MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	CCGGCG	2	12	4416	4427	0 %	0 %	50 %	50 %	529974885
2	NC_021231	TCAGTG	2	12	5682	5693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529974885
3	NC_021231	CGCTGG	2	12	7495	7506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529974886
4	NC_021231	CTGGTG	2	12	17050	17061	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	529974897
5	NC_021231	ACCTGA	2	12	17230	17241	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021231	AGCTGA	2	12	22536	22547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529974901
7	NC_021231	TATCCA	2	12	29951	29962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529974907
8	NC_021231	AGAGGC	2	12	33107	33118	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	529974912
9	NC_021231	TCAGAA	2	12	33206	33217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529974912
10	NC_021231	GCTGGC	2	12	35888	35899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529974915
11	NC_021231	CGACGG	2	12	45240	45251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529974924
12	NC_021231	CAGGCT	2	12	46570	46581	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529974927
13	NC_021231	CCAGCG	2	12	48575	48586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529974930
14	NC_021231	TTCCTG	2	12	49980	49991	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021231	GGCAAA	2	12	50450	50461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	529974932
16	NC_021231	TTATCC	2	12	52185	52196	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	529974933
17	NC_021231	CCCGCT	2	12	54742	54753	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	529974933
18	NC_021231	TTATCC	2	12	56028	56039	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	529974933
19	NC_021231	CATCAG	2	12	58261	58272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529974934
20	NC_021231	AACACC	2	12	60658	60669	50 %	0 %	0 %	50 %	529974937
21	NC_021231	CGGTTT	2	12	68911	68922	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	529974946
22	NC_021231	GTGACC	2	12	68937	68948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529974946
23	NC_021231	CTTCCC	2	12	69053	69064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529974946
24	NC_021231	GTGATG	2	12	73488	73499	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	529974952
25	NC_021231	TCAGCG	2	12	74767	74778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529974952
26	NC_021231	TCTCCA	2	12	75151	75162	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	529974952
27	NC_021231	TCCTTT	2	12	84173	84184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529974968
28	NC_021231	TCTGGT	2	12	84637	84648	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021231	AAAAAT	2	12	85129	85140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529974969
30	NC_021231	TGACGT	2	12	88342	88353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529974974
31	NC_021231	CAGCGG	2	12	91844	91855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529974981
32	NC_021231	TTTTCA	2	12	92559	92570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	529974982
33	NC_021231	TTGACC	2	12	96045	96056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021231	TTCGTC	2	12	97796	97807	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529974989
35	NC_021231	GCCAGC	2	12	101177	101188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529974996
36	NC_021231	ACGATG	2	12	101995	102006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529974996
37	NC_021231	CGTCGG	2	12	103380	103391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529974999
38	NC_021231	CAGCTG	2	12	104050	104061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529974999
39	NC_021231	ACGTGC	2	12	106837	106848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529975003
40	NC_021231	CACTGA	2	12	108712	108723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529975005

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.