MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	CTGG	2	8	1424	1431	0 %	25 %	50 %	25 %	529974881
2	NC_021231	GTCA	2	8	1471	1478	25 %	25 %	25 %	25 %	529974881
3	NC_021231	GGCA	2	8	1662	1669	25 %	0 %	50 %	25 %	529974882
4	NC_021231	CTGG	2	8	1782	1789	0 %	25 %	50 %	25 %	529974882
5	NC_021231	AGCC	2	8	2048	2055	25 %	0 %	25 %	50 %	529974882
6	NC_021231	CAAA	2	8	2110	2117	75 %	0 %	0 %	25 %	529974882
7	NC_021231	AGAA	2	8	3033	3040	75 %	0 %	25 %	0 %	529974883
8	NC_021231	GTCA	2	8	3134	3141	25 %	25 %	25 %	25 %	529974883
9	NC_021231	CAGC	2	8	3904	3911	25 %	0 %	25 %	50 %	529974884
10	NC_021231	TTCC	2	8	4389	4396	0 %	50 %	0 %	50 %	529974885
11	NC_021231	CAGC	2	8	4552	4559	25 %	0 %	25 %	50 %	529974885
12	NC_021231	AGGA	2	8	4911	4918	50 %	0 %	50 %	0 %	529974885
13	NC_021231	CCAG	2	8	5505	5512	25 %	0 %	25 %	50 %	529974885
14	NC_021231	CGAA	2	8	5590	5597	50 %	0 %	25 %	25 %	529974885
15	NC_021231	GGCA	2	8	5630	5637	25 %	0 %	50 %	25 %	529974885
16	NC_021231	AACT	2	8	6104	6111	50 %	25 %	0 %	25 %	529974886
17	NC_021231	TGAT	2	8	6827	6834	25 %	50 %	25 %	0 %	529974886
18	NC_021231	GAAT	2	8	7021	7028	50 %	25 %	25 %	0 %	529974886
19	NC_021231	CAGT	2	8	7537	7544	25 %	25 %	25 %	25 %	529974886
20	NC_021231	AATA	2	8	8170	8177	75 %	25 %	0 %	0 %	529974887
21	NC_021231	GTAA	2	8	8356	8363	50 %	25 %	25 %	0 %	529974887
22	NC_021231	CAGG	2	8	8526	8533	25 %	0 %	50 %	25 %	529974887
23	NC_021231	CGCC	2	8	8623	8630	0 %	0 %	25 %	75 %	529974887
24	NC_021231	GTCA	2	8	8637	8644	25 %	25 %	25 %	25 %	529974887
25	NC_021231	CTGG	2	8	8793	8800	0 %	25 %	50 %	25 %	529974887
26	NC_021231	TGAA	2	8	9675	9682	50 %	25 %	25 %	0 %	529974888
27	NC_021231	GACA	2	8	10333	10340	50 %	0 %	25 %	25 %	529974889
28	NC_021231	TCGT	2	8	11189	11196	0 %	50 %	25 %	25 %	529974890
29	NC_021231	GCTG	2	8	11442	11449	0 %	25 %	50 %	25 %	529974890
30	NC_021231	GGCA	2	8	11473	11480	25 %	0 %	50 %	25 %	529974890
31	NC_021231	GCAG	2	8	11688	11695	25 %	0 %	50 %	25 %	529974891
32	NC_021231	AGGC	2	8	11820	11827	25 %	0 %	50 %	25 %	529974891
33	NC_021231	GCCA	2	8	12033	12040	25 %	0 %	25 %	50 %	529974892
34	NC_021231	CCGG	2	8	12193	12200	0 %	0 %	50 %	50 %	529974892
35	NC_021231	GCCA	2	8	12437	12444	25 %	0 %	25 %	50 %	529974892
36	NC_021231	AAGA	2	8	12451	12458	75 %	0 %	25 %	0 %	529974892
37	NC_021231	TCTG	2	8	12492	12499	0 %	50 %	25 %	25 %	529974892
38	NC_021231	TCCT	2	8	12912	12919	0 %	50 %	0 %	50 %	529974894
39	NC_021231	GCGG	2	8	12924	12931	0 %	0 %	75 %	25 %	529974894
40	NC_021231	TGCC	2	8	13067	13074	0 %	25 %	25 %	50 %	529974894
41	NC_021231	CGGC	2	8	13573	13580	0 %	0 %	50 %	50 %	529974894
42	NC_021231	GGAT	2	8	13855	13862	25 %	25 %	50 %	0 %	529974894
43	NC_021231	AGCC	2	8	15137	15144	25 %	0 %	25 %	50 %	529974895
44	NC_021231	ATTC	2	8	15151	15158	25 %	50 %	0 %	25 %	529974895
45	NC_021231	AACG	2	8	15204	15211	50 %	0 %	25 %	25 %	529974895
46	NC_021231	AAAG	2	8	15257	15264	75 %	0 %	25 %	0 %	529974895
47	NC_021231	GCTG	2	8	16740	16747	0 %	25 %	50 %	25 %	529974897
