MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp2

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021225	AATT	2	8	3132	3139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021225	AATT	2	8	6547	6554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021225	CATT	2	8	10977	10984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021225	TGGT	2	8	12854	12861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021225	TGAG	2	8	12974	12981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021225	GCTA	2	8	13439	13446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021225	ATTG	2	8	18520	18527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021225	AAGA	2	8	19071	19078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021225	TAGA	2	8	19121	19128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021225	AAAC	2	8	19218	19225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021225	GACC	2	8	19632	19639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021225	CAGG	2	8	19762	19769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021225	ACTT	2	8	19898	19905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021225	GCAA	2	8	26742	26749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021225	TAAA	2	8	29643	29650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021225	TAAT	2	8	29766	29773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021225	GAAC	2	8	29879	29886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021225	TAAG	2	8	29968	29975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021225	ATTT	2	8	30557	30564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021225	AGTT	2	8	30787	30794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021225	GATG	2	8	30863	30870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021225	CAAA	2	8	34024	34031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021225	TGAT	2	8	35559	35566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021225	GGTA	2	8	36301	36308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021225	CTGA	2	8	36557	36564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021225	ATAA	2	8	36879	36886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021225	CTAG	2	8	38546	38553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021225	AATA	3	12	38658	38669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021225	AGCT	2	8	39206	39213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021225	TTGA	2	8	40806	40813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021225	AGCA	2	8	44410	44417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021225	CTTA	2	8	44644	44651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021225	TAAA	2	8	46317	46324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021225	TTTG	2	8	46497	46504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.