MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	CT	3	6	738	743	0 %	50 %	0 %	50 %	501145232
2	NC_021226	GC	3	6	2330	2335	0 %	0 %	50 %	50 %	501145233
3	NC_021226	CT	3	6	8556	8561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021226	AC	3	6	9777	9782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021226	GT	3	6	10847	10852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021226	AT	3	6	10865	10870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021226	GT	3	6	12733	12738	0 %	50 %	50 %	0 %	501145244
8	NC_021226	AT	3	6	12932	12937	50 %	50 %	0 %	0 %	501145244
9	NC_021226	AT	3	6	13335	13340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021226	AG	3	6	14352	14357	50 %	0 %	50 %	0 %	501145246
11	NC_021226	TC	3	6	14798	14803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021226	TG	3	6	17066	17071	0 %	50 %	50 %	0 %	501145249
13	NC_021226	TC	3	6	17789	17794	0 %	50 %	0 %	50 %	501145249
14	NC_021226	AG	3	6	18200	18205	50 %	0 %	50 %	0 %	501145249
15	NC_021226	CT	3	6	19177	19182	0 %	50 %	0 %	50 %	501145252
16	NC_021226	TA	3	6	19536	19541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021226	AT	3	6	19562	19567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021226	GA	3	6	20422	20427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021226	TG	4	8	25037	25044	0 %	50 %	50 %	0 %	501145260
20	NC_021226	CA	3	6	27627	27632	50 %	0 %	0 %	50 %	501145262
21	NC_021226	GA	3	6	27772	27777	50 %	0 %	50 %	0 %	501145262
22	NC_021226	CT	3	6	27871	27876	0 %	50 %	0 %	50 %	501145263
23	NC_021226	GC	3	6	28498	28503	0 %	0 %	50 %	50 %	501145264
24	NC_021226	TA	3	6	29145	29150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021226	CT	3	6	29174	29179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021226	AC	3	6	29711	29716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021226	TG	3	6	31289	31294	0 %	50 %	50 %	0 %	501145267
28	NC_021226	AT	3	6	31343	31348	50 %	50 %	0 %	0 %	501145267
29	NC_021226	AT	3	6	31445	31450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021226	GC	3	6	31835	31840	0 %	0 %	50 %	50 %	501145268
31	NC_021226	AG	3	6	32462	32467	50 %	0 %	50 %	0 %	501145269
32	NC_021226	TC	3	6	32561	32566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021226	AT	3	6	32936	32941	50 %	50 %	0 %	0 %	501145270
34	NC_021226	GC	3	6	36997	37002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021226	AG	3	6	37624	37629	50 %	0 %	50 %	0 %	501145273
36	NC_021226	TC	3	6	37723	37728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021226	TA	3	6	38002	38007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021226	TC	3	6	38696	38701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.