MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp2

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021225	CTTG	2	8	397	404	0 %	50 %	25 %	25 %	501148250
2	NC_021225	ATAG	2	8	646	653	50 %	25 %	25 %	0 %	501148250
3	NC_021225	CGAT	2	8	744	751	25 %	25 %	25 %	25 %	501148251
4	NC_021225	TTGA	2	8	1043	1050	25 %	50 %	25 %	0 %	501148251
5	NC_021225	TACT	2	8	1862	1869	25 %	50 %	0 %	25 %	501148252
6	NC_021225	TCAA	2	8	1892	1899	50 %	25 %	0 %	25 %	501148252
7	NC_021225	GGTT	2	8	1950	1957	0 %	50 %	50 %	0 %	501148252
8	NC_021225	AGTT	2	8	2737	2744	25 %	50 %	25 %	0 %	501148252
9	NC_021225	TGTT	2	8	2803	2810	0 %	75 %	25 %	0 %	501148252
10	NC_021225	AGAA	2	8	2821	2828	75 %	0 %	25 %	0 %	501148252
11	NC_021225	ACAA	2	8	2931	2938	75 %	0 %	0 %	25 %	501148252
12	NC_021225	AATT	2	8	3132	3139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021225	AATG	2	8	3146	3153	50 %	25 %	25 %	0 %	501148253
14	NC_021225	TGGT	2	8	3819	3826	0 %	50 %	50 %	0 %	501148253
15	NC_021225	CGCC	2	8	3930	3937	0 %	0 %	25 %	75 %	501148253
16	NC_021225	TTGG	2	8	4382	4389	0 %	50 %	50 %	0 %	501148254
17	NC_021225	TTGA	2	8	5626	5633	25 %	50 %	25 %	0 %	501148254
18	NC_021225	ATAA	2	8	5988	5995	75 %	25 %	0 %	0 %	501148254
19	NC_021225	AATT	2	8	6547	6554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021225	ATCA	2	8	7923	7930	50 %	25 %	0 %	25 %	501148256
21	NC_021225	TGAT	2	8	8250	8257	25 %	50 %	25 %	0 %	501148256
22	NC_021225	ACTG	2	8	8464	8471	25 %	25 %	25 %	25 %	501148256
23	NC_021225	TCAA	2	8	8586	8593	50 %	25 %	0 %	25 %	501148256
24	NC_021225	GCAA	2	8	8850	8857	50 %	0 %	25 %	25 %	501148256
25	NC_021225	AATA	2	8	8894	8901	75 %	25 %	0 %	0 %	501148256
26	NC_021225	TATT	2	8	9339	9346	25 %	75 %	0 %	0 %	501148257
27	NC_021225	GGCT	2	8	9554	9561	0 %	25 %	50 %	25 %	501148257
28	NC_021225	CAAA	2	8	9658	9665	75 %	0 %	0 %	25 %	501148257
29	NC_021225	CAAC	2	8	9762	9769	50 %	0 %	0 %	50 %	501148257
30	NC_021225	CTTT	2	8	10770	10777	0 %	75 %	0 %	25 %	501148257
31	NC_021225	CATT	2	8	10977	10984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021225	TAAA	2	8	11511	11518	75 %	25 %	0 %	0 %	501148258
33	NC_021225	AAAG	2	8	11710	11717	75 %	0 %	25 %	0 %	501148259
34	NC_021225	AACT	2	8	12087	12094	50 %	25 %	0 %	25 %	501148259
35	NC_021225	TGGT	2	8	12854	12861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021225	TGAG	2	8	12974	12981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021225	GCTA	2	8	13439	13446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021225	GGCT	2	8	14002	14009	0 %	25 %	50 %	25 %	501148260
39	NC_021225	TGAC	2	8	14403	14410	25 %	25 %	25 %	25 %	501148260
40	NC_021225	ACGT	2	8	14474	14481	25 %	25 %	25 %	25 %	501148260
41	NC_021225	TGGC	2	8	15180	15187	0 %	25 %	50 %	25 %	501148260
42	NC_021225	CGCT	2	8	15624	15631	0 %	25 %	25 %	50 %	501148260
43	NC_021225	GGGT	2	8	15832	15839	0 %	25 %	75 %	0 %	501148260
44	NC_021225	GGTA	2	8	16253	16260	25 %	25 %	50 %	0 %	501148260
45	NC_021225	CGAC	2	8	16809	16816	25 %	0 %	25 %	50 %	501148260
