MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp6

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021228	TAA	3	9	409	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021228	ACA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021228	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021228	CAA	2	6	682	687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021228	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021228	ATA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021228	TTA	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021228	GCG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148318
9	NC_021228	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148318
10	NC_021228	ACC	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148318
11	NC_021228	TCA	3	9	1213	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
12	NC_021228	TAA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
13	NC_021228	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
14	NC_021228	GTT	2	6	1305	1310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
15	NC_021228	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
16	NC_021228	TCT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
17	NC_021228	CAT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
18	NC_021228	AGT	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148318
19	NC_021228	GAA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148318
20	NC_021228	GTT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
21	NC_021228	CAG	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
22	NC_021228	TCT	2	6	1786	1791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
23	NC_021228	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
24	NC_021228	CAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
25	NC_021228	TAC	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148318
26	NC_021228	TTC	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148318
27	NC_021228	GCT	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148318
28	NC_021228	AGC	2	6	2430	2435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
29	NC_021228	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
30	NC_021228	CAG	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
31	NC_021228	AGG	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148318
32	NC_021228	AAT	2	6	2652	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
33	NC_021228	ATA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
34	NC_021228	TGT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
35	NC_021228	CCA	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148318
36	NC_021228	CAA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
37	NC_021228	ATA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148318
38	NC_021228	CAG	3	9	2996	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148318
39	NC_021228	TAG	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148318
40	NC_021228	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
41	NC_021228	AAC	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148318
42	NC_021228	TTA	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148318
43	NC_021228	TTG	2	6	3283	3288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
44	NC_021228	TGT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148318
45	NC_021228	CCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021228	ATT	2	6	3422	3427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021228	ATT	2	6	3505	3510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021228	TTG	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148319
49	NC_021228	TTG	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148319
50	NC_021228	TGT	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148320
51	NC_021228	TCA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148320
52	NC_021228	TAC	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148320
53	NC_021228	ATC	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021228	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021228	CAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148321
56	NC_021228	AAG	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148321
57	NC_021228	AAT	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148321
58	NC_021228	CGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148321
59	NC_021228	TGT	2	6	4641	4646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148321
60	NC_021228	GCT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148321
61	NC_021228	TTA	2	6	4865	4870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148321
62	NC_021228	GTT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021228	CTA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021228	TGG	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021228	GTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148322
66	NC_021228	AAC	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148322
67	NC_021228	AAT	2	6	5367	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021228	TGA	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148323
69	NC_021228	TGA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148323
70	NC_021228	AAG	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148323
71	NC_021228	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148323
72	NC_021228	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021228	TTA	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021228	GTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021228	ACT	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021228	AGG	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021228	ATT	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148324
78	NC_021228	AGA	2	6	6625	6630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
79	NC_021228	AGT	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148324
80	NC_021228	AGA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
81	NC_021228	AGA	2	6	6889	6894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
82	NC_021228	AAG	2	6	7200	7205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148324
83	NC_021228	TGA	2	6	7265	7270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148325
84	NC_021228	CAA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148325
85	NC_021228	TCA	2	6	7416	7421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148325
86	NC_021228	CAA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148325
87	NC_021228	GAT	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148325
88	NC_021228	GAC	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148325
89	NC_021228	CAA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148325
90	NC_021228	GAA	2	6	7599	7604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148325
91	NC_021228	ATA	2	6	7654	7659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148325
92	NC_021228	AAG	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148325
93	NC_021228	GTG	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148325
94	NC_021228	AGA	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021228	ATT	2	6	7860	7865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021228	TGG	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021228	ATT	2	6	8096	8101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148326
98	NC_021228	TCA	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148326
99	NC_021228	ATC	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148327
100	NC_021228	TCT	2	6	8155	8160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148327
101	NC_021228	GTT	2	6	8295	8300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148327
102	NC_021228	TTC	2	6	8423	8428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148327
103	NC_021228	TTA	2	6	8594	8599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.