48	NC_021231	GGCA	2	8	18558	18565	25 %	0 %	50 %	25 %	529974898
49	NC_021231	TGCT	2	8	20155	20162	0 %	50 %	25 %	25 %	529974900
50	NC_021231	ACTG	2	8	20499	20506	25 %	25 %	25 %	25 %	529974900
51	NC_021231	GCCA	2	8	20531	20538	25 %	0 %	25 %	50 %	529974900
52	NC_021231	ATCA	2	8	20640	20647	50 %	25 %	0 %	25 %	529974900
53	NC_021231	TTGA	2	8	20952	20959	25 %	50 %	25 %	0 %	529974900
54	NC_021231	CAGA	2	8	21093	21100	50 %	0 %	25 %	25 %	529974900
55	NC_021231	TGAT	2	8	21307	21314	25 %	50 %	25 %	0 %	529974900
56	NC_021231	GGTG	2	8	21365	21372	0 %	25 %	75 %	0 %	529974900
57	NC_021231	AAAC	2	8	21759	21766	75 %	0 %	0 %	25 %	529974900
58	NC_021231	GCCA	2	8	21984	21991	25 %	0 %	25 %	50 %	529974900
59	NC_021231	CTGA	2	8	23168	23175	25 %	25 %	25 %	25 %	529974901
60	NC_021231	TGAC	2	8	23494	23501	25 %	25 %	25 %	25 %	529974901
61	NC_021231	TGCC	2	8	23684	23691	0 %	25 %	25 %	50 %	529974901
62	NC_021231	GACG	2	8	24997	25004	25 %	0 %	50 %	25 %	529974901
63	NC_021231	ATGA	2	8	25527	25534	50 %	25 %	25 %	0 %	529974902
64	NC_021231	TGGT	2	8	26649	26656	0 %	50 %	50 %	0 %	529974903
65	NC_021231	TCCC	2	8	26898	26905	0 %	25 %	0 %	75 %	529974903
66	NC_021231	TGAG	2	8	27644	27651	25 %	25 %	50 %	0 %	529974904
67	NC_021231	GCCA	2	8	28210	28217	25 %	0 %	25 %	50 %	529974904
68	NC_021231	GCTG	2	8	28648	28655	0 %	25 %	50 %	25 %	529974905
69	NC_021231	AGCG	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	529974906
70	NC_021231	CCGC	2	8	29806	29813	0 %	0 %	25 %	75 %	529974906
71	NC_021231	TTCC	2	8	30054	30061	0 %	50 %	0 %	50 %	529974907
72	NC_021231	CCGG	2	8	30449	30456	0 %	0 %	50 %	50 %	529974908
73	NC_021231	CTGC	2	8	32286	32293	0 %	25 %	25 %	50 %	529974912
74	NC_021231	GCTG	2	8	32369	32376	0 %	25 %	50 %	25 %	529974912
75	NC_021231	AATG	2	8	33254	33261	50 %	25 %	25 %	0 %	529974912
76	NC_021231	TGGT	2	8	34636	34643	0 %	50 %	50 %	0 %	529974914
77	NC_021231	TCCC	2	8	34885	34892	0 %	25 %	0 %	75 %	529974914
78	NC_021231	CGGA	2	8	36007	36014	25 %	0 %	50 %	25 %	529974916
79	NC_021231	CGGC	2	8	36346	36353	0 %	0 %	50 %	50 %	529974916
80	NC_021231	AGTA	2	8	36524	36531	50 %	25 %	25 %	0 %	529974916
81	NC_021231	CTCC	2	8	36800	36807	0 %	25 %	0 %	75 %	529974917
82	NC_021231	CCCT	2	8	37027	37034	0 %	25 %	0 %	75 %	529974917
83	NC_021231	CAGC	2	8	37128	37135	25 %	0 %	25 %	50 %	529974917
84	NC_021231	AGAA	2	8	37187	37194	75 %	0 %	25 %	0 %	529974917
85	NC_021231	TTTC	2	8	37198	37205	0 %	75 %	0 %	25 %	529974917
86	NC_021231	CAGA	2	8	37579	37586	50 %	0 %	25 %	25 %	529974917
87	NC_021231	TAAC	2	8	37808	37815	50 %	25 %	0 %	25 %	529974918
88	NC_021231	ATTG	2	8	37831	37838	25 %	50 %	25 %	0 %	529974918
89	NC_021231	TCCT	2	8	39450	39457	0 %	50 %	0 %	50 %	529974920
90	NC_021231	GCGG	2	8	39462	39469	0 %	0 %	75 %	25 %	529974920
91	NC_021231	TGCC	2	8	39605	39612	0 %	25 %	25 %	50 %	529974920
92	NC_021231	CGGC	2	8	40111	40118	0 %	0 %	50 %	50 %	529974920
93	NC_021231	GGAT	2	8	40393	40400	25 %	25 %	50 %	0 %	529974920
94	NC_021231	TCGT	2	8	41022	41029	0 %	50 %	25 %	25 %	529974921