46	NC_021225	CTGG	2	8	17666	17673	0 %	25 %	50 %	25 %	501148260
47	NC_021225	CAGG	2	8	18011	18018	25 %	0 %	50 %	25 %	501148260
48	NC_021225	CTGG	2	8	18146	18153	0 %	25 %	50 %	25 %	501148260
49	NC_021225	GGCA	2	8	18378	18385	25 %	0 %	50 %	25 %	501148261
50	NC_021225	ATTG	2	8	18520	18527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021225	AAGA	2	8	19071	19078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021225	TAGA	2	8	19121	19128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021225	AAAC	2	8	19218	19225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021225	GACC	2	8	19632	19639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021225	CAGG	2	8	19762	19769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021225	ACTT	2	8	19898	19905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021225	TAAT	2	8	21274	21281	50 %	50 %	0 %	0 %	501148262
58	NC_021225	AAAT	2	8	21837	21844	75 %	25 %	0 %	0 %	501148264
59	NC_021225	AATG	2	8	21931	21938	50 %	25 %	25 %	0 %	501148264
60	NC_021225	CTAG	2	8	22869	22876	25 %	25 %	25 %	25 %	501148265
61	NC_021225	TAAA	2	8	23196	23203	75 %	25 %	0 %	0 %	501148266
62	NC_021225	AAGT	2	8	23871	23878	50 %	25 %	25 %	0 %	501148266
63	NC_021225	TTCA	2	8	24362	24369	25 %	50 %	0 %	25 %	501148266
64	NC_021225	ATAG	2	8	24658	24665	50 %	25 %	25 %	0 %	501148267
65	NC_021225	TTAG	2	8	25399	25406	25 %	50 %	25 %	0 %	501148268
66	NC_021225	CGAT	2	8	25471	25478	25 %	25 %	25 %	25 %	501148268
67	NC_021225	GATT	2	8	25600	25607	25 %	50 %	25 %	0 %	501148268
68	NC_021225	TTCG	2	8	25979	25986	0 %	50 %	25 %	25 %	501148268
69	NC_021225	GCAA	2	8	26742	26749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021225	ATTG	2	8	26853	26860	25 %	50 %	25 %	0 %	501148270
71	NC_021225	GATC	2	8	26906	26913	25 %	25 %	25 %	25 %	501148270
72	NC_021225	GAAA	2	8	28122	28129	75 %	0 %	25 %	0 %	501148270
73	NC_021225	GACA	2	8	28279	28286	50 %	0 %	25 %	25 %	501148270
74	NC_021225	TAGA	2	8	28598	28605	50 %	25 %	25 %	0 %	501148270
75	NC_021225	GATT	2	8	28607	28614	25 %	50 %	25 %	0 %	501148270
76	NC_021225	GGCG	2	8	28615	28622	0 %	0 %	75 %	25 %	501148270
77	NC_021225	TTAT	2	8	28705	28712	25 %	75 %	0 %	0 %	501148270
78	NC_021225	TAAG	2	8	28769	28776	50 %	25 %	25 %	0 %	501148270
79	NC_021225	GATT	2	8	29398	29405	25 %	50 %	25 %	0 %	501148271
80	NC_021225	TAAA	2	8	29643	29650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021225	TAAT	2	8	29766	29773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021225	GAAC	2	8	29879	29886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021225	TAAG	2	8	29968	29975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021225	ACGC	2	8	30508	30515	25 %	0 %	25 %	50 %	501148272
85	NC_021225	ATTT	2	8	30557	30564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021225	AGTT	2	8	30787	30794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021225	GATG	2	8	30863	30870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021225	TCGC	2	8	31290	31297	0 %	25 %	25 %	50 %	501148273
