MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	AAATT	2	10	512	521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021226	ACGCC	2	10	751	760	20 %	0 %	20 %	60 %	501145232
3	NC_021226	GATCA	2	10	2686	2695	40 %	20 %	20 %	20 %	501145233
4	NC_021226	AACTT	2	10	5955	5964	40 %	40 %	0 %	20 %	501145236
5	NC_021226	CATTT	2	10	6944	6953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021226	ATGTG	2	10	7970	7979	20 %	40 %	40 %	0 %	501145238
7	NC_021226	TTTTA	2	10	12071	12080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021226	GTCAA	2	10	14218	14227	40 %	20 %	20 %	20 %	501145245
9	NC_021226	GATTT	2	10	14718	14727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021226	GATTG	2	10	17115	17124	20 %	40 %	40 %	0 %	501145249
11	NC_021226	TATTG	2	10	17427	17436	20 %	60 %	20 %	0 %	501145249
12	NC_021226	ATGAT	2	10	18979	18988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021226	AAAAG	2	10	19260	19269	80 %	0 %	20 %	0 %	501145252
14	NC_021226	GCTAA	2	10	19693	19702	40 %	20 %	20 %	20 %	501145253
15	NC_021226	AAATC	2	10	20498	20507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021226	AAAAG	2	10	21043	21052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021226	AAAAT	2	10	21626	21635	80 %	20 %	0 %	0 %	501145256
18	NC_021226	AGCTT	2	10	24269	24278	20 %	40 %	20 %	20 %	501145259
19	NC_021226	AAATC	2	10	24683	24692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021226	TACCT	2	10	26985	26994	20 %	40 %	0 %	40 %	501145262
21	NC_021226	TGCTG	2	10	28646	28655	0 %	40 %	40 %	20 %	501145264
22	NC_021226	ACTTC	2	10	35580	35589	20 %	40 %	0 %	40 %	501145272
23	NC_021226	GGGAA	2	10	37887	37896	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021226	CCAAG	2	10	38559	38568	40 %	0 %	20 %	40 %	501145274
25	NC_021226	GATTT	2	10	38616	38625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.