232	TTTTGC	2	12	2178265	2178276	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021232	CGATGC	2	12	2232910	2232921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021232	GAAAAA	2	12	2239867	2239878	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021232	ATCGTC	2	12	2257872	2257883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021232	CTTTTC	2	12	2289327	2289338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021232	AAAAGC	2	12	2336226	2336237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021232	GGTTGT	2	12	2346942	2346953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021232	GATGCC	2	12	2350028	2350039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021232	TGGTTG	2	12	2352457	2352468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021232	GGGAAA	2	12	2377814	2377825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021232	GGCGCG	2	12	2385649	2385660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021232	AAGGAG	2	12	2424836	2424847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021232	CCTTAG	2	12	2503543	2503554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021232	TTATGT	2	12	2503939	2503950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021232	GAGATT	2	12	2508251	2508262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021232	ATCTTT	2	12	2572265	2572276	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021232	TTCAGG	2	12	2638048	2638059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021232	GAGTAG	2	12	2683628	2683639	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021232	AAACAA	2	12	2688252	2688263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021232	GCATCA	2	12	2708035	2708046	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021232	CGTCAT	2	12	2713636	2713647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021232	CTGCCG	2	12	2716019	2716030	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021232	ATCTTT	2	12	2767333	2767344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021232	TGGTTT	2	12	2847887	2847898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021232	TTGATC	2	12	2848260	2848271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_021232	GCCCAC	2	12	2866467	2866478	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021232	CGTTAA	2	12	2889160	2889171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021232	TGCGCG	2	12	2929437	2929448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021232	TGCGCG	2	12	2929721	2929732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021232	TGCGCG	2	12	2929862	2929873	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021232	TGATGT	2	12	2931569	2931580	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021232	GGGCTG	2	12	2985851	2985862	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021232	GATGCG	2	12	3033404	3033415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021232	TGCCTC	2	12	3039854	3039865	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021232	TATGTT	2	12	3060132	3060143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021232	AAAAAG	2	12	3093080	3093091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021232	CAGCGC	2	12	3094490	3094501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021232	ATCAGG	2	12	3140907	3140918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021232	AGTGTA	2	12	3169573	3169584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021232	TGGCTC	2	12	3178810	3178821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021232	GGGTAT	2	12	3209764	3209775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021232	CTTGCG	2	12	3213550	3213561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021232	TTATAA	2	12	3227218	3227229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021232	CTTTCA	2	12	3264708	3264719	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021232	ATATTT	2	12	3265049	3265060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021232	TAAATA	2	12	3265065	3265076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021232	GAATAA	2	12	3338676	3338687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021232	AGATAA	2	12	3355183	3355194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021232	CGTTTT	2	12	3382322	3382333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021232	AAAATA	2	12	3398852	3398863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021232	CTGCCG	2	12	3426927	3426938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021232	GGTGAT	2	12	3430554	3430565	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021232	CGATCC	2	12	3472243	3472254	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021232	AGCGTC	2	12	3486040	3486051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021232	AAGAAA	2	12	3497950	3497961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021232	TGTCAG	2	12	3525423	3525434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021232	TGCGGT	2	12	3545585	3545596	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_021232	ATCAAT	2	12	3554127	3554138	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021232	CCTTTG	2	12	3607490	3607501	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021232	AAGGTG	2	12	3677135	3677146	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021232	GGGAAT	2	12	3678191	3678202	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021232	GGAGAT	2	12	3776508	3776519	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021232	CACGTC	2	12	3801328	3801339	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021232	ATTTTC	2	12	3925291	3925302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_021232	AATTAA	2	12	3931679	3931690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021232	CCTGCG	2	12	3972443	3972454	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021232	AGGGAG	2	12	4069735	4069746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021232	TTGGCC	2	12	4100948	4100959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021232	GGGCAG	2	12	4122491	4122502	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_021232	CGTGAG	2	12	4145806	4145817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_021232	CATCTT	2	12	4196272	4196283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021232	GGCGAT	2	12	4200937	4200948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_021232	GTAAGC	2	12	4265187	4265198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_021232	CGCCAG	2	12	4326060	4326071	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021232	CTGAAC	2	12	4326078	4326089	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021232	TCAGCT	2	12	4376971	4376982	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021232	CGTCAG	2	12	4377068	4377079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_021232	AGGAAA	2	12	4396831	4396842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021232	CTGGCG	2	12	4420848	4420859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021232	CAGGAA	2	12	4493923	4493934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_021232	GAGCGC	2	12	4520819	4520830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_021232	GCCTAC	2	12	4561291	4561302	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_021232	TCGATA	2	12	4570494	4570505	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_021232	AGTTGT	2	12	4632105	4632116	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021232	TTCACT	2	12	4715513	4715524	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021232	ATTAAC	2	12	4726404	4726415	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_021232	CTGTAT	2	12	4739451	4739462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_021232	AGGTTT	2	12	4792979	4792990	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021232	CGATCC	2	12	4813122	4813133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
164	NC_021232	AATGAT	2	12	4819358	4819369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021232	CCCTCT	2	12	4821755	4821766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_021232	TTTAAA	2	12	4889154	4889165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021232	ACAAAA	2	12	4890538	4890549	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_021232	CTGTGC	2	12	4925846	4925857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021232	CAAAAG	2	12	4974690	4974701	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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176	NC_021232	CAGGAA	2	12	5047031	5047042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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179	NC_021232	GGGCGC	2	12	5146741	5146752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_021232	AGCCAC	2	12	5166886	5166897	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
181	NC_021232	ATCGTT	2	12	5188753	5188764	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_021232	CGCAGG	2	12	5194345	5194356	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.