89	NC_021225	TAGA	2	8	32119	32126	50 %	25 %	25 %	0 %	501148274
90	NC_021225	GACA	2	8	32831	32838	50 %	0 %	25 %	25 %	501148274
91	NC_021225	TGAT	2	8	33795	33802	25 %	50 %	25 %	0 %	501148275
92	NC_021225	CAAA	2	8	34024	34031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021225	GAAA	2	8	35092	35099	75 %	0 %	25 %	0 %	501148277
94	NC_021225	AAAT	2	8	35306	35313	75 %	25 %	0 %	0 %	501148277
95	NC_021225	TGAT	2	8	35559	35566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021225	GGTA	2	8	36301	36308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021225	AACT	2	8	36458	36465	50 %	25 %	0 %	25 %	501148278
98	NC_021225	CTGA	2	8	36557	36564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021225	TCAT	2	8	36793	36800	25 %	50 %	0 %	25 %	501148279
100	NC_021225	ATAA	2	8	36879	36886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021225	GGAC	2	8	37433	37440	25 %	0 %	50 %	25 %	501148281
102	NC_021225	TCAA	2	8	37570	37577	50 %	25 %	0 %	25 %	501148281
103	NC_021225	AGTT	2	8	37677	37684	25 %	50 %	25 %	0 %	501148281
104	NC_021225	TGGT	2	8	38470	38477	0 %	50 %	50 %	0 %	501148282
105	NC_021225	CTAG	2	8	38546	38553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021225	AATA	3	12	38658	38669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021225	AGCT	2	8	39206	39213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021225	CGAT	2	8	39942	39949	25 %	25 %	25 %	25 %	501148285
109	NC_021225	GATT	2	8	40071	40078	25 %	50 %	25 %	0 %	501148285
110	NC_021225	TTCG	2	8	40450	40457	0 %	50 %	25 %	25 %	501148285
111	NC_021225	AATT	2	8	40729	40736	50 %	50 %	0 %	0 %	501148286
112	NC_021225	TTGA	2	8	40806	40813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021225	TATT	2	8	40880	40887	25 %	75 %	0 %	0 %	501148287
114	NC_021225	TCGA	2	8	40966	40973	25 %	25 %	25 %	25 %	501148287
115	NC_021225	GATT	2	8	41183	41190	25 %	50 %	25 %	0 %	501148288
116	NC_021225	AAAG	2	8	41866	41873	75 %	0 %	25 %	0 %	501148289
117	NC_021225	AGAA	2	8	41946	41953	75 %	0 %	25 %	0 %	501148289
118	NC_021225	CGCA	2	8	42039	42046	25 %	0 %	25 %	50 %	501148289
119	NC_021225	GCAA	2	8	42132	42139	50 %	0 %	25 %	25 %	501148289
120	NC_021225	AGTT	2	8	42897	42904	25 %	50 %	25 %	0 %	501148289
121	NC_021225	AAGC	2	8	43475	43482	50 %	0 %	25 %	25 %	501148289
122	NC_021225	ATTA	2	8	43505	43512	50 %	50 %	0 %	0 %	501148289
123	NC_021225	AGCA	2	8	43782	43789	50 %	0 %	25 %	25 %	501148290
124	NC_021225	AGCA	2	8	44410	44417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021225	CTTA	2	8	44644	44651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021225	CTGA	2	8	45323	45330	25 %	25 %	25 %	25 %	501148291
127	NC_021225	AACT	2	8	45360	45367	50 %	25 %	0 %	25 %	501148291
128	NC_021225	GTCG	2	8	45458	45465	0 %	25 %	50 %	25 %	501148291
129	NC_021225	TAAA	2	8	46317	46324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021225	TTTG	2	8	46497	46504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.