MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	ACGA	2	8	18	25	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021226	TAAT	2	8	467	474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021226	AATT	2	8	1430	1437	50 %	50 %	0 %	0 %	501145232
4	NC_021226	TTCA	2	8	1460	1467	25 %	50 %	0 %	25 %	501145232
5	NC_021226	TAAA	2	8	1605	1612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021226	TTCA	2	8	1945	1952	25 %	50 %	0 %	25 %	501145233
7	NC_021226	TTTA	2	8	2496	2503	25 %	75 %	0 %	0 %	501145233
8	NC_021226	TTGG	2	8	3729	3736	0 %	50 %	50 %	0 %	501145234
9	NC_021226	GAAA	2	8	3942	3949	75 %	0 %	25 %	0 %	501145234
10	NC_021226	TTTA	2	8	4583	4590	25 %	75 %	0 %	0 %	501145234
11	NC_021226	CGGC	2	8	4739	4746	0 %	0 %	50 %	50 %	501145234
12	NC_021226	ACCG	2	8	5287	5294	25 %	0 %	25 %	50 %	501145235
13	NC_021226	GCCG	2	8	5570	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021226	ATGA	2	8	5741	5748	50 %	25 %	25 %	0 %	501145236
15	NC_021226	ACTT	2	8	6233	6240	25 %	50 %	0 %	25 %	501145236
16	NC_021226	GCTG	2	8	7122	7129	0 %	25 %	50 %	25 %	501145237
17	NC_021226	AAGC	2	8	7205	7212	50 %	0 %	25 %	25 %	501145237
18	NC_021226	TTCG	2	8	7314	7321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021226	GCTA	2	8	7464	7471	25 %	25 %	25 %	25 %	501145238
20	NC_021226	GCAA	2	8	7506	7513	50 %	0 %	25 %	25 %	501145238
21	NC_021226	CCAA	2	8	7691	7698	50 %	0 %	0 %	50 %	501145238
22	NC_021226	GAAA	2	8	7752	7759	75 %	0 %	25 %	0 %	501145238
23	NC_021226	CTAA	2	8	8242	8249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021226	AAAG	2	8	8317	8324	75 %	0 %	25 %	0 %	501145239
25	NC_021226	TAAT	2	8	8788	8795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021226	CCAA	2	8	8850	8857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021226	TGGC	2	8	9201	9208	0 %	25 %	50 %	25 %	501145240
28	NC_021226	TAAA	2	8	9573	9580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021226	TTGG	2	8	9594	9601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021226	ATTT	2	8	9849	9856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021226	TTGG	2	8	9963	9970	0 %	50 %	50 %	0 %	501145241
32	NC_021226	CGAA	2	8	11135	11142	50 %	0 %	25 %	25 %	501145242
33	NC_021226	AATC	2	8	11514	11521	50 %	25 %	0 %	25 %	501145243
34	NC_021226	ATCG	2	8	11643	11650	25 %	25 %	25 %	25 %	501145243
35	NC_021226	ACTA	2	8	11714	11721	50 %	25 %	0 %	25 %	501145243
36	NC_021226	CAAC	2	8	13104	13111	50 %	0 %	0 %	50 %	501145244
37	NC_021226	GTAT	2	8	13112	13119	25 %	50 %	25 %	0 %	501145244
38	NC_021226	CACC	2	8	13690	13697	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021226	AACA	2	8	13958	13965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021226	CGAC	2	8	14084	14091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021226	GCTG	2	8	15893	15900	0 %	25 %	50 %	25 %	501145248
42	NC_021226	CGAA	2	8	16006	16013	50 %	0 %	25 %	25 %	501145248
43	NC_021226	ACTT	2	8	17038	17045	25 %	50 %	0 %	25 %	501145249
44	NC_021226	TCAG	2	8	17166	17173	25 %	25 %	25 %	25 %	501145249
45	NC_021226	TATG	2	8	17199	17206	25 %	50 %	25 %	0 %	501145249
46	NC_021226	ATTT	2	8	17393	17400	25 %	75 %	0 %	0 %	501145249
47	NC_021226	GTTA	2	8	17418	17425	25 %	50 %	25 %	0 %	501145249
48	NC_021226	TGGT	2	8	17957	17964	0 %	50 %	50 %	0 %	501145249
49	NC_021226	GGTT	2	8	18033	18040	0 %	50 %	50 %	0 %	501145249
50	NC_021226	CCAA	2	8	18060	18067	50 %	0 %	0 %	50 %	501145249
51	NC_021226	TAAT	2	8	18236	18243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021226	CCAG	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	501145250
53	NC_021226	CTAT	2	8	18746	18753	25 %	50 %	0 %	25 %	501145251
54	NC_021226	AACC	2	8	18996	19003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021226	GCCG	2	8	20776	20783	0 %	0 %	50 %	50 %	501145254
