MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis strain SB3432

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021231	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021231	TA	4	8	199	206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021231	TG	3	6	877	882	0 %	50 %	50 %	0 %	529974881
4	NC_021231	TG	3	6	1322	1327	0 %	50 %	50 %	0 %	529974881
5	NC_021231	AG	3	6	2040	2045	50 %	0 %	50 %	0 %	529974882
6	NC_021231	GA	3	6	2215	2220	50 %	0 %	50 %	0 %	529974882
7	NC_021231	CT	3	6	2629	2634	0 %	50 %	0 %	50 %	529974883
8	NC_021231	TG	3	6	3665	3670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021231	AG	3	6	5060	5065	50 %	0 %	50 %	0 %	529974885
10	NC_021231	CA	3	6	5109	5114	50 %	0 %	0 %	50 %	529974885
11	NC_021231	GC	4	8	6903	6910	0 %	0 %	50 %	50 %	529974886
12	NC_021231	GC	3	6	7811	7816	0 %	0 %	50 %	50 %	529974887
13	NC_021231	GC	3	6	8507	8512	0 %	0 %	50 %	50 %	529974887
14	NC_021231	GA	3	6	9061	9066	50 %	0 %	50 %	0 %	529974888
15	NC_021231	TC	3	6	9352	9357	0 %	50 %	0 %	50 %	529974888
16	NC_021231	CG	3	6	9764	9769	0 %	0 %	50 %	50 %	529974889
17	NC_021231	TG	3	6	9881	9886	0 %	50 %	50 %	0 %	529974889
18	NC_021231	GA	3	6	10095	10100	50 %	0 %	50 %	0 %	529974889
19	NC_021231	GC	3	6	11146	11151	0 %	0 %	50 %	50 %	529974890
20	NC_021231	AT	3	6	11263	11268	50 %	50 %	0 %	0 %	529974890
21	NC_021231	TA	3	6	11680	11685	50 %	50 %	0 %	0 %	529974891
22	NC_021231	GA	3	6	12149	12154	50 %	0 %	50 %	0 %	529974892
23	NC_021231	CA	3	6	12591	12596	50 %	0 %	0 %	50 %	529974893
24	NC_021231	GC	3	6	13593	13598	0 %	0 %	50 %	50 %	529974894
25	NC_021231	GT	3	6	13815	13820	0 %	50 %	50 %	0 %	529974894
26	NC_021231	GA	3	6	13822	13827	50 %	0 %	50 %	0 %	529974894
27	NC_021231	TG	3	6	13942	13947	0 %	50 %	50 %	0 %	529974894
28	NC_021231	CG	3	6	14009	14014	0 %	0 %	50 %	50 %	529974894
29	NC_021231	AG	4	8	14122	14129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021231	TC	3	6	14479	14484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021231	TG	3	6	15120	15125	0 %	50 %	50 %	0 %	529974895
32	NC_021231	GA	3	6	19219	19224	50 %	0 %	50 %	0 %	529974899
33	NC_021231	GC	3	6	19350	19355	0 %	0 %	50 %	50 %	529974899
34	NC_021231	AT	3	6	22315	22320	50 %	50 %	0 %	0 %	529974901
35	NC_021231	AT	3	6	22587	22592	50 %	50 %	0 %	0 %	529974901
36	NC_021231	CT	3	6	22665	22670	0 %	50 %	0 %	50 %	529974901
37	NC_021231	TA	3	6	23044	23049	50 %	50 %	0 %	0 %	529974901
38	NC_021231	TA	3	6	23663	23668	50 %	50 %	0 %	0 %	529974901
39	NC_021231	CT	3	6	24046	24051	0 %	50 %	0 %	50 %	529974901
40	NC_021231	CA	3	6	25239	25244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021231	TA	3	6	26133	26138	50 %	50 %	0 %	0 %	529974902
42	NC_021231	AC	3	6	26589	26594	50 %	0 %	0 %	50 %	529974903
43	NC_021231	CA	3	6	26981	26986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021231	GC	3	6	27959	27964	0 %	0 %	50 %	50 %	529974904
45	NC_021231	CG	3	6	28204	28209	0 %	0 %	50 %	50 %	529974904
46	NC_021231	TG	3	6	29581	29586	0 %	50 %	50 %	0 %	529974906
47	NC_021231	GT	3	6	31090	31095	0 %	50 %	50 %	0 %	529974910
48	NC_021231	GT	3	6	31651	31656	0 %	50 %	50 %	0 %	529974911
