MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	ATTT	2	8	186	193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021231	AACG	2	8	426	433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021231	CCAA	2	8	467	474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021231	CGTC	2	8	654	661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021231	CTCA	2	8	3548	3555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021231	CCAT	2	8	10632	10639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021231	TAAT	2	8	10640	10647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021231	ATGA	2	8	14458	14465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021231	GAAG	2	8	14688	14695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021231	TTCA	2	8	14876	14883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021231	CCGG	2	8	14956	14963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021231	TCAG	2	8	14999	15006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021231	ATTA	2	8	15891	15898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021231	AATT	2	8	15914	15921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021231	ATTT	2	8	19624	19631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021231	TCAC	2	8	20050	20057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021231	GCGG	2	8	27085	27092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021231	TATT	2	8	29326	29333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021231	GTCA	2	8	31180	31187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021231	GCAT	2	8	31273	31280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021231	ATTG	2	8	34058	34065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021231	GGCG	2	8	35067	35074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021231	TATT	2	8	35120	35127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021231	AAGT	2	8	35957	35964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021231	AGCC	2	8	38577	38584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021231	AATT	2	8	38666	38673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021231	ATCC	2	8	43628	43635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021231	TTAA	2	8	44329	44336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021231	ATTA	2	8	45654	45661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021231	GACT	2	8	46006	46013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021231	CTGC	2	8	47651	47658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021231	GAAT	2	8	47781	47788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021231	TTTA	2	8	48703	48710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021231	TCAA	2	8	48905	48912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021231	GTCT	2	8	49000	49007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021231	CAGC	2	8	50747	50754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021231	ATAA	2	8	59213	59220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021231	AAAT	2	8	59281	59288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021231	GAAT	2	8	59336	59343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021231	TAAA	2	8	65302	65309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021231	AGAT	2	8	65367	65374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021231	CTGG	2	8	65457	65464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021231	CCCT	2	8	69919	69926	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_021231	GTCT	2	8	69963	69970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021231	CTTT	2	8	76493	76500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021231	GCAT	2	8	77595	77602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021231	ATTT	2	8	82565	82572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021231	AAAC	2	8	82904	82911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021231	TATT	2	8	82965	82972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021231	AAAC	2	8	83017	83024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021231	AATT	2	8	83848	83855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021231	TAAG	2	8	84366	84373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021231	GGAG	2	8	84679	84686	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021231	GCCT	2	8	84735	84742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021231	TATT	2	8	86149	86156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021231	CCTG	2	8	87120	87127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021231	CCTG	2	8	87132	87139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021231	TTTA	2	8	88512	88519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021231	GCAG	2	8	88928	88935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021231	GCGG	2	8	88974	88981	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021231	GTAG	2	8	90108	90115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021231	CAGA	2	8	96258	96265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021231	CCCT	2	8	96695	96702	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_021231	CCGT	2	8	100570	100577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021231	TAAA	2	8	104290	104297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021231	GGAG	2	8	105828	105835	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021231	CGAC	2	8	108222	108229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021231	CTCC	2	8	109512	109519	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_021231	TAAT	2	8	111235	111242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.