56	NC_021226	TAAG	2	8	21611	21618	50 %	25 %	25 %	0 %	501145256
57	NC_021226	AAAG	2	8	21721	21728	75 %	0 %	25 %	0 %	501145256
58	NC_021226	TGAC	2	8	22604	22611	25 %	25 %	25 %	25 %	501145259
59	NC_021226	AAAG	2	8	22830	22837	75 %	0 %	25 %	0 %	501145259
60	NC_021226	AGAA	2	8	22910	22917	75 %	0 %	25 %	0 %	501145259
61	NC_021226	TGGT	2	8	23143	23150	0 %	50 %	50 %	0 %	501145259
62	NC_021226	GAAA	2	8	23323	23330	75 %	0 %	25 %	0 %	501145259
63	NC_021226	TTAA	2	8	23554	23561	50 %	50 %	0 %	0 %	501145259
64	NC_021226	CTCA	2	8	23619	23626	25 %	25 %	0 %	50 %	501145259
65	NC_021226	TAAA	2	8	23645	23652	75 %	25 %	0 %	0 %	501145259
66	NC_021226	AATT	2	8	23726	23733	50 %	50 %	0 %	0 %	501145259
67	NC_021226	AACG	2	8	23779	23786	50 %	0 %	25 %	25 %	501145259
68	NC_021226	GCAA	2	8	24201	24208	50 %	0 %	25 %	25 %	501145259
69	NC_021226	TTAT	2	8	24255	24262	25 %	75 %	0 %	0 %	501145259
70	NC_021226	TTAG	2	8	25504	25511	25 %	50 %	25 %	0 %	501145261
71	NC_021226	TGAA	2	8	25804	25811	50 %	25 %	25 %	0 %	501145261
72	NC_021226	GAAT	2	8	26342	26349	50 %	25 %	25 %	0 %	501145262
73	NC_021226	GCCA	2	8	26728	26735	25 %	0 %	25 %	50 %	501145262
74	NC_021226	ATCA	2	8	27664	27671	50 %	25 %	0 %	25 %	501145262
75	NC_021226	AGCA	2	8	27677	27684	50 %	0 %	25 %	25 %	501145262
76	NC_021226	TAAA	2	8	27731	27738	75 %	25 %	0 %	0 %	501145262
77	NC_021226	TCAA	2	8	27998	28005	50 %	25 %	0 %	25 %	501145263
78	NC_021226	ATAC	2	8	28613	28620	50 %	25 %	0 %	25 %	501145264
79	NC_021226	ATTT	2	8	28812	28819	25 %	75 %	0 %	0 %	501145264
80	NC_021226	TTTG	2	8	28836	28843	0 %	75 %	25 %	0 %	501145264
81	NC_021226	CGAA	2	8	29302	29309	50 %	0 %	25 %	25 %	501145265
82	NC_021226	TAAA	2	8	29390	29397	75 %	25 %	0 %	0 %	501145265
83	NC_021226	TTTC	2	8	29449	29456	0 %	75 %	0 %	25 %	501145265
84	NC_021226	CTTT	2	8	29578	29585	0 %	75 %	0 %	25 %	501145265
85	NC_021226	CAAA	2	8	29678	29685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021226	CAAG	2	8	29765	29772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021226	ACAT	2	8	29922	29929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021226	AGTT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	25 %	0 %	501145266
89	NC_021226	TTTA	2	8	30992	30999	25 %	75 %	0 %	0 %	501145266
90	NC_021226	TGGC	2	8	31044	31051	0 %	25 %	50 %	25 %	501145266
91	NC_021226	AGTT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	25 %	0 %	501145266
92	NC_021226	TTGA	2	8	32333	32340	25 %	50 %	25 %	0 %	501145269
93	NC_021226	CCGA	2	8	33147	33154	25 %	0 %	25 %	50 %	501145270
94	NC_021226	TCGC	2	8	33169	33176	0 %	25 %	25 %	50 %	501145270
95	NC_021226	TCCA	2	8	33295	33302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021226	GAAA	2	8	33922	33929	75 %	0 %	25 %	0 %	501145271
97	NC_021226	CGTT	2	8	34236	34243	0 %	50 %	25 %	25 %	501145271
98	NC_021226	GATG	2	8	34819	34826	25 %	25 %	50 %	0 %	501145271
99	NC_021226	GATC	2	8	35143	35150	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
100	NC_021226	CAAA	2	8	35850	35857	75 %	0 %	0 %	25 %	501145272
101	NC_021226	GATC	2	8	36147	36154	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
102	NC_021226	CGAT	2	8	36462	36469	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
103	NC_021226	ATAA	2	8	36650	36657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021226	TTGA	2	8	37495	37502	25 %	50 %	25 %	0 %	501145273
105	NC_021226	TTGG	2	8	37849	37856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021226	AAAT	2	8	37907	37914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021226	AAAT	2	8	38104	38111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021226	AAAG	2	8	38196	38203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021226	CGGC	2	8	38443	38450	0 %	0 %	50 %	50 %	501145274

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.