MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp6

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021228	TTTA	2	8	45	52	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021228	TATT	2	8	333	340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021228	GAAT	2	8	704	711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021228	CTTT	2	8	1612	1619	0 %	75 %	0 %	25 %	501148318
5	NC_021228	AAAG	2	8	1809	1816	75 %	0 %	25 %	0 %	501148318
6	NC_021228	TCCA	2	8	1976	1983	25 %	25 %	0 %	50 %	501148318
7	NC_021228	CTTG	2	8	2234	2241	0 %	50 %	25 %	25 %	501148318
8	NC_021228	ACTG	2	8	2758	2765	25 %	25 %	25 %	25 %	501148318
9	NC_021228	AAAC	2	8	2900	2907	75 %	0 %	0 %	25 %	501148318
10	NC_021228	CATA	2	8	3321	3328	50 %	25 %	0 %	25 %	501148318
11	NC_021228	AATA	2	8	3665	3672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021228	TATC	2	8	3824	3831	25 %	50 %	0 %	25 %	501148319
13	NC_021228	ATAA	2	8	3835	3842	75 %	25 %	0 %	0 %	501148319
14	NC_021228	TTCC	2	8	4692	4699	0 %	50 %	0 %	50 %	501148321
15	NC_021228	ATTA	2	8	4775	4782	50 %	50 %	0 %	0 %	501148321
16	NC_021228	CAAG	2	8	4916	4923	50 %	0 %	25 %	25 %	501148321
17	NC_021228	CAAA	2	8	5266	5273	75 %	0 %	0 %	25 %	501148322
18	NC_021228	TTTC	2	8	5298	5305	0 %	75 %	0 %	25 %	501148322
19	NC_021228	TAAC	2	8	5329	5336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021228	TGCT	2	8	5434	5441	0 %	50 %	25 %	25 %	501148323
21	NC_021228	AACG	2	8	5952	5959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021228	AATT	2	8	6281	6288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021228	ATTT	2	8	6387	6394	25 %	75 %	0 %	0 %	501148324
24	NC_021228	CAAG	2	8	7190	7197	50 %	0 %	25 %	25 %	501148324
25	NC_021228	AAAG	2	8	7532	7539	75 %	0 %	25 %	0 %	501148325
26	NC_021228	ACAA	2	8	7585	7592	75 %	0 %	0 %	25 %	501148325
27	NC_021228	ACAA	2	8	7681	7688	75 %	0 %	0 %	25 %	501148325
28	NC_021228	CGAA	2	8	7991	7998	50 %	0 %	25 %	25 %	501148326
29	NC_021228	CATC	2	8	8437	8444	25 %	25 %	0 %	50 %	501148327
30	NC_021228	TTAT	2	8	8648	8655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.