MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Saccharimonas aalborgensis

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021219	GTTGT	2	10	315	324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021219	GTGTT	2	10	26915	26924	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021219	ACGCC	2	10	26978	26987	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_021219	AAATG	2	10	38065	38074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021219	CGGGG	2	10	41361	41370	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021219	ATATA	2	10	44524	44533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021219	ATTCC	2	10	101831	101840	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021219	AAAGT	2	10	126595	126604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021219	TGTAA	2	10	128872	128881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021219	TATGG	2	10	129786	129795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021219	TATAC	2	10	140595	140604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021219	TTTCT	2	10	150987	150996	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021219	AACTT	2	10	159827	159836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021219	GGCCA	2	10	171069	171078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021219	ATATA	2	10	173801	173810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021219	GTCTT	2	10	193332	193341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021219	CCATG	2	10	197639	197648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021219	TCTTT	2	10	198284	198293	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021219	TATTG	2	10	202241	202250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021219	ACATA	2	10	202946	202955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021219	GCGGG	2	10	220751	220760	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021219	TCATT	2	10	230500	230509	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021219	TATCA	2	10	233454	233463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021219	CGGTA	2	10	249924	249933	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021219	TCTCT	2	10	256858	256867	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021219	TTGTT	2	10	258446	258455	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021219	CATAA	2	10	298320	298329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021219	TAAAA	2	10	300977	300986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021219	TACAA	2	10	369740	369749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021219	TTAGC	2	10	378879	378888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021219	TACCC	2	10	382602	382611	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_021219	TATCA	2	10	438142	438151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021219	GTTTT	2	10	449507	449516	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021219	TTTCT	2	10	454727	454736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021219	AGAAA	2	10	485592	485601	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021219	TTTTA	2	10	512691	512700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021219	ATTGC	2	10	544609	544618	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021219	TACCA	2	10	548579	548588	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021219	GGTGA	2	10	568374	568383	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021219	CAACT	2	10	583505	583514	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021219	CTATA	2	10	585173	585182	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021219	TATAC	2	10	604158	604167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021219	TAAGA	2	10	669153	669162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021219	TCGTG	2	10	692080	692089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021219	GTCAG	2	10	692188	692197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021219	TTAAA	2	10	692687	692696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021219	GTACT	2	10	693005	693014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021219	AACTG	2	10	694877	694886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021219	GGGAG	2	10	695333	695342	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021219	TCGAG	2	10	696431	696440	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021219	AGATT	2	10	697784	697793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021219	GAAAA	2	10	698296	698305	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021219	TTTTC	2	10	698310	698319	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021219	GCAAA	2	10	698345	698354	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021219	GCTAT	2	10	720871	720880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021219	CGACA	2	10	725510	725519	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021219	GTATA	2	10	773851	773860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021219	TTATG	2	10	797976	797985	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021219	AACAA	2	10	798009	798018	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021219	AACAC	2	10	798923	798932	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021219	TACTG	2	10	821594	821603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021219	GAAAA	2	10	825377	825386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021219	GAATT	2	10	847506	847515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021219	GCTGT	2	10	847576	847585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021219	ATAGT	2	10	848978	848987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021219	TGACC	2	10	881467	881476	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021219	CGACC	2	10	882356	882365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_021219	ATATA	2	10	889069	889078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021219	GAAAA	2	10	914308	914317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021219	GTCGG	2	10	914492	914501	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021219	CCGAC	2	10	915574	915583	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_021219	CAAAT	2	10	916652	916661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021219	AACCG	2	10	916972	916981	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_021219	GCAAG	2	10	917137	917146	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021219	GCCGA	2	10	917345	917354	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021219	TGGTG	2	10	917885	917894	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021219	ATATA	2	10	927554	927563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021219	CCCGA	2	10	927688	927697	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_021219	GCTTC	2	10	933982	933991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021219	AACAA	2	10	935548	935557	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021219	CCTCC	2	10	950118	950127	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_021219	TATAC	2	10	952313	952322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021219	AACAA	2	10	956007	956016	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021219	ACGCA	2	10	972747	972756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021219	AGTCA	2	10	982328	982337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021219	CCTTT	2	10	982840	982849	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021219	CGATC	2	10	985008	985017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_021219	TATAT	2	10	995341	995350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021219	CGCGC	2	10	1005328	1005337	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.