49	NC_021231	AT	3	6	31879	31884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021231	TA	5	10	31926	31935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021231	GT	3	6	32674	32679	0 %	50 %	50 %	0 %	529974912
52	NC_021231	AC	3	6	34576	34581	50 %	0 %	0 %	50 %	529974914
53	NC_021231	CA	3	6	34968	34973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021231	TG	4	8	35321	35328	0 %	50 %	50 %	0 %	529974915
55	NC_021231	CT	3	6	35709	35714	0 %	50 %	0 %	50 %	529974915
56	NC_021231	AT	4	8	36738	36745	50 %	50 %	0 %	0 %	529974917
57	NC_021231	AT	4	8	37857	37864	50 %	50 %	0 %	0 %	529974918
58	NC_021231	CT	3	6	38203	38208	0 %	50 %	0 %	50 %	529974918
59	NC_021231	CA	3	6	39129	39134	50 %	0 %	0 %	50 %	529974919
60	NC_021231	GC	3	6	40131	40136	0 %	0 %	50 %	50 %	529974920
61	NC_021231	GT	3	6	40353	40358	0 %	50 %	50 %	0 %	529974920
62	NC_021231	GA	3	6	40360	40365	50 %	0 %	50 %	0 %	529974920
63	NC_021231	TG	3	6	40480	40485	0 %	50 %	50 %	0 %	529974920
64	NC_021231	CG	3	6	40547	40552	0 %	0 %	50 %	50 %	529974920
65	NC_021231	AG	4	8	40660	40667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021231	GC	3	6	40979	40984	0 %	0 %	50 %	50 %	529974921
67	NC_021231	AT	3	6	41096	41101	50 %	50 %	0 %	0 %	529974921
68	NC_021231	TA	3	6	41514	41519	50 %	50 %	0 %	0 %	529974921
69	NC_021231	GA	3	6	41994	41999	50 %	0 %	50 %	0 %	529974922
70	NC_021231	GC	3	6	42775	42780	0 %	0 %	50 %	50 %	529974923
71	NC_021231	AG	3	6	43216	43221	50 %	0 %	50 %	0 %	529974923
72	NC_021231	CG	3	6	43389	43394	0 %	0 %	50 %	50 %	529974923
73	NC_021231	GT	3	6	43570	43575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021231	TG	3	6	44185	44190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021231	GC	3	6	44606	44611	0 %	0 %	50 %	50 %	529974924
76	NC_021231	CG	3	6	46195	46200	0 %	0 %	50 %	50 %	529974927
77	NC_021231	GC	3	6	46413	46418	0 %	0 %	50 %	50 %	529974927
78	NC_021231	GT	3	6	46982	46987	0 %	50 %	50 %	0 %	529974928
79	NC_021231	GT	3	6	50780	50785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021231	TA	3	6	50812	50817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021231	GC	3	6	52964	52969	0 %	0 %	50 %	50 %	529974933
82	NC_021231	CG	3	6	53000	53005	0 %	0 %	50 %	50 %	529974933
83	NC_021231	CG	3	6	53029	53034	0 %	0 %	50 %	50 %	529974933
84	NC_021231	GC	3	6	53621	53626	0 %	0 %	50 %	50 %	529974933
85	NC_021231	GT	3	6	53905	53910	0 %	50 %	50 %	0 %	529974933
86	NC_021231	AC	3	6	55027	55032	50 %	0 %	0 %	50 %	529974933
87	NC_021231	GA	3	6	55565	55570	50 %	0 %	50 %	0 %	529974933
88	NC_021231	GT	3	6	55617	55622	0 %	50 %	50 %	0 %	529974933
89	NC_021231	GC	3	6	57446	57451	0 %	0 %	50 %	50 %	529974934
90	NC_021231	AG	3	6	58865	58870	50 %	0 %	50 %	0 %	529974935
91	NC_021231	CA	3	6	58906	58911	50 %	0 %	0 %	50 %	529974935
92	NC_021231	AG	3	6	59094	59099	50 %	0 %	50 %	0 %	529974935
93	NC_021231	TA	3	6	60209	60214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021231	CT	3	6	61446	61451	0 %	50 %	0 %	50 %	529974938
95	NC_021231	GC	3	6	62080	62085	0 %	0 %	50 %	50 %	529974938
96	NC_021231	AG	3	6	62525	62530	50 %	0 %	50 %	0 %	529974938
97	NC_021231	CA	3	6	63215	63220	50 %	0 %	0 %	50 %	529974938
98	NC_021231	TA	3	6	65495	65500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021231	AC	3	6	66325	66330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021231	AG	3	6	67588	67593	50 %	0 %	50 %	0 %	529974944
