MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	AATT	2	8	1430	1437	50 %	50 %	0 %	0 %	501145232
2	NC_021226	TTCA	2	8	1460	1467	25 %	50 %	0 %	25 %	501145232
3	NC_021226	TTCA	2	8	1945	1952	25 %	50 %	0 %	25 %	501145233
4	NC_021226	TTTA	2	8	2496	2503	25 %	75 %	0 %	0 %	501145233
5	NC_021226	TTGG	2	8	3729	3736	0 %	50 %	50 %	0 %	501145234
6	NC_021226	GAAA	2	8	3942	3949	75 %	0 %	25 %	0 %	501145234
7	NC_021226	TTTA	2	8	4583	4590	25 %	75 %	0 %	0 %	501145234
8	NC_021226	CGGC	2	8	4739	4746	0 %	0 %	50 %	50 %	501145234
9	NC_021226	ACCG	2	8	5287	5294	25 %	0 %	25 %	50 %	501145235
10	NC_021226	ATGA	2	8	5741	5748	50 %	25 %	25 %	0 %	501145236
11	NC_021226	ACTT	2	8	6233	6240	25 %	50 %	0 %	25 %	501145236
12	NC_021226	GCTG	2	8	7122	7129	0 %	25 %	50 %	25 %	501145237
13	NC_021226	AAGC	2	8	7205	7212	50 %	0 %	25 %	25 %	501145237
14	NC_021226	GCTA	2	8	7464	7471	25 %	25 %	25 %	25 %	501145238
15	NC_021226	GCAA	2	8	7506	7513	50 %	0 %	25 %	25 %	501145238
16	NC_021226	CCAA	2	8	7691	7698	50 %	0 %	0 %	50 %	501145238
17	NC_021226	GAAA	2	8	7752	7759	75 %	0 %	25 %	0 %	501145238
18	NC_021226	AAAG	2	8	8317	8324	75 %	0 %	25 %	0 %	501145239
19	NC_021226	TGGC	2	8	9201	9208	0 %	25 %	50 %	25 %	501145240
20	NC_021226	TTGG	2	8	9963	9970	0 %	50 %	50 %	0 %	501145241
21	NC_021226	CGAA	2	8	11135	11142	50 %	0 %	25 %	25 %	501145242
22	NC_021226	AATC	2	8	11514	11521	50 %	25 %	0 %	25 %	501145243
23	NC_021226	ATCG	2	8	11643	11650	25 %	25 %	25 %	25 %	501145243
24	NC_021226	ACTA	2	8	11714	11721	50 %	25 %	0 %	25 %	501145243
25	NC_021226	CAAC	2	8	13104	13111	50 %	0 %	0 %	50 %	501145244
26	NC_021226	GTAT	2	8	13112	13119	25 %	50 %	25 %	0 %	501145244
27	NC_021226	GCTG	2	8	15893	15900	0 %	25 %	50 %	25 %	501145248
28	NC_021226	CGAA	2	8	16006	16013	50 %	0 %	25 %	25 %	501145248
29	NC_021226	ACTT	2	8	17038	17045	25 %	50 %	0 %	25 %	501145249
30	NC_021226	TCAG	2	8	17166	17173	25 %	25 %	25 %	25 %	501145249
31	NC_021226	TATG	2	8	17199	17206	25 %	50 %	25 %	0 %	501145249
32	NC_021226	ATTT	2	8	17393	17400	25 %	75 %	0 %	0 %	501145249
33	NC_021226	GTTA	2	8	17418	17425	25 %	50 %	25 %	0 %	501145249
34	NC_021226	TGGT	2	8	17957	17964	0 %	50 %	50 %	0 %	501145249
35	NC_021226	GGTT	2	8	18033	18040	0 %	50 %	50 %	0 %	501145249
36	NC_021226	CCAA	2	8	18060	18067	50 %	0 %	0 %	50 %	501145249
37	NC_021226	CCAG	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	501145250
38	NC_021226	CTAT	2	8	18746	18753	25 %	50 %	0 %	25 %	501145251
39	NC_021226	GCCG	2	8	20776	20783	0 %	0 %	50 %	50 %	501145254
40	NC_021226	TAAG	2	8	21611	21618	50 %	25 %	25 %	0 %	501145256
41	NC_021226	AAAG	2	8	21721	21728	75 %	0 %	25 %	0 %	501145256
42	NC_021226	TGAC	2	8	22604	22611	25 %	25 %	25 %	25 %	501145259
43	NC_021226	AAAG	2	8	22830	22837	75 %	0 %	25 %	0 %	501145259
