MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp2

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021225	CG	3	6	1066	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	501148251
2	NC_021225	AG	3	6	2768	2773	50 %	0 %	50 %	0 %	501148252
3	NC_021225	GT	3	6	3386	3391	0 %	50 %	50 %	0 %	501148253
4	NC_021225	AG	3	6	3748	3753	50 %	0 %	50 %	0 %	501148253
5	NC_021225	AT	3	6	4358	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	501148254
6	NC_021225	GT	3	6	4473	4478	0 %	50 %	50 %	0 %	501148254
7	NC_021225	GC	3	6	4853	4858	0 %	0 %	50 %	50 %	501148254
8	NC_021225	AG	3	6	8738	8743	50 %	0 %	50 %	0 %	501148256
9	NC_021225	CA	3	6	10800	10805	50 %	0 %	0 %	50 %	501148257
10	NC_021225	GT	3	6	13035	13040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021225	TA	3	6	13707	13712	50 %	50 %	0 %	0 %	501148260
12	NC_021225	CA	3	6	13786	13791	50 %	0 %	0 %	50 %	501148260
13	NC_021225	CA	3	6	17043	17048	50 %	0 %	0 %	50 %	501148260
14	NC_021225	GC	3	6	17125	17130	0 %	0 %	50 %	50 %	501148260
15	NC_021225	AC	3	6	18095	18100	50 %	0 %	0 %	50 %	501148260
16	NC_021225	GC	3	6	18279	18284	0 %	0 %	50 %	50 %	501148261
17	NC_021225	CT	3	6	18297	18302	0 %	50 %	0 %	50 %	501148261
18	NC_021225	CT	3	6	18877	18882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021225	AT	3	6	19240	19245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021225	TC	3	6	22217	22222	0 %	50 %	0 %	50 %	501148264
21	NC_021225	AT	3	6	24532	24537	50 %	50 %	0 %	0 %	501148267
22	NC_021225	GA	3	6	24948	24953	50 %	0 %	50 %	0 %	501148267
23	NC_021225	TA	3	6	26255	26260	50 %	50 %	0 %	0 %	501148269
24	NC_021225	TA	3	6	27509	27514	50 %	50 %	0 %	0 %	501148270
25	NC_021225	CT	3	6	28165	28170	0 %	50 %	0 %	50 %	501148270
26	NC_021225	AT	3	6	29819	29824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021225	GA	3	6	29976	29981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021225	CG	3	6	30195	30200	0 %	0 %	50 %	50 %	501148272
29	NC_021225	CA	3	6	30352	30357	50 %	0 %	0 %	50 %	501148272
30	NC_021225	TA	3	6	30693	30698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021225	TA	3	6	33223	33228	50 %	50 %	0 %	0 %	501148275
32	NC_021225	TA	4	8	33818	33825	50 %	50 %	0 %	0 %	501148275
33	NC_021225	AC	3	6	33988	33993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021225	AT	3	6	34561	34566	50 %	50 %	0 %	0 %	501148276
35	NC_021225	AG	3	6	34764	34769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021225	TA	3	6	35227	35232	50 %	50 %	0 %	0 %	501148277
37	NC_021225	AT	3	6	35373	35378	50 %	50 %	0 %	0 %	501148277
38	NC_021225	AG	3	6	35474	35479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021225	AC	3	6	35736	35741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021225	AG	3	6	36003	36008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021225	TG	3	6	39027	39032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021225	AC	3	6	42490	42495	50 %	0 %	0 %	50 %	501148289

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.