101	NC_021231	AT	3	6	67681	67686	50 %	50 %	0 %	0 %	529974944
102	NC_021231	AC	3	6	67747	67752	50 %	0 %	0 %	50 %	529974945
103	NC_021231	AG	3	6	69663	69668	50 %	0 %	50 %	0 %	529974946
104	NC_021231	GC	3	6	70028	70033	0 %	0 %	50 %	50 %	529974947
105	NC_021231	TA	3	6	70154	70159	50 %	50 %	0 %	0 %	529974947
106	NC_021231	GA	3	6	70611	70616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021231	CA	3	6	71503	71508	50 %	0 %	0 %	50 %	529974948
108	NC_021231	GC	3	6	72725	72730	0 %	0 %	50 %	50 %	529974951
109	NC_021231	AG	3	6	72822	72827	50 %	0 %	50 %	0 %	529974951
110	NC_021231	GA	3	6	72946	72951	50 %	0 %	50 %	0 %	529974951
111	NC_021231	CG	3	6	73518	73523	0 %	0 %	50 %	50 %	529974952
112	NC_021231	AG	3	6	73683	73688	50 %	0 %	50 %	0 %	529974952
113	NC_021231	CA	3	6	74119	74124	50 %	0 %	0 %	50 %	529974952
114	NC_021231	AG	3	6	74547	74552	50 %	0 %	50 %	0 %	529974952
115	NC_021231	AC	3	6	74979	74984	50 %	0 %	0 %	50 %	529974952
116	NC_021231	AC	3	6	75992	75997	50 %	0 %	0 %	50 %	529974953
117	NC_021231	TA	3	6	76620	76625	50 %	50 %	0 %	0 %	529974954
118	NC_021231	TA	3	6	76990	76995	50 %	50 %	0 %	0 %	529974954
119	NC_021231	TA	3	6	77620	77625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021231	GA	3	6	77754	77759	50 %	0 %	50 %	0 %	529974957
121	NC_021231	TC	3	6	78218	78223	0 %	50 %	0 %	50 %	529974958
122	NC_021231	AT	3	6	78286	78291	50 %	50 %	0 %	0 %	529974958
123	NC_021231	GA	3	6	79175	79180	50 %	0 %	50 %	0 %	529974960
124	NC_021231	AT	3	6	80524	80529	50 %	50 %	0 %	0 %	529974961
125	NC_021231	GC	3	6	80775	80780	0 %	0 %	50 %	50 %	529974962
126	NC_021231	AT	3	6	82592	82597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021231	AT	3	6	83230	83235	50 %	50 %	0 %	0 %	529974967
128	NC_021231	GA	3	6	83461	83466	50 %	0 %	50 %	0 %	529974967
129	NC_021231	CA	3	6	83678	83683	50 %	0 %	0 %	50 %	529974967
130	NC_021231	AC	3	6	83872	83877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021231	AG	3	6	83999	84004	50 %	0 %	50 %	0 %	529974968
132	NC_021231	AT	4	8	84506	84513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021231	AT	3	6	85461	85466	50 %	50 %	0 %	0 %	529974970
134	NC_021231	GC	3	6	85831	85836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021231	CA	3	6	86851	86856	50 %	0 %	0 %	50 %	529974971
136	NC_021231	CA	3	6	87636	87641	50 %	0 %	0 %	50 %	529974973
137	NC_021231	TC	3	6	87923	87928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021231	GC	3	6	88005	88010	0 %	0 %	50 %	50 %	529974974
139	NC_021231	TC	3	6	88224	88229	0 %	50 %	0 %	50 %	529974974
140	NC_021231	TG	3	6	88356	88361	0 %	50 %	50 %	0 %	529974974
141	NC_021231	TC	3	6	88399	88404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021231	GA	3	6	88575	88580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021231	AC	3	6	88610	88615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021231	GC	3	6	89017	89022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021231	CG	3	6	90139	90144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021231	CA	3	6	90541	90546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.