95	NC_021231	GCTG	2	8	41275	41282	0 %	25 %	50 %	25 %	529974921
96	NC_021231	GGCA	2	8	41306	41313	25 %	0 %	50 %	25 %	529974921
97	NC_021231	GCAG	2	8	41522	41529	25 %	0 %	50 %	25 %	529974921
98	NC_021231	AGGC	2	8	41654	41661	25 %	0 %	50 %	25 %	529974921
99	NC_021231	GCCA	2	8	41878	41885	25 %	0 %	25 %	50 %	529974922
100	NC_021231	CCGG	2	8	42038	42045	0 %	0 %	50 %	50 %	529974922
101	NC_021231	GCCA	2	8	42282	42289	25 %	0 %	25 %	50 %	529974922
102	NC_021231	AAGA	2	8	42296	42303	75 %	0 %	25 %	0 %	529974922
103	NC_021231	TCTG	2	8	42337	42344	0 %	50 %	25 %	25 %	529974922
104	NC_021231	GGTG	2	8	44367	44374	0 %	25 %	75 %	0 %	529974924
105	NC_021231	CAGC	2	8	44474	44481	25 %	0 %	25 %	50 %	529974924
106	NC_021231	AGGC	2	8	44510	44517	25 %	0 %	50 %	25 %	529974924
107	NC_021231	CCAG	2	8	44992	44999	25 %	0 %	25 %	50 %	529974924
108	NC_021231	CCGG	2	8	45025	45032	0 %	0 %	50 %	50 %	529974924
109	NC_021231	CGGA	2	8	45188	45195	25 %	0 %	50 %	25 %	529974924
110	NC_021231	TCGC	2	8	45853	45860	0 %	25 %	25 %	50 %	529974926
111	NC_021231	GAAC	2	8	46210	46217	50 %	0 %	25 %	25 %	529974927
112	NC_021231	TTCC	2	8	46509	46516	0 %	50 %	0 %	50 %	529974927
113	NC_021231	GGCA	2	8	46592	46599	25 %	0 %	50 %	25 %	529974927
114	NC_021231	GCCT	2	8	47183	47190	0 %	25 %	25 %	50 %	529974929
115	NC_021231	CAGC	2	8	47416	47423	25 %	0 %	25 %	50 %	529974929
116	NC_021231	CCCA	2	8	47495	47502	25 %	0 %	0 %	75 %	529974929
117	NC_021231	CCAG	2	8	48253	48260	25 %	0 %	25 %	50 %	529974930
118	NC_021231	CGGT	2	8	48463	48470	0 %	25 %	50 %	25 %	529974930
119	NC_021231	TCTT	2	8	49770	49777	0 %	75 %	0 %	25 %	529974931
120	NC_021231	GGCG	2	8	49787	49794	0 %	0 %	75 %	25 %	529974931
121	NC_021231	CCGA	2	8	50157	50164	25 %	0 %	25 %	50 %	529974932
122	NC_021231	CCGG	2	8	50992	50999	0 %	0 %	50 %	50 %	529974933
123	NC_021231	CCGT	2	8	51440	51447	0 %	25 %	25 %	50 %	529974933
124	NC_021231	GCCC	2	8	51633	51640	0 %	0 %	25 %	75 %	529974933
125	NC_021231	CTGT	2	8	52161	52168	0 %	50 %	25 %	25 %	529974933
126	NC_021231	GTCC	2	8	52437	52444	0 %	25 %	25 %	50 %	529974933
127	NC_021231	CACG	2	8	54310	54317	25 %	0 %	25 %	50 %	529974933
128	NC_021231	CGTG	2	8	55058	55065	0 %	25 %	50 %	25 %	529974933
129	NC_021231	CCGT	2	8	55704	55711	0 %	25 %	25 %	50 %	529974933
130	NC_021231	GCCA	2	8	56198	56205	25 %	0 %	25 %	50 %	529974934
131	NC_021231	GCCG	2	8	56251	56258	0 %	0 %	50 %	50 %	529974934
132	NC_021231	CTGT	2	8	56549	56556	0 %	50 %	25 %	25 %	529974934
133	NC_021231	TTTC	2	8	56823	56830	0 %	75 %	0 %	25 %	529974934
134	NC_021231	CAGC	2	8	57253	57260	25 %	0 %	25 %	50 %	529974934
135	NC_021231	GGTC	2	8	57266	57273	0 %	25 %	50 %	25 %	529974934
136	NC_021231	GCAC	2	8	57767	57774	25 %	0 %	25 %	50 %	529974934
137	NC_021231	GCAG	2	8	58659	58666	25 %	0 %	50 %	25 %	529974935
138	NC_021231	TAAC	2	8	59055	59062	50 %	25 %	0 %	25 %	529974935
139	NC_021231	CGAT	2	8	59421	59428	25 %	25 %	25 %	25 %	529974936
140	NC_021231	CCAG	2	8	60003	60010	25 %	0 %	25 %	50 %	529974936
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.