MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp5

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021227	TGG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021227	ATT	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021227	GTA	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021227	TGA	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021227	CCA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021227	CGT	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021227	CCA	2	6	558	563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021227	AAT	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021227	TAA	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021227	ATC	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021227	GTT	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148293
12	NC_021227	ATT	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148293
13	NC_021227	ATT	2	6	1214	1219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148293
14	NC_021227	TGA	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
15	NC_021227	AAT	2	6	1316	1321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
16	NC_021227	CTA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148293
17	NC_021227	GTC	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148293
18	NC_021227	AAT	2	6	1795	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
19	NC_021227	ATA	2	6	1856	1861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
20	NC_021227	ATA	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
21	NC_021227	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
22	NC_021227	TGA	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
23	NC_021227	GTT	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148293
24	NC_021227	GAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148293
25	NC_021227	AGT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
26	NC_021227	TAA	3	9	2649	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
27	NC_021227	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
28	NC_021227	TTA	2	6	2829	2834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148294
29	NC_021227	ACA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148294
30	NC_021227	TCA	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148294
31	NC_021227	CAA	2	6	2967	2972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021227	GAA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148295
33	NC_021227	TAC	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021227	ACT	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021227	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021227	TCT	2	6	3880	3885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021227	AAG	2	6	3904	3909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021227	CTG	3	9	3921	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021227	TGC	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021227	GCG	2	6	3958	3963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021227	ACC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021227	GCG	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021227	TCC	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021227	CGG	2	6	4244	4249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021227	GGA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021227	GGA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148305
47	NC_021227	CCA	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
48	NC_021227	GAA	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148305
49	NC_021227	GCC	2	6	4525	4530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
50	NC_021227	ATT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148305
51	NC_021227	CTT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148305
52	NC_021227	GGC	2	6	4671	4676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
53	NC_021227	CTG	3	9	4699	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
54	NC_021227	CAC	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
55	NC_021227	GTG	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
56	NC_021227	ACC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
57	NC_021227	TGA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
58	NC_021227	TGG	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
59	NC_021227	TGG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
60	NC_021227	CGG	2	6	5333	5338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
61	NC_021227	AAC	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148305
62	NC_021227	CCA	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
63	NC_021227	TGG	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
64	NC_021227	ATC	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
65	NC_021227	TGA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
66	NC_021227	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
67	NC_021227	GCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
68	NC_021227	CGA	3	9	5640	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
69	NC_021227	GCC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
70	NC_021227	ATG	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
71	NC_021227	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
72	NC_021227	CGA	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
73	NC_021227	AGC	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
74	NC_021227	CAT	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
75	NC_021227	CGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
76	NC_021227	ACC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
77	NC_021227	TGA	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
78	NC_021227	AGC	2	6	6239	6244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
79	NC_021227	AGC	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
80	NC_021227	GCT	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
81	NC_021227	CGC	2	6	6462	6467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
82	NC_021227	GAT	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
83	NC_021227	CAC	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
84	NC_021227	ACC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
85	NC_021227	GCT	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
86	NC_021227	TGA	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
87	NC_021227	GGC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
88	NC_021227	CAC	2	6	6648	6653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
89	NC_021227	ATG	2	6	6728	6733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
90	NC_021227	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
91	NC_021227	GCG	2	6	6881	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
92	NC_021227	TGC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
93	NC_021227	CGG	2	6	7022	7027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
94	NC_021227	CAT	2	6	7047	7052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
95	NC_021227	TTC	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148305
96	NC_021227	TGC	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
97	NC_021227	ATC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148306
98	NC_021227	CTA	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148306
99	NC_021227	AAG	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021227	TCT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148307
101	NC_021227	CAA	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148307
102	NC_021227	CAT	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148307
103	NC_021227	AAC	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148307
104	NC_021227	AGA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148307
105	NC_021227	AAT	2	6	8133	8138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021227	CTG	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
107	NC_021227	GTT	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
108	NC_021227	TGC	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
109	NC_021227	TGC	2	6	8603	8608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
110	NC_021227	GTT	2	6	8616	8621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
111	NC_021227	GTC	2	6	8626	8631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
112	NC_021227	TTG	2	6	8649	8654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
113	NC_021227	TGA	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148296
114	NC_021227	GTT	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
115	NC_021227	TTG	2	6	8775	8780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
116	NC_021227	TGT	2	6	8957	8962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148297
117	NC_021227	GTC	2	6	8968	8973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148297
118	NC_021227	GCT	2	6	9054	9059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148297
119	NC_021227	CTT	2	6	9318	9323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148297
120	NC_021227	TGG	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148297
121	NC_021227	GTT	2	6	9560	9565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148297
122	NC_021227	ATG	2	6	9636	9641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148298
123	NC_021227	TGA	2	6	9679	9684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148298
124	NC_021227	GCA	2	6	9706	9711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148298
125	NC_021227	CTT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148298
126	NC_021227	GTC	2	6	9865	9870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148298
127	NC_021227	TGA	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148298
128	NC_021227	CCT	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148298
129	NC_021227	GCT	2	6	10050	10055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148298
130	NC_021227	GTG	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148298
131	NC_021227	CAT	2	6	10240	10245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021227	CAG	2	6	10257	10262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021227	GCA	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021227	CTG	2	6	10342	10347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021227	TGG	2	6	10471	10476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148299
136	NC_021227	CTT	2	6	10525	10530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148299
137	NC_021227	TCC	2	6	10651	10656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148299
138	NC_021227	GTG	2	6	10697	10702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148299
139	NC_021227	CTT	2	6	10798	10803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148300
140	NC_021227	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148300
141	NC_021227	TAT	3	9	11020	11028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021227	TAT	2	6	11165	11170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148301
143	NC_021227	GTT	2	6	11568	11573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148301
144	NC_021227	TTG	2	6	11631	11636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148301
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154	NC_021227	AAC	2	6	12422	12427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021227	TCT	2	6	12563	12568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148302
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163	NC_021227	AGT	2	6	13056	13061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_021227	ATT	2	6	13513	13518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_021227	CAA	3	9	14233	14241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_021227	CTA	2	6	14252	14257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_021227	ACT	2	6	14274	14279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_021227	AAC	2	6	14994	14999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_021227	CAG	2	6	15786	15791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_021227	TAA	2	6	15821	15826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021227	CTA	2	6	16004	16009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.