MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp5

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021227	ATTA	2	8	443	450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021227	TAAA	2	8	899	906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021227	ATAA	2	8	1580	1587	75 %	25 %	0 %	0 %	501148293
4	NC_021227	ATTT	2	8	2097	2104	25 %	75 %	0 %	0 %	501148293
5	NC_021227	CCAT	2	8	2218	2225	25 %	25 %	0 %	50 %	501148293
6	NC_021227	ATAC	2	8	2248	2255	50 %	25 %	0 %	25 %	501148293
7	NC_021227	GAAA	2	8	2631	2638	75 %	0 %	25 %	0 %	501148293
8	NC_021227	TCAA	2	8	3049	3056	50 %	25 %	0 %	25 %	501148295
9	NC_021227	CTAT	2	8	3284	3291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021227	CTAT	2	8	3306	3313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021227	AGTT	2	8	3703	3710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021227	GCCA	2	8	4830	4837	25 %	0 %	25 %	50 %	501148305
13	NC_021227	AAAC	2	8	4969	4976	75 %	0 %	0 %	25 %	501148305
14	NC_021227	ATCG	2	8	5716	5723	25 %	25 %	25 %	25 %	501148305
15	NC_021227	CCGC	2	8	6173	6180	0 %	0 %	25 %	75 %	501148305
16	NC_021227	GCCG	2	8	6520	6527	0 %	0 %	50 %	50 %	501148305
17	NC_021227	TGGG	2	8	6830	6837	0 %	25 %	75 %	0 %	501148305
18	NC_021227	CGCC	2	8	7180	7187	0 %	0 %	25 %	75 %	501148305
19	NC_021227	AATT	2	8	7822	7829	50 %	50 %	0 %	0 %	501148307
20	NC_021227	CAGC	2	8	8327	8334	25 %	0 %	25 %	50 %	501148296
21	NC_021227	TTTG	2	8	8495	8502	0 %	75 %	25 %	0 %	501148296
22	NC_021227	CTGA	2	8	8520	8527	25 %	25 %	25 %	25 %	501148296
23	NC_021227	GTTG	2	8	8639	8646	0 %	50 %	50 %	0 %	501148296
24	NC_021227	GTTC	2	8	8789	8796	0 %	50 %	25 %	25 %	501148296
25	NC_021227	TGGT	2	8	8804	8811	0 %	50 %	50 %	0 %	501148296
26	NC_021227	TCAC	2	8	9817	9824	25 %	25 %	0 %	50 %	501148298
27	NC_021227	TTTG	2	8	9836	9843	0 %	75 %	25 %	0 %	501148298
28	NC_021227	GTTC	2	8	9896	9903	0 %	50 %	25 %	25 %	501148298
29	NC_021227	GGCA	2	8	10010	10017	25 %	0 %	50 %	25 %	501148298
30	NC_021227	TAAT	2	8	11230	11237	50 %	50 %	0 %	0 %	501148301
31	NC_021227	GGAA	2	8	11313	11320	50 %	0 %	50 %	0 %	501148301
32	NC_021227	TGAA	2	8	11431	11438	50 %	25 %	25 %	0 %	501148301
33	NC_021227	GTTT	2	8	11479	11486	0 %	75 %	25 %	0 %	501148301
34	NC_021227	TTAA	2	8	11920	11927	50 %	50 %	0 %	0 %	501148308
35	NC_021227	GATT	2	8	12692	12699	25 %	50 %	25 %	0 %	501148302
36	NC_021227	GTTT	2	8	12730	12737	0 %	75 %	25 %	0 %	501148302
37	NC_021227	ATTA	2	8	12935	12942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021227	TAAA	2	8	13147	13154	75 %	25 %	0 %	0 %	501148303
39	NC_021227	ATTA	2	8	13476	13483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021227	AATA	2	8	13601	13608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021227	GTCC	2	8	13780	13787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021227	GATA	2	8	14053	14060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021227	TGGT	2	8	14409	14416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021227	GTAG	2	8	14584	14591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021227	CAAG	2	8	14654	14661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021227	GGTT	2	8	14779	14786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021227	CACG	2	8	14801	14808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021227	GGGC	2	8	14809	14816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021227	AAAT	2	8	14875	14882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021227	TTAG	2	8	14925	14932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021227	AGTT	2	8	15089	15096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.