MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021225	CCAAC	2	10	1404	1413	40 %	0 %	0 %	60 %	501148252
2	NC_021225	GATAT	2	10	3186	3195	40 %	40 %	20 %	0 %	501148253
3	NC_021225	TGCGT	2	10	3298	3307	0 %	40 %	40 %	20 %	501148253
4	NC_021225	TCAAA	2	10	5421	5430	60 %	20 %	0 %	20 %	501148254
5	NC_021225	CATGC	2	10	7010	7019	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021225	ATTTT	2	10	9311	9320	20 %	80 %	0 %	0 %	501148257
7	NC_021225	TATTC	2	10	9738	9747	20 %	60 %	0 %	20 %	501148257
8	NC_021225	TTCTA	2	10	9774	9783	20 %	60 %	0 %	20 %	501148257
9	NC_021225	TGATC	2	10	10729	10738	20 %	40 %	20 %	20 %	501148257
10	NC_021225	GTACG	2	10	10999	11008	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021225	ACTTG	2	10	11266	11275	20 %	40 %	20 %	20 %	501148258
12	NC_021225	GAGGC	2	10	11396	11405	20 %	0 %	60 %	20 %	501148258
13	NC_021225	GCTCG	2	10	12360	12369	0 %	20 %	40 %	40 %	501148259
14	NC_021225	TGGAA	2	10	13275	13284	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021225	TGATG	2	10	13528	13537	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021225	GATTG	2	10	16793	16802	20 %	40 %	40 %	0 %	501148260
17	NC_021225	GGACG	2	10	17350	17359	20 %	0 %	60 %	20 %	501148260
18	NC_021225	CCTCA	2	10	20198	20207	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_021225	AATTT	2	10	21332	21341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021225	AGAGA	2	10	22005	22014	60 %	0 %	40 %	0 %	501148264
21	NC_021225	CAATA	2	10	22905	22914	60 %	20 %	0 %	20 %	501148265
22	NC_021225	AAATG	2	10	23158	23167	60 %	20 %	20 %	0 %	501148265
23	NC_021225	GTTAA	2	10	24144	24153	40 %	40 %	20 %	0 %	501148266
24	NC_021225	AGAAT	2	10	26586	26595	60 %	20 %	20 %	0 %	501148269
25	NC_021225	TGCAA	2	10	26967	26976	40 %	20 %	20 %	20 %	501148270
26	NC_021225	TAATC	2	10	27315	27324	40 %	40 %	0 %	20 %	501148270
27	NC_021225	TATTC	2	10	28267	28276	20 %	60 %	0 %	20 %	501148270
28	NC_021225	ATGGT	2	10	28659	28668	20 %	40 %	40 %	0 %	501148270
29	NC_021225	TAATT	2	10	29411	29420	40 %	60 %	0 %	0 %	501148271
30	NC_021225	TGAAG	2	10	29697	29706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021225	CAAAT	2	10	30033	30042	60 %	20 %	0 %	20 %	501148272
32	NC_021225	CAGAT	2	10	30431	30440	40 %	20 %	20 %	20 %	501148272
33	NC_021225	TTAAA	2	10	34049	34058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021225	TCAAT	2	10	34246	34255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021225	TCATA	2	10	34476	34485	40 %	40 %	0 %	20 %	501148276
36	NC_021225	TCTTT	2	10	36668	36677	0 %	80 %	0 %	20 %	501148279
37	NC_021225	TAAGC	2	10	37635	37644	40 %	20 %	20 %	20 %	501148281
38	NC_021225	TGACA	2	10	38922	38931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021225	TTTTA	2	10	38991	39000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021225	ATGAC	2	10	39243	39252	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021225	TCGGA	2	10	42272	42281	20 %	20 %	40 %	20 %	501148289
42	NC_021225	TAAAA	2	10	43717	43726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021225	TATAA	2	10	43966	43975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021225	CCTCA	2	10	44235	44244	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_021225	AGTCA	2	10	44591	44600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021225	CGTGG	2	10	44873	44882	0 %	20 %	60 %	20 %	501148291
47	NC_021225	ATTAT	2	10	45397	45406	40 %	60 %	0 %	0 %	501148291
48	NC_021225	CGTGT	2	10	46428	46437	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.