MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	ACGCC	2	10	751	760	20 %	0 %	20 %	60 %	501145232
2	NC_021226	GATCA	2	10	2686	2695	40 %	20 %	20 %	20 %	501145233
3	NC_021226	AACTT	2	10	5955	5964	40 %	40 %	0 %	20 %	501145236
4	NC_021226	ATGTG	2	10	7970	7979	20 %	40 %	40 %	0 %	501145238
5	NC_021226	GTCAA	2	10	14218	14227	40 %	20 %	20 %	20 %	501145245
6	NC_021226	GATTG	2	10	17115	17124	20 %	40 %	40 %	0 %	501145249
7	NC_021226	TATTG	2	10	17427	17436	20 %	60 %	20 %	0 %	501145249
8	NC_021226	AAAAG	2	10	19260	19269	80 %	0 %	20 %	0 %	501145252
9	NC_021226	GCTAA	2	10	19693	19702	40 %	20 %	20 %	20 %	501145253
10	NC_021226	AAAAT	2	10	21626	21635	80 %	20 %	0 %	0 %	501145256
11	NC_021226	AGCTT	2	10	24269	24278	20 %	40 %	20 %	20 %	501145259
12	NC_021226	TACCT	2	10	26985	26994	20 %	40 %	0 %	40 %	501145262
13	NC_021226	TGCTG	2	10	28646	28655	0 %	40 %	40 %	20 %	501145264
14	NC_021226	ACTTC	2	10	35580	35589	20 %	40 %	0 %	40 %	501145272
15	NC_021226	CCAAG	2	10	38559	38568	40 %	0 %	20 %	40 %	501145274

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.