44	NC_021226	AGAA	2	8	22910	22917	75 %	0 %	25 %	0 %	501145259
45	NC_021226	TGGT	2	8	23143	23150	0 %	50 %	50 %	0 %	501145259
46	NC_021226	GAAA	2	8	23323	23330	75 %	0 %	25 %	0 %	501145259
47	NC_021226	TTAA	2	8	23554	23561	50 %	50 %	0 %	0 %	501145259
48	NC_021226	CTCA	2	8	23619	23626	25 %	25 %	0 %	50 %	501145259
49	NC_021226	TAAA	2	8	23645	23652	75 %	25 %	0 %	0 %	501145259
50	NC_021226	AATT	2	8	23726	23733	50 %	50 %	0 %	0 %	501145259
51	NC_021226	AACG	2	8	23779	23786	50 %	0 %	25 %	25 %	501145259
52	NC_021226	GCAA	2	8	24201	24208	50 %	0 %	25 %	25 %	501145259
53	NC_021226	TTAT	2	8	24255	24262	25 %	75 %	0 %	0 %	501145259
54	NC_021226	TTAG	2	8	25504	25511	25 %	50 %	25 %	0 %	501145261
55	NC_021226	TGAA	2	8	25804	25811	50 %	25 %	25 %	0 %	501145261
56	NC_021226	GAAT	2	8	26342	26349	50 %	25 %	25 %	0 %	501145262
57	NC_021226	GCCA	2	8	26728	26735	25 %	0 %	25 %	50 %	501145262
58	NC_021226	ATCA	2	8	27664	27671	50 %	25 %	0 %	25 %	501145262
59	NC_021226	AGCA	2	8	27677	27684	50 %	0 %	25 %	25 %	501145262
60	NC_021226	TAAA	2	8	27731	27738	75 %	25 %	0 %	0 %	501145262
61	NC_021226	TCAA	2	8	27998	28005	50 %	25 %	0 %	25 %	501145263
62	NC_021226	ATAC	2	8	28613	28620	50 %	25 %	0 %	25 %	501145264
63	NC_021226	ATTT	2	8	28812	28819	25 %	75 %	0 %	0 %	501145264
64	NC_021226	TTTG	2	8	28836	28843	0 %	75 %	25 %	0 %	501145264
65	NC_021226	CGAA	2	8	29302	29309	50 %	0 %	25 %	25 %	501145265
66	NC_021226	TAAA	2	8	29390	29397	75 %	25 %	0 %	0 %	501145265
67	NC_021226	TTTC	2	8	29449	29456	0 %	75 %	0 %	25 %	501145265
68	NC_021226	CTTT	2	8	29578	29585	0 %	75 %	0 %	25 %	501145265
69	NC_021226	AGTT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	25 %	0 %	501145266
70	NC_021226	TTTA	2	8	30992	30999	25 %	75 %	0 %	0 %	501145266
71	NC_021226	TGGC	2	8	31044	31051	0 %	25 %	50 %	25 %	501145266
72	NC_021226	AGTT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	25 %	0 %	501145266
73	NC_021226	TTGA	2	8	32333	32340	25 %	50 %	25 %	0 %	501145269
74	NC_021226	CCGA	2	8	33147	33154	25 %	0 %	25 %	50 %	501145270
75	NC_021226	TCGC	2	8	33169	33176	0 %	25 %	25 %	50 %	501145270
76	NC_021226	GAAA	2	8	33922	33929	75 %	0 %	25 %	0 %	501145271
77	NC_021226	CGTT	2	8	34236	34243	0 %	50 %	25 %	25 %	501145271
78	NC_021226	GATG	2	8	34819	34826	25 %	25 %	50 %	0 %	501145271
79	NC_021226	GATC	2	8	35143	35150	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
80	NC_021226	CAAA	2	8	35850	35857	75 %	0 %	0 %	25 %	501145272
81	NC_021226	GATC	2	8	36147	36154	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
82	NC_021226	CGAT	2	8	36462	36469	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
83	NC_021226	TTGA	2	8	37495	37502	25 %	50 %	25 %	0 %	501145273
84	NC_021226	CGGC	2	8	38443	38450	0 %	0 %	50 %	50 %